所有药学人的福利，网药可以这么做！复旦大学团队6.6分点睛之作，NHANES数据库+西医药理研究，老树开新花~- 大数跨境

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所有药学人的福利，网药可以这么做！复旦大学团队6.6分点睛之作，NHANES数据库+西医药理研究，老树开新花~

生信日报

2024-06-24

“网络药理学”作为一个交叉创新的结晶，已成为传统中药研究领域的前沿和热点。

因此，网药基本都是以中医药靶点预测为主，那么对于已经上市的西药，很少见到有团队研究其药物机制。其实不论是中草药，还是西药物都具有多成分、多靶点、多通路的协同调控作用，通过充分发掘和利用公共数据、利用生物信息学技术可以让药物机制研究更容易！

这不，今儿个小记者就发现了一篇热乎的、来自复旦大学团队利用网药分析探究西药药理机制的文章，一起来看看吧！那么这篇文章都有哪些亮点可以使其发表于6分+的期刊呢？且听小记者细细道来~

西医药理的“老树开新花”：很多药物的临床应用非常广，研究意义重大。但同时，其靶点可能是已知的。那么这类药物如何创新研究了。实际上，很多药物都是多靶点、多通路的协同调控作用。通过网药分析，可以对其机制进行进入挖掘。

NHANES数据库分析：使用了来自NHANES 2007年-2016年9508名成年人的临床数据，样本规模庞大，数据类型完整，保证了研究的可靠性和代表性。

网络药理学分析：运用网络药理学方法研究孟鲁司特与抑郁症之间的关联，结合多个数据库进行药理靶点筛选和蛋白质相互作用网络构建，探究孟鲁司特在抑郁症治疗中的药理机制。不难发现，这篇文章的框架非常简单！就是先基于数据库进行了临床关联分析，再找到药物和疾病的交叉靶点，构建网络，进行网络拓扑分析和富集分析！选题得当联合巧妙运用生信工具实现1＋1＞2！(ps：经典思路超好复现！可操作性很强！如果想要了解数据挖掘或是对数据库和生信工具不知该如何而下手的朋友们快来联系小记者，坐等你的联系哦~)。

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l题目：孟鲁司特对抑郁症的关联和机制：临床和网络药理学研究相结合

l杂志：J Affect Disord

l影响因子：IF=6.6

l发表时间：2024年5月

（友情提示：文末可获取文献的链接哦）

研究背景

Researcher

孟鲁司特的使用与抑郁症风险增加有关，但观察性研究的结果并不一致。因此，该研究的目标是评估孟鲁司特暴露是否与抑郁症有关，并阐明可能的分子机制。

数据来源

Researcher

数据集/队列	数据库	数据类型	详细信息
人口统计和医疗史信息	NHANES	人口统计和医疗史信息	2007年-2016年9508名成年人的人口统计和医疗史信息
孟鲁司特的药理学靶点	SwissTargetPrediction、DrugBank	Target	104个
抑郁症的靶点	DisGeNET、Drugbank、GeneCards	Target	3898个

研究思路

Researcher

研究通过分析NHANES数据中的抑郁症状况、孟鲁司特使用情况以及其他相关因素来评估抑郁症与孟鲁司特之间的关系。同时，采用网络药理学研究方法，探讨孟鲁司特在抑郁症治疗中的药理机制和有效性。

主要结果

Researcher

1.参与者的特征

20.1%的参与者被分类为抑郁症患者，抑郁症患病率在孟鲁司特暴露组（37.4%）高于未暴露组（19.5%）。

图1 NHANES样本选择流程图

2.经调整的逻辑回归分析结果

在研究中构建了三个模型来分析孟鲁司特使用对抑郁症的独立影响。结果显示孟鲁司特使用与抑郁症之间存在显著关联，且在考虑混杂因素后，这种关联仍然存在，但效应大小有所减弱。

3.靶标和PPI网络的详细数据

使用Drugbank和Swiss Target Prediction数据库筛选已报道的蒙鲁司特药理靶点。使用Drugbank、DisGeNET和GeneCards数据库获得抑郁症的病理靶标。通过Venn图确定了69个孟鲁司特和抑郁症的交集靶点，并使用STRING数据库获取了这69个靶点的PPI数据。随后建立了孟鲁司特作用引起抑郁症的药理靶点和PPI网络。

图2 孟鲁司特、抑郁的总靶标以及孟鲁司特引起抑郁的69个交叉靶标

4.PPI网络拓扑参数和最佳核心靶标

通过Cytoscape软件评估了孟鲁司特引起抑郁症的17个靶点和功能相关蛋白质相互作用网络的拓扑参数。

图3 孟鲁司特作用导致抑郁症的中心基因/靶标

5.在GO和KEGG通路富集的核心靶点

使用R语言相关软件包对核心靶点进行了GO富集和KEGG通路分析。这些数据提供了关于核心靶点在GO和KEGG通路富集中的重要信息，有助于理解孟鲁司特作用引起抑郁症的潜在机制。

图4 核心靶标的GO富集分析

图5 核心靶标的KEGG富集通路分析

文章小结

Researcher

本文的思路十分常规，选取了当下热门的精神类疾病抑郁症，采用以往的数据库挖掘＋网络药理学分析的经典套路，GO和KEGG富集分析与疾病相关的重要靶点和信号通路，为深入理解孟鲁司特在抑郁症发病机制中的作用提供了重要线索。0实验轻轻松松拿下1区6.6的好成绩，你还不心动吗？换个疾病和药物就可以复现！有需求的小伙伴快快联系小记者吧！

文章索引：

Association and mechanism of montelukast on depression: A combination of clinical and network pharmacology study

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0165032724008735?via%3Dihub