“网络毒理学”思路的更新速度实在是太太太快了！前两周还在纯生信，现在已经干到组学和实验都要加了···
小记者觉得，这形势估计跟网络毒理学的同宗“网药”有关，大家想啊，网药发展了这么多年，很多思路都在前头打好版了，网毒来了直接往里套就完了，这么做是简单，但随之而来的就是发展速度超快，内卷开始，大家都在比着用一些高级联合思路去保中稿。估计等网毒的思路模式发展到跟网药差不多的时候，速度就会放缓了，不过现在要做的还是尽量卷到别人前头，比如小记者今天要分享的郑大一附院的文章，估计同行看了也会直呼伤不起···
来吧，看思路！该文章研究三聚氰胺和氰尿酸共同暴露导致肾损伤的机制：选题上，三聚氰胺被大家熟知是奶粉掺假事件，但它在餐具等日用品中的潜在肾毒性研究有限，所以该选题具备一定创新性和研究价值；思路设计为实验+转录组+网络毒理学+机器学习+分子对接，这种联合思路在网络毒理学中还很少用到，创新性和竞争力较高，拿下了2区6分+非常轻松！目前这个套路虽然网毒中用的少，但在网药中已经应用比较成熟了，比较容易复现，换个毒性物质就成一篇，想卷在别人前头，就选这个联合思路！
网络毒理学思路已经进阶到跟网药差不多的水平了，想提高发文概率，小记者建议大家还是提前布局联合思路，与其被卷不如先去卷别人。不论你是想做简单思路快速发文，还是想做升级思路冲击高分，抓紧上车才是正解！什么？你说不知道如何设计网络毒理学课题也没时间学生信分析？那还等什么，找小记者来帮你啊，咱有专业团队，思路设计、定制分析、生信服务器等个性化服务应有尽有，随时等待你的召唤！
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题目：一种网络毒理学和机器学习方法，用于研究三聚氰胺和氰尿酸共同暴露导致肾损伤的机制
杂志：Ecotoxicology and Environmental Safety（IF=6.2）
发表日期：2025年3月
研究背景
在过去的二十年里，备受瞩目的三聚氰胺（MA）暴露案例引起了严重的毒理学问题，尤其是关于食品掺假的问题。虽然 MA 在各种家用产品中被广泛用作基本有机化学中间体，但 MA 与其同源物氰尿酸（CA）产生意想不到的毒理学协同作用的可能性仍然令人担忧。
研究思路
该研究将大鼠模型暴露于三聚氰胺和氰尿酸（MC），分析肾脏病理、损伤标志物，并进行RNA 测序，以确定两组间差异表达的基因。随后进行通路富集和免疫微环境分析，以阐明 MC 诱导肾损伤的潜在机制。使用 ChEMBL、STITCH 和 GeneCards 数据库鉴定潜在的靶标，并使用三种机器学习算法筛选hub基因。进行分子对接以评估 MC 与已鉴定的hub基因之间的相互作用。（ps：生信想做的又快又好？建议用带GPU的生信服务器给你的分析提提速！有需要直接找小记者，共享/独享都可以，附带一对一技术指导，咨询就享优惠！）
主要结果
1. MC 暴露导致严重的肾脏形态学和组织学变化，以及肾损伤和纤维化标志物水平升高
图1：MC 暴露诱导肾损伤
2. RNA-seq 分析获得两组间的差异基因，功能富集分析显示 MC 组免疫炎症和细胞凋亡相关通路显著富集
图2：RNA-seq 数据的差异分析和通路富集
3. 免疫微环境分析证实了MC 组中促炎免疫细胞的浸润丰度显着更高
图3：免疫微环境分析
4. 网络毒理学分析获取的MC和肾损伤靶点与转录组的差异基因取交集，确定了 MC 诱导的肾损伤的 20 个潜在靶点，其主要富集于内分泌激素代谢、免疫反应和细胞凋亡调节等通路
图4：确定 MC 诱导的肾损伤的潜在靶点
5. 使用 LASSO 回归、RF 和 MCODE 算法识别出2个关键基因Ren 和 Casp3，Ren主要富集于参与能量代谢和炎症反应的通路，而 Casp3 主要富集于与细胞生长、增殖、存活以及免疫防御和炎症调节相关的通路
图5：ML 算法和关键基因的获取
6. Ren和 Casp3 这两个基因分别被确定为肾素-血管紧张素-醛固酮系统 （RAAS）激活和细胞凋亡的关键调节因子，进一步的WB和免疫荧光实验证实了MC暴露组中这些蛋白的上调
图6：MC 暴露通过 RAAS 和细胞凋亡介导肾损伤
7. 分子对接表明 MC 与两种关键蛋白之间具有很强的结合亲和力
图7：分子对接
小结
这篇文章的联合思路看着复杂，其实做起来不难，实验部分、转录组分析和网络毒理学分析都是很成熟的分析手段，非常好实现，想要早人一步拿下SCI的朋友，快码住赶紧学起来吧！网络毒理学思路和文章更新相当快，你的竞争对手已就位，早上车早发高分，晚上车只能被卷了！小记者建议大家提前布局高阶思路，自己没时间、搞不定思路设计、机器学习等复杂分析都可以找小记者团队帮忙，可评估设计思路，可定制生信分析，还有生信服务器租赁，专业团队经验丰富，有需要随时call小记者！
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