肿瘤领域，想找个简单的思路快速发个2区，最好能毕业前就能发出去，你能想到什么选题方向？
这其实是小记者收到的一条私信：肿瘤领域，毕业要发2区文章，想找简单好实现一点的生信思路，自己生信刚入门，最好是自己能实操的思路，让小记者给些建议···
这要求，不得不说，不太好实现，肿瘤生信卷的一塌糊涂，能满足要求的方向太少了，但咱有突破之法，单个肿瘤不行就联合下非肿瘤啊，扩大了阵地还能用上非肿瘤疾病的生信必杀技——共病分析，短平快思路中的扛把子，它一出招直接搞定！不过一定需要注意疾病的选择，这一般是这类思路中的最大亮点，所以一定要具备创新性！并且疾病选的创新性越高，后面分析和实验就做的越少！如果选择的疾病实在创新性一般的话，有个弥补措施就是再加一个热点方向（比如细胞死亡、乳酸化、代谢、线粒体等等），不知道怎么选的可以滴滴小记者提供专业建议~
惯例，上文献：
该研究针对乳头状甲状腺癌(PTC)和桥本甲状腺炎(HT)进行双疾病分析，并筛选共享生物标志物。疾病选择是PTC和HT，两者有相关性，并且都是研究较少的疾病，创新性较高；思路设计为，最简单的生物标志物筛选思路，最后加了一些验证实验，整体分析流程很简单，分析内容也很少都是最最最基础的，上手就能复现！
思路已就位，等你来复现！什么？你说不知道如何设计共病分析思路？也没时间自己做分析？那还等什么，找小记者来帮你啊，咱有专业团队，创新思路设计、个性化生信分析方案定制，你所需的服务我应有尽有，欢迎来询
题目：与乳头状甲状腺癌和桥本甲状腺炎相关的生物标志物:生物信息学分析和实验验证
杂志：International immunopharmacology（IF=4.8）
研究背景
桥本甲状腺炎(HT)被广泛认为是乳头状甲状腺癌(PTC)的危险因素。该研究旨在确定HT进展为PTC的关键靶点。
研究思路
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图1：研究流程图
主要结果
1. 对HT、PTC、PTC-W和正常甲状腺(TN)样品进行差异基因分析，鉴定了78个共享DEGs
图2：HT和PTC之间的共享DEGs的鉴定
2. GO和KEGG富集分析显示共享基因主要与EMT和PI3K-Akt信号通路相关
图3：GO和KEGG富集分析
3. 构建PPI网络，识别到10个中枢基因，其中MET和FAM20A的相关性最强，并在数据集中验证10个基因的表达
图4：PPI网络分析
图5：公共数据集验证基因表达
4. qPCR验证10个hub基因的表达，发现在PTC-W中FAM20A和MET的表达显著上调，IHC结果进一步证实MET和FAM20A在PTC-W中显著过表达
图6：qPCR验证基因表达
图7：IHC验证基因表达
5. 免疫浸润分析发现，FAM20A和MET的高和低表达组之间免疫细胞亚型的显著差异，并且FAM20A和MET与各种免疫细胞相关，特别是树突细胞(DC)和巨噬细胞
图8：免疫浸润分析
6. 使用ROC曲线进一步评估两个中枢基因的诊断准确性，发现FAM20A和MET具有很强的诊断潜力
图9：FAM20A和MET的临床价值评价
小结
这篇文章的分析应该算是最基础的生物标志物分析，入门级别，相当简单，生信新手上手就能复现，老手更不用说了，一两天就能完成分析，如果能提前准备好实验样本，一周时间，生信+实验就能全部完活，加上写作时间，年前投稿完全没问题，就问你快不快！双疾病思路是真厉害啊，肿瘤和非肿瘤通吃，直接解决肿瘤生信内卷问题，如果你也想快速又不费力的发文，选它就对了！你说，疾病选择搞不定？思路设计和分析实操有难度？找小记者！专业的思路设计和生信分析团队为您提供1V1的方案定制服务，有需要随时联系~
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