欢迎各位看官又来到【生信日报】的生信零代码小工具推荐栏目~ ~
在生信分析中，如果锁定了目标基因，通常会做一步“筛选目标基因的相关基因，做表达相关性分析”，这类分析一般利用R包做Pearson或的 Spearman相关性分析，R包分析对于生信大佬来说就是小事一桩，但对于生信小白来说可真是难关一个了！
所以今天，小记者就给朋友们推荐一个可以做相关性分析，并且可以原图直出发文的“零代码生信分析神器”，对生信小白非常友好，操作简单直接就能上手，你也可以轻松拥有华丽分析图，想知道的话跟着小记者往下看吧！
它就是“云生信在线分析平台”，平台中包含几百个零代码分析小工具，从分析到作图应有尽有，只需上传数据，直接一键成图，超级适合生信小白使用哦。
网址：http://www.biocloudservice.com/home.html ，分析平台开源、注册登录后可免费使用，快去试试吧！（ps：觉得有用的小伙伴麻烦点个关注哦，朋友们的支持是【生信日报】更新的最大动力！）
在生信分析中，我们往往希望对我们关注的某一个基因进行下游功能的探索，然而，单个基因想要研究，大多数情况下只能是通过实验进行，通常会对该基因进行敲除或过表达后进行测序，从而和正常组进行比较，得到差异基因认为是受该基因影响的，但是这样做一是耗时耗力，而是得到的差异基因仍然是一堆，我们仍然不知道哪些基因和该基因密切相关。
皮尔森相关系数和斯皮尔曼相关系数为研究基因之间的表达相关性提供了很好的思路，因此本软件通过基于基因在各个样本中的表达矩阵，利用皮尔森相关系数和斯皮尔曼相关系数计算原理，分别获得各个基因与关注基因的相关性排名，通过给定的基因个数 N，绘制相关性最强的 TOP N 基因和关注基因的散点分布图，并标识出具体的相关系数和显著性 p.value 值，从而为下游功能研究提供参考。
Step 1 ：首先打开云生信在线分析平台，并登录使用。搜索并点击“基于表达信息挖掘与靶基因相关的基因”进入小工具页面：
Step 2：进入小工具页面后，可以看到上传数据选项，点击进入后，提示上传与模板数据格式一致的输入文件。回到工具页面可以根据左上角输入数据模板制作数据。
Step 3：点击“输入数据模板”，进入以下页面，可以看到给出了1个数据模板，点击数据可以在线预览和下载。
输入数据：基因表达矩阵文件【expr.csv】
（以基因为行，样本为列， 保存为 csv 文件）
Step 4：制作好数据后，在文件上传界面上传所有输入数据，点击上传文件。再返回到工具主页面，输入“目标基因”和“相关基因个数”，点击“Submit”即可跳转到结果展示页面。比如输入目标基因为HDAC1，相关基因个数为6：
Step 5：共得到1图1表，包括1个相关性散点图图和1个相关基因的表达统计表。可以在结果展示页面直接点击某个图进入预览页面，也可以直接下载使用。
1，相关性散点图：该图表示各个基因与关注基因的相关性散点图（ps：个数输入6，则绘制与关注基因最正相关的 6 个和最负相关的 6 个基因的相关性散点图），纵轴名称是其它各个基因 symbol，横轴名称为关注基因 symbol，最上方 P 值表示显著行 p.value 值，r 值表示 pearson 相关系数。
2. 相关基因表达相关性统计表：该表格表示各个基因和关注基因之间的相关系数及 p.value 值，第二和第三列分别表示计算得到的各个基因和关注基因的 pearson 相关系数和对应的显著性 p.value 值，第四和第五列分别表示计算得到的各个基因和关注基因的 spearman 相关系数和对应的显著性 p.value 值，第六列为对应的基因 symbol。
简单又好操作的相关基因筛选和绘图小工具，你学会了吗？动一动手指就能拿到高颜值的分析图，简直不要太适合新手朋友哦，感兴趣的小伙伴赶快来尝试一波吧！后面还有更多小工具推荐，敬请期待哦！
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