大数跨境

别催了,学会利用NHANES数据库,今年性价比最高的文章套路没错了!

别催了,学会利用NHANES数据库,今年性价比最高的文章套路没错了! 生信日报
2023-10-15
0
导读:今天的这篇文章就使用该数据库中的数据并结合多种回归模型的评估,就实现Q1近6分的发表!


NEWSPAPERS
·生信热点·

特色数据库构建、免费思路评估、

付费生信分析



国家健康和营养调查(NHANES)是由疾病控制和预防中心(CDC)、国家健康统计中心(NCHS)在非机构化美国人口中开展的一项横断面人口健康调查。通过使用该数据库,小伙伴们可以多方面挖掘各因素与结局的相关性。再结合多个回归模型的评估,肯定能达到事半功倍的效果!(ps:希望学习生物信息学分析技术的宝宝记得来后台call小记者哟~)




今天的这篇文章就使用该数据库中的数据并结合多种回归模型的评估,就实现Q1近6分的发表!全靠公共数据库就能实现的这波操作,性价比如此之高,还不和小记者一起来看看嘛~(ps:不知道怎么创新的宝宝来找小记者!这里有新鲜出炉的生信热点方向,还有一茬接一茬的创新型思路…感兴趣的直接来公众号后台找我噢!)



01

题目:血液重金属与老年人认知功能混合效应的性别特异性:来自NHANES的证据


02

杂志:Nutrients.

03

影响因子:IF=5.9

04

发表时间:2023年6月


PART01

-研究背景-




男性和女性对环境暴露和神经系统负面影响的反应方式通常不同。尽管之前的研究已经检验了单独接触金属对认知功能损害的影响,但金属混合物与认知功能之间的关系,特别是在考虑个人性别时,仍然难以捉摸。本研究旨在调查多种金属混合物与美国老年人认知功能之间关联的性别差异。

数据来源


PART02

-研究思路-



本研究采用了2011-2014年NHANES对美国老年人的调查。


对五种混合金属接触后的老年人进行了四种认知测试,即动物流畅性测试(AFT)、数字符号替换测试(DSST)、即时回忆测试(IRT)、延迟回忆测试(DRT),这些测试均使用广义线性回归模型(GLM)、贝叶斯核机器回归模型(BKMR)、加权分位数和回归模型(WQS)和分位数g-计算回归模型(Qgcomp)进行评估。


共有1833人参与了这项横断面研究,其中男性883人,女性950人。

1 纳入研究的具体选择过程


PART03

-主要结果-

01


研究参与者的特征

这项研究仅限2011-2014年间参与NHANES的19,931名受访者中3632名60岁或以上的参与者。删除了缺少社会学特征和血清重金属实验检测结果的受访者(n=1486),以及缺乏四项完整认知评估的老年人(n=313)。最终纳入人群1833名60岁或以上的个体。性别亚组分析的结果显示在年龄、教育程度、吸烟和饮酒方面存在差异。男性比女性更倾向于吸烟和饮酒。四项认知评估中的三项存在显著的性别差异,且男性的认知得分低于女性(IRT、DRT、DSST)(表1)。

表1 研究人群特征

1 三个不同表达的基因组之间的重叠

02
 多种金属暴露与认知功能的BKMR模型

作者利用BKMR模型研究了5种血液重金属共同暴露与认知功能之间的关系。四项认知评估的结果与男性参与者的血液重金属共同暴露呈正相关。血液重金属对女性亚群的总体影响在DRT与DSST呈正相关,但与AFT呈负相关(图2,图3)。

2金属混合物对男性认知功能的综合影响

3金属混合物对女性认知功能的综合影响

03

 多种金属暴露与认知功能的WQS模型

作者对血清重金属对认知功能的综合性影响的分析显示IRT、AFT和DSST是四项认知评估中男性获得更显著的阳性或阴性结果的三项。

同样,五种血液重金属对男性认知能力的正向影响在正WQS模型分析结果中进一步得到支持(图4)。根据所有人口统计学因素的权衡研究,血硒对大脑性能具有显著的保护作用,而血镉和血铅则为相反的作用(表2)。

4 NHANES 2011-2014WQS回归模型显示血液重金属与认知功能之间的关联

2 整个人WQS分析的总结结果

04
多种金属暴露与认知功能的Qgcomp模型

与WQS模型相比,Qgcomp模型允许直接评估不同输入变量对因变量的影响,因为它在测试前避免对组合影响做出主张。在整个人群中发现血清重金属中的血硒在IRT与AFT中呈积极影响(图5)。在男性中发现血清重金属中的血硒在IRT、AFT与DSST中呈积极影响(图6)。


女性中血镉对IRT、AFT与DSST中负面影响最明显(图7)。血硒与血镉的结果基本与在整个群众中的趋势相似。作者发现血硒与老年人的认知功能能力呈正相关,而血液中的镉与铅与认知能力呈负相关。另外,男性的平均认知能力比女性差,且男性似乎更容易受到接触混合金属的影响。

5 Qgcomp模型回归老年人血液重金属指数权重和四项认知测试

6 Qgcomp模型回归男性老年人血液重金属指数权重和四项认知测试

7 Qgcomp模型回归女性老年人血液重金属指数权重和四项认知测试

文章小结

这篇文章是一篇纯生信的文章,其创新点为在于使用NHANES数据库中大量的样本数据,并构建多个分析模型去评估多种金属混合物与美国老年人认知功能之间关联的性别差异。这是否也给各位小伙伴带来提示,可以使用多种统计技术手段去评估某个因素与结局的相关性。而这些统计手段都可以从小记者这里了解到哦~看完小记者的分析,朋友们,你还在迷茫吗?


小记者话生信

如果您的时间和精力有限或者缺乏相关经验,并且对生信分析和课题设计有所需要的话,【生信日报】可以提供特色数据库构建、免费思路评估、付费生信分析和方案设计以及实验项目实施等服务,感兴趣的朋友可以咨询小记者哦!


扫码咨询小记者吧!

铁死亡在非肿瘤纯生信分析中仍然强劲!轻松拿下4分+的套路快来试试!性价比超高!


最新12分+GWAS双疾病纯生信分析!工作量不大,重在方法创新


中科院1区Top 11分+【生信&孟德尔随机化友好期刊】,柳叶刀子刊,想冲刺高分的朋友们看过来!


孟德尔随机化与单细胞分析强强联手,再加动物模型验证,4张主图教你如何拿捏8分+!赶紧上车!!


干湿结合稳扎稳打拿下7分+文章!聚焦“泛素化相关基因”的生信分析思路,值得借鉴~

【声明】内容源于网络
0
0
生信日报
内容 283
粉丝 0
生信日报
总阅读67
粉丝0
内容283