
有一个发文方向,让小记者痛呼自己“毕业不逢时”啊···
它就是网络毒理学!
只需最简单的分析套路,不用实验,纯生信就能发文,哪像自己错过了“网药”又没等来“网络毒理学”,只能吭哧吭哧做了3年实验才搞出两篇SCI,有这功夫,用上网络毒理学早发了好几篇文章了,毕业那还不轻松,优博都能够一够了吧!
So,如果我是导师,我一定会让学生赶紧用这个方向,每人先发篇小文章保毕业,然后再考虑搞篇大的,这多爽啊,可惜,这些都只能是小记者的臆想了···不过,看到这篇文章的你还有机会,小记者真诚建议大家不要错过啊!!!
网络毒理学就相当于初级版“网药”,想象一下回到10年前用网药发文章,那得多简单,还是网药那套模板,研究目标换一换,文章就发到手软!现在正是网络毒理学最好发文的时候,一点都不卷,工作量不大,分析又简单,纯生信都能发文,性价比这么高,你还在等什么呢?
下面看个已经发了多篇纯生信的经典思路——网络毒理学+分子对接,上实例~
这篇文章研究的是乙酰柠檬酸三丁酯(ATBC)的衰老毒性和机制,研究目标是替代增塑剂ATBC,思路设计为网络毒理学+分子对接,简单到不能再简单的套路,换个疾病(估计有朋友可能已经发现这个文章很眼熟,对,2周前小记者就发过这个套路,只是换了个疾病就又发出来一篇),或者更稳妥一点换个毒性物质就能复制一篇,还在观望的朋友可得抓紧了,机不可失时不再来,很有可能你在犹豫,别人在悄悄发文,晚来一步只能被卷了···
网络毒理学思路已就位,想不卷就发文的朋友抓紧尝试复现它哦!什么?你说不知道如何设计网络毒理学课题也没时间学生信分析?那还等什么,找小记者来帮你啊,咱有专业团队,思路设计、定制分析、生信服务器等个性化服务应有尽有,随时等待你的召唤!
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题目:基于网络毒理学和分子对接策略高效分析乙酰柠檬酸三丁酯的衰老毒性及机制
杂志:Toxicology(IF=4.8)
发表日期:2024年12月
研究背景
作为一种在日常生活中广泛使用的增塑剂,乙酰柠檬酸三丁酯(ATBC)由于长期和显著的人体暴露仍可能存在一些潜在的风险。尤其是考虑到全球对衰老的关注,长期暴露于ATBC对衰老过程的潜在影响值得进行彻底的调查和讨论。
研究思路
该研究利用ChEMBL、SwissTargetPrediction和CellAge数据库筛选与ATBC暴露和衰老相关的潜在靶点。然后构建PPI网络识别核心靶点,并进行GO和KEGG富集分析。利用Autodock进行分子对接分析ATBC和核心靶点之间的结合。(ps:生信想做的又快又好?那可离不了生信服务器!有需要直接找小记者,共享/独享都可以,附带一对一技术指导,咨询就享优惠!)

研究流程图
主要结果
1. 从ChEMBL、SwissTargetPrediction和CellAge数据库,确定了32个与ATBC暴露和衰老相关的潜在靶点

图1:与ATBC暴露和衰老相关的潜在靶点的鉴定
2. PPI网络分析识别11个中枢靶点,包括EGFR、STAT3和BCL-2

图2:PPI网络识别核心靶点

图3:核心靶点的PPI网络
3. 对32个潜在靶点的GO和KEGG综合分析显示,ATBC诱导的衰老的核心靶标主要富含与细胞增殖、端粒缩短、癌症和细胞衰老的正调节相关的途径。核心靶点的KEGG分析显示,核心靶点的主要富集途径与细胞衰老途径和癌症相关途径密切相关

图4:GO分析
图5:KEGG分析

图6:核心靶点的KEGG分析
4. 从细胞衰老途径中筛选出的四个核心基因(MAPK14、CDK2、MDM2和PIK3CA),代谢途径分析显示这四个核心基因在衰老应激、氧化应激、癌症等途径中至关重要
图7:。细胞衰老途径核心基因的代谢途径分析
5. ATBC与4个细胞衰老途径核心靶蛋白的分子对接,证实了ATBC与核心靶标之间的高结合亲和力

图8:分子对接
小结
这篇网络毒理学思路实在是简单到不能再简单了,但就这都能发快5分的纯生信,这性价比还要什么自行车,抓紧上车吧!这类分析整体工作量不大,如果是生信熟手或者是搞生信的团队去做,估计几天就能完成分析,如果用上服务器估计会更快(生信服务器有需要可以联系小记者),加上写作投稿时间,2个多月就能完成1篇文章,一年来个几篇也很有可能!之前是搞实验的团队也不要被生信吓退,复现其实也不难,实在没时间学生信实操也可以找小记者团队帮忙,可评估设计思路,可定制生信分析,专业团队经验丰富,有需要随时call小记者!
小记者话生信
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