现在的科研人都已经卷到本科生了！小记者今天看到南京医科大学发表了一篇11分+的纯生信文章，定睛一看，一作居然还是本科生，真生后生可畏啊！这也顿时让小记者来了兴趣，想要见识一下这篇佳作。
这是一个关于乳腺癌预后预测模型构建的内容，研究利用了来自9个独立乳腺癌队列DNA methylation数据，开发了一个独立验证的模型，该模型结合了具有主效应和基因-基因相互作用的表观遗传生物标志物（ARTEMIS）和创新的3-D建模策略。使用受试者工作特征曲线下面积（AUC）评估ARTEMIS的识别能力，并使用期望和观测（E/O）比进行校准。采用决策曲线分析，以净获益（NB）和净减少（NR）评价其临床疗效。此外，研究还进行了系统评价，将其性能与现有模型进行比较，进一步强调了新模型在临床应用中的优势。
看到这篇本科生一作的文章，你是否也在摩拳擦掌准备大干一场，有想法就行动起来吧。如果在选题或者分析上遇到瓶颈，记得来找小记者！专业团队为您提供方案或标书设计，定制生信分析或服务器上的支持，做大家坚实的科研后盾！
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题目：ARTEMIS：一个独立验证的乳腺癌预后预测模型，包含具有主要作用和基因-基因相互作用的表观遗传生物标志物
期刊：J Adv Res
影响因子：11.4
发表日期：2024.8.11
研究背景
乳腺癌是一种异质性疾病，受多种遗传和表观遗传因素的影响。大多数乳腺癌预后模型只关注预测因子的主要作用，而忽略了基因-基因相互作用对预后的关键影响。
研究思路
研究结果
1.ARTEMIS的风险分层能力
作者将四个队列中的患者根据ARTEMIS评分分为高危和低危两类，研究发现高危组在TCGA和GSE72245中表现出较低的生存率和更高的危险比（HRs）。在外部测试中也观察到了同样的效果。按ARTEMIS评分四位数和90分位数进行分组，观察到了明显的剂量-反应相关性，高百分位数组与生存时间缩短和死亡风险增加显著相关。
2.ARTEMIS的模型判别
研究发现ARTEMIS模型能够准确预测训练集、内部和外部测试集的3年和5年生存率，表明该模型具有可靠的区分患者的能力，可以作为临床预后预测的有力工具。
3.ARTEMIS的临床疗效
研究经过测试发现在每1000名需要干预的患者中，ARTEMIS可以额外识别出33名真阳性患者。对于3年的预测率，ARTEMIS实现了不必要的临床干预减少69.21%，同时确保没有高死亡风险患者被忽视，而基础模型减少了67.64%。 此外，对于5年生存终点，ARTEMIS减少了56.01%的不必要的临床干预，而基本模型仅为51.04%。表明该模型能够准确识别高风险患者，具有重要临床应用价值。
4.通过系统综述比较ARTEMIS与现有模型
研究共检索了50119篇文献，并经过筛选后选择其中的209篇进行分析。结果显示ARTEMIS与现有模型相比，其预测准确性和综合性能都显著优于现有模型。
文章小结
研究揭示了ARTEMIS是一种高效实用的乳腺癌预后预测工具，并通过综合分析证明了其优越的预测性能，为临床预后预测提供了一个重要手段。一篇纯生信内容就这么水灵灵的完成了，如果大家在复现过程中发现构建模型有难度，可以随时来找小记者帮忙解决，无论是选题上的方案、标书设计，还是需要定制化生信分析或服务器都没有问题，主打一个为大家科研保驾护航！
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