大家好啊,小记者又来为大家分享新知识了!随着国家对中药的扶持力度的增加,网药这个赛道已经是卷的不得了,那就有小伙伴问小记者了,有木有其他赛道可以代替网络药理学呢?结果当然是肯定的,它就是网络毒理学。作为网络药理学的分支,与分子对接搭配也是非常合适的组合。
今天为大家分享一篇由四川大学在International Journal of Surgery(IF= 12.5)杂志上发表的题为:Analysis of toxicity and mechanisms of DEHP in prostate cancer with network toxicology and molecular docking strategy的论文,旨在应用网络毒理学和分子对接策略分析邻苯二甲酸二(2 - 乙基己基)酯(DEHP)对前列腺癌的毒性作用及机制,纯生信2图0表发表12.5一区TOP,家人们,网络毒理学这个新兴的交叉学科,如今正是科研创新的热门研究!太适合没时间补实验的你了!小记者团队精心准备了网络毒理学和分子对接的科研指导服务,有需求的快来联系小记者吧!
定制生信分析
生信云服务器
(加微信备注99领取试用)

题目:利用网络毒理学和分子对接策略分析 DEHP 在前列腺癌中的毒性和作用机制
杂志:International Journal of Surgery(IF= 12.5)
发表时间:2024年6月
研究背景
工业化学品在众多领域的广泛应用,不可避免地产生了大量具有未知毒性的环境污染物。其中,邻苯二甲酸二乙基己酯(DEHP)作为塑料工业中不可或缺的重要组成部分,其潜在的致癌性以及对内分泌系统的干扰作用,已经引起了广泛的关注。前列腺癌作为严重威胁男性健康的主要疾病之一,其发病原因错综复杂,涉及遗传、环境、生活方式等多个方面。而DEHP所具备的内分泌干扰特性,已被发现与前列腺癌的发展存在一定关联,然而,二者之间具体的作用机制目前尚不清晰。
研究思路
用 ADMETlab 2.0和 ProTox-II软件预测DEHP毒性;从多个数据库获取相关信息,筛选出 DEHP 与前列腺癌的共同靶点,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,确定核心靶点;进行GO和KEGG富集分析;用AutoDock Vina软件对核心靶点与 DEHP 进行分子对接。
主要结果
1.靶点及通路
确定88个DEHP与前列腺癌共同靶点,49个核心靶点,其中SRC、MMP9等排名前五。GO和KEGG分析显示(图1),目标基因呈现出在细胞外基质组织、激素反应、粘着斑以及癌症通路中的富集现象。与之相关的信号通路不仅涵盖了癌症通路,还涉及到神经活性配体 - 受体相互作用。这一系列结果有力地支持了这些基因在癌症发生以及发展过程中可能发挥的潜在作用 。

图1 靶点和通路图。DEHP和前列腺癌靶点之间有88个基因交叉(A)。潜在靶标的蛋白质-蛋白质相互作用网络(B)。核心靶标的蛋白质-蛋白质相互作用(C)。潜在靶标的基因本体GO富集分析(D)。KEGG潜在靶点富集分析(E)。
2.分子对接
DEHP与SRC、MMP9、MMP2、PTGS2、CCND1五个核心靶蛋白结合亲和力强,Vina score<=- 8.0(图2)。
图2 目标蛋白质与邻苯二甲酸二-(2-乙基己基)酯(DEHP)的分子对接结果
文章小结
(1)成功鉴定了88个与邻苯二甲酸二-(2-乙基己基)酯(DEHP)诱导前列腺癌相关的靶点。
(2)根据核心目标,包括粘着斑和癌症途径,很明显,DEHP暴露可能通过与SRC、MMP 9、MMP 2、PTGS 2和CCND1基因特异性相互作用在前列腺癌发生中发挥作用。
(3)这些发现不仅为这一过程的分子机制提供了有价值的见解,而且还提出了减轻DEHP对前列腺健康不利影响的潜在治疗靶点。想要利用网络毒理学发文的朋友们,如果你还没有明确的思路设计或者分析遇到了难题,就来找小记者吧,小记者这里有经验丰富的团队,无论是实验设计还是数据分析,通通不在话下,小记者等你来啊!
小记者话生信
如果您的时间和精力有限或者缺乏相关经验,并且对生信分析和期刊推荐有所需要的话,“生信日报”非常乐意为您提供如下服务:免费思路评估、付费生信分析和方案设计,有意向的小伙伴欢迎咨询小记者哦!
定制生信分析
生信云服务器
往·期·推·荐
很水但也真牛!首篇DeepSeek医学SCI已发表,1区6.5分,动作真快,实名羡慕了
机器学习是真热啊!“纯生信+机器学习”简单分析就荣登1区7.7分,IJBM杂志真宝藏刊—接收纯生信、审稿快,快来薅羊毛吧!
出息了,网络毒理学!4分水平联合一下ADMET+机器学习直升1区12分+,不愧是北大团队,太秀了
IF12.5分,温州医科大团队真的强,又中一篇GBD数据库分析!妥妥的临床天选思路,数据更新文章发到手软!

