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锦州医科大这个经典思路勿错过!JCR1区顶刊经典思路!还不来学习?“网药+分子对接+体内外实验”,快来“种草”~

锦州医科大这个经典思路勿错过!JCR1区顶刊经典思路!还不来学习?“网药+分子对接+体内外实验”,快来“种草”~ 生信日报
2025-03-14
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在国家大力扶持中医药学科的背景下,“网药”分析作为中草药分析手段大放异彩。它在药物研发、机制阐释等领域广泛应用,尤其在中医药机制研究中,借助公共数据和生信工具探究机制,省时省力省钱,因而备受追捧。 

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今天分享的这篇文章是由锦州医科大学团队于2025年1月发表在Journal of Ginseng Research杂志上的一篇文章,本文通过SEA、ECTM、SwissTarget等数据库筛选人参皂苷Rg1作用靶点,从OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库获取肺动脉高压(PAH)及肺血管内皮功能障碍相关靶点,用Venn图确定交集靶点。利用STRING数据库构建PPI网络,经拓扑分析筛选核心靶点。借助Metascape进行GO富集和KEGG分析,明确潜在生物功能和信号通路。然后运用AutoDock Vina进行分子对接,验证Rg1与关键蛋白的结合活性最后,结合体内外实验,探索Rg1治疗PAH的机制。 

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题目:Ginsenoside RG1通过TXNIP/NLRP3途径调节的线粒体改善缺氧诱导的肺血管内皮功能障碍。

杂志:Alimentary Pharmacology & Therapeutics

影响因子:IF=6.3

发表时间:2025年1月

研究背景

肺动脉高压(PAH)是一种严重疾病,其发展依赖血管内皮功能障碍(VED),氧化应激、炎症和线粒体自噬在其中起重要作用。目前PAH的治疗面临诸多困难,现有治疗手段往往无法有效解决内皮功能障碍问题。研究表明,人参皂苷Rg1具有多种保护作用,但Rg1对缺氧诱导的PAH中肺VED的影响机制尚不清楚。本文旨在探究Rg1是否通过TXNIP/NLRP3途径调节氧化应激、炎症和线粒体自噬,进而改善缺氧诱导的VED

研究思路

本文先运用网络药理学,借助SEA、OMIM等多个数据库筛选人参皂苷Rg1、PAH及肺血管内皮功能障碍相关靶点,经Venn图确定共同靶点,用STRING数据库构建PPI网络并分析,再用Metascape进行GO和KEGG分析。然后利用AutoDock Vina进行分子对接。最后构建PAH小鼠和细胞模型,经体内外实验,检测多项指标,探究Rg1对PAH的作用及机制    

研究结果

1.网络药理学分析

利用SEA、ECTM等数据库,以人参皂苷Rg1、肺动脉高压(PAH)和肺血管内皮功能障碍(VED)相关靶点为对象,进行靶点筛选、PPI分析、GO富集和KEGG分析。结果显示,Rg1参与氧化应激反应等过程,与血管平滑肌收缩等通路相关,TXNIP/NLRP3信号通路可能是治疗PAH的潜在靶点(图1A - G)。    

图1网络药理学分析,探索Rg1靶点,Rg1改善缺氧诱导的PAH

2.动物实验

以缺氧联合su5416诱导的PAH小鼠为对象,进行血流动力学等检测。结果表明,Rg1可降低小鼠mPAP、RVSP,改善右心功能和肺血管组织病理变化(图1I - R)。    

3.血管功能检测

以SuHx小鼠为对象,检测血管舒张功能、NO水平等。发现Rg1可改善血管舒张功能,增加NO和eNOS表达,缓解VED(图2A - N)。

    

图2Rg1减轻了SuHx小鼠的VED。

4.氧化应激、炎症和线粒体自噬检测

对SuHx小鼠进行相关指标检测,结果显示Rg1可降低MDA、ROS等水平,减少炎症因子,调节线粒体自噬相关蛋白表达(图3A - R)。    

图3Rg1蛋白减轻了SuHx小鼠的氧化应激、炎症和线粒体吞噬。

5.TXNIP/NLRP3通路检测

以SuHx小鼠和体外培养的肺动脉为对象,检测相关蛋白表达和血管舒张反应。结果表明,Rg1可调节TXNIP/NLRP3通路,改善缺氧诱导的血管舒张功能,且线粒体自噬参与该过程(图4A - S)。    

图4Rg1对缺氧诱导的VED中TXNIP/NLRP3通路和线粒体吞噬的影响。

6.细胞实验

以缺氧诱导的人肺动脉内皮细胞(HPAECs)为对象,检测细胞活力、NO水平等(图5A - W、图6A - U) 。    

图5Rg1通过TXNIP/NLRP3通路减轻缺氧诱导的HPAECs中的内皮细胞功能障碍、氧化应激和炎症反应。    

                

图6Rg1通过TXNIP/NLRP3通路改善缺氧诱导的HPAECs中的线粒体吞噬。

文章小结    

本文运用网络药理学、分子对接及多种实验方法,探究人参皂苷Rg1对缺氧诱导的PAH中肺VED的作用机制。经数据库筛选与分析,发现Rg1与TXNIP/NLRP3信号通路相关。体内外实验表明,Rg1能降低PAH小鼠肺动脉压力,改善血管舒张功能,减轻氧化应激、炎症和线粒体自噬,提高HPAECs活力。总之,Rg1通过调节TXNIP/NLRP3通路改善肺VED,为PAH治疗提供潜在策略不想错过这个中药“正宗”干湿结合思路的朋友,随时欢迎滴滴坊主!专业团队,十年经验,为您的科研保驾护航

  

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