自从小记者前段时间给大家分享过线粒体氧化膜裂死亡（Mitoxyperilysis）这个有Cell杂志背书的新热点后，不断有朋友们来咨询和分析，这兴趣不是一般的大啊！生信分析大家都是喜欢追新热点的，尤其是既是大蓝海，又有套路化思路可以做的热点，Mitoxyperilysis就正好符合大家的需求，生信目前发文0篇，热度很高，套上其他细胞死亡相关思路（小记者这边做过很多相关思路）就可以发文，现在咱们这边已经有好几个客户在抢发了（最早的应该都快完成分析了），有想法的朋友们赶紧出手！
再来回顾下Mitoxyperilysis：它是一种由先天免疫信号和代谢紊乱（IIAMD）诱导的全新细胞死亡方式，不依赖于 Caspase 活性，受 mTOR 调节，与肿瘤、感染、自身免疫病等涉及免疫激活与代谢紊乱的疾病相关，这么看很多疾病都可以用上这个方向，但还没有生信文章发表出来，所以发文空间超级大，太适合抢发了！
小记者今天看到一个钠死亡的文章，用的是机器学习建模→单细胞+空转分析思路，46天发到5分+，效果很不错。这要是把钠死亡换成Mitoxyperilysis热点，效果肯定会更好，完全可以尝试下6-8分！
（通过单细胞和空间转录组学的多组学分析钠死亡（NECSO），识别NEK8作为结直肠癌进展的核心驱动因素）
这里咱们主要分析下思路上的亮点，大框架属于预后分析，但是做了些升级，主要有3大加分项：
其一，在基础预后模型分析中，虽然只用了Lasso这一个机器学习算法，但又加了一点SHAP分析，增加了一些技术buff，这里如果能用集成机器学习算法+SHAP分析就更好了，可以冲击6-8分；
其二，在预后模型分析之后叠加一波单细胞和空转分析，这是最大亮点，提分作用也最强，现在单做预后模型冲高分难度较大，能加单细胞的都尽早加上吧！自己做不了的话可以滴滴小记者协助分析~
其三，针对关键基因做了实验验证、药物筛选+分子动力学模拟验证，形成逻辑闭环，又拓展到临床治疗维度，质量进一步提升！
三大亮点加持的思路，搭配钠死亡就能快速发5分+，如果再搭配Mitoxyperilysis新热点的热度和创新性，发到6-8分不成问题！并且从实操角度来看，大部分分析的难度不大，用来抢发高分正合适啊，需要复现的朋友可以直接call小记者，从个性化设计思路→定制化分析咱都齐备，专业团队很靠谱，3个月左右就能完成核心分析，助您发文快人一步！
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研究思路解构
1.数据：bulk、单细胞和空间转录组数据
2.分析流程：
研究思路和主要结果展示
1. 在TCGA-CRC队列中分析TRPM4在钠死亡（NECSO）中的作用，并收集359个TRPM4相关基因作为NECSO基因集，进行功能富集分析。通过LASSO-Cox 回归建模，开发了一个包含5基因的NECSO预后模型，SHAP分析了基因对模型的贡献
2. 针对NECSO风险评分进行临床相关性分析、预测性能评估、免疫浸润分析和突变分析
3.基于单细胞数据识别细胞亚群，使用 AddModuleScore 对 NECSO模型基因（DRD4、NEK8、EPHB2、CYTH2、ACOT11）进行评分以量化细胞的NECSO活性，发现NECSO 评分在上皮细胞中显著升高
4. 将上皮细胞进一步划分为4个亚群，NECSO 评分在亚群间的映射揭示了显著的亚群间异质性，GGH + Epi 为肿瘤免疫微环境的关键调节因子，通过多个信号轴运作，可能有助于免疫逃逸
5.伪时序分析和细胞通讯分析发现，高 NECSO 表达与上皮细胞从信号接收者向发射者的角色转变相关，伴随着间质和体液部分的定向重塑，这表明 NECSO_high 上皮细胞通过 IGFBP 和 MK 轴，在 TIME 的积极调节中发挥作用
6.空转分析显示，NECSO 评分在肿瘤上皮细胞中显著升高，并且随着分化程度的降低而范围和程度增加
7.针对关键基因NEK8进行单基因泛癌分析、表达和功能验证
8.利用CTRP 和 GDSC数据库预测靶向NEK8的治疗药物，分子对接和分子动力学（MD）模拟证实了NEK8-vorinostat 结合的稳定性
小记者话生信
这篇文章做的是钠死亡热点，但与mitoxyperilysis热点也是适配的话，并且如果换成mitoxyperilysis后，就凭这个思路的创新性和工作量，发6-8分很轻松！现在mitoxyperilysis的热度很高，并且它在生信上的创新性是天花板级别的，发文空间非常大，抢发正当时啊，啥也别说了，套上思路速速上车！
思路上咱们可以根据自己的需求来选择，目前本文用的这个单细胞加持下的预后分析思路是主流，很适合复现！然后这个思路也可以套在非肿瘤疾病中，模型换成诊断模型就可以了，对新型细胞死亡方向感兴趣的朋友抓紧行动起来吧，蓝海方向等你来挖！生信分析自己搞不定的朋友，可以直接滴滴小记者来帮你，专业团队为你保驾护航，3个月左右就能完成核心分析，助你快速产出~
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课题思路设计