众所周知，很多人吃酵素就是为了排毒通便的，可是为什么还是有小部分人吃了酵素后反而会加重便秘呢？主要原因如下：
1、肠道狭窄或者大肥肠导致有憩室便，气体排出不畅所导致，肠垢溶解软化代谢中，产生毒素在肠内膨胀正在调整中，肠道三大平衡失调，还未调整到正常状态本身有肠胀气问题。
建议：坚持吃酵素，排毒后再按摩2分钟腹部。
2、寒性体质的人，通常也有胃寒的情况，而胃寒的人如果有便秘的话，情况会比较严重，吃完酵素后肠道中之前堵塞的垃圾反而会因为酵素的清理作用让肠道的垃圾一下子都往肠道后面涌，最后造成肠道短暂性的堵塞，所以会出现更不容易排便的问题。
建议：坚持吃酵素的同时多喝温水，而且尽量每天保证多喝水，然后拿一个暖宝宝之类的暖肠胃的位置1-2个小时，自己也多揉一下，会得到一定程度的缓解。
3、酵素有特别好的高纤成分，吸水膨胀以后，就像很温柔的小刷子可以把肠道里所有犄角旮旯的垃圾都带出来。如果水喝的不够的话，肠道就不够湿润，也会造成暂时的排便困难。有些人身体的缺水是长期的，刚喝一两次足量还不够。所以会需要一段时间的修复。一旦通胀之后就没问题了。会很顺畅，很舒服，很轻松。
建议：正常人每日饮水量不少于3000毫升，吃的酵素越多，就要喝越多水。
4、还有一种情况是：因为平时生活及饮食不规律、经常熬夜的人体内体内毒素会比较多，而且由于身体机能下降，如呼吸系统和血液循环系统，容易导致身体供氧不足，体内缺氧。当酵素和部分有害的大肠菌接触之后会进行一系列的分解反应，因为缺氧的缘故造成一系列不完全的氧化反应，如此一来肠道内便会造成蠕动不良的现象，所以形成便秘。也会因此产生许多甲烷等气体，所以排气的频率增加是必然的现象，因此就会放屁多。
同时，服用酵素期间，为求快速达到减肥目的而进食量少，对结肠运动的刺激减少，或因工作紧张、生活节奏过快、工作性质和时间变化、精神因素，也是造成便秘的诱因之一。