分不清磷酸化位点怎么办？这些命名要点帮你轻松通关！

图1：ULK1的丝氨酸修饰位点[1-3]

我们所说的X位点的磷酸化，一般都是通过其位点在序列的相对顺序来命名。像我们熟知的AKT的Thr308和Ser473修饰位点，就是按氨基酸在其序列的顺序来命名的。但是，还有一些并不是直接按照氨基酸序列来的，主要有下面3种。

根据蛋白特性，蛋白在翻译后修饰行使其功能时，会将其第一个氨基酸甲硫氨酸去掉。比如组蛋白类的磷酸化修饰，去掉甲硫氨酸的命名，命名就会错位一个。

示例：

Histone H3 磷酸化Ser10（货号：66863-1-Ig）在序列上其实是第11个氨基酸。去掉甲硫氨酸后则为第10个氨基酸。

图2：去掉甲硫氨酸的命名

图3：去掉信号肽的命名

胰岛素受体（insulin receptor，INSR）存在两个isoform。以不同isoform命名的磷酸化位点又不一样了，加上其还有1-27 aa的信号肽，导致同一个位点有4个不同的命名。从文献报道和各公司产品来看，INSR常用的是去信号肽命名方式，两个isoform的命名都会遇到。但其本质上修饰位点前后序列都是一致的。

图4：INSR去掉信号肽的命名和全长的命名

同一蛋白不同种属在同一位点的修饰，因其氨基酸长度及序列不完全一致，最后的位点也会有一些差异。同一蛋白在人和小鼠中，氨基酸长度一般会相差零到几十个氨基酸。

例如IRS1，按人的氨基酸序列和按鼠的氨基酸序列同一修饰位点，命名却不一样。人Ser307和小鼠 Ser302对应的是同一个位点，后面的Ser312等依此类推。值得注意的是，如果研究的是人 Ser307位点的修饰，而购买了以小鼠为免疫原Ser307的磷酸化抗体，则和所要研究的位点不一致，研究结果也不可预期了。在此蛋白中还要注意的是，同样是612位点，在人和小鼠中的氨基酸序列却不一样。

图5：不同种属命名区别

因此在选购抗体的时候，一定要注意抗体免疫原序列是来自人的还是小鼠的，有没有去掉甲硫氨酸或者信号肽命名，位点是否和自己要研究的一致，这些信息都可以参考Uniprot（注：Uniprot对修饰位点的描述是按完整序列，即包含甲硫氨酸、信号肽）。

当然，磷酸化位点命名不只有这几种，还有一些特殊的命名。比如RNA聚合酶II中的POLR2A蛋白存在七肽重复序列，磷酸化修饰命名则以七肽的相对位置，命名为Ser2，Ser5和Ser7。大家在研究中还遇到什么有趣的位点命名方式呢？评论区留言一起讨论吧。

Proteintech也有百种磷酸化抗体，为帮助科研人员精准选购抗体，我们在这些有不同命名方式的靶标下进行了注释。

此外为了方便大家比对和查询，小P特地准备了Proteintech对不同氨基酸位点、不同蛋白质的磷酸化抗体的命名规则。如果对蛋白的修饰和抗体的命名还是有疑问，也可以咨询我们的售前客服。

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