1、固着与支持作用
通常情况下，作物根系的纵深和横向分布都比地上部要深要广，这样就将植物稳定的固着在土壤中，并支撑地上部降低外界影响，使上部茎叶及果实得以正常生长。对于根系无法很好固定支撑作物生长的，则需要辅助设施。
像棚栽西红柿需拉绳，以主侧根不发达须根较发达的M9-T337为砧木的宽行矮化密植的苹果园为例，为了加强固定防止倒伏须采用架式栽培。
2、储藏功能
植物生长过程中会不断把部分养分运送到根部，如果地上部制造的养分不足，则会从根部调取养分来保持其正常的生长。
在落叶果树上就体现了这点，秋季果树落叶前会将大量养分运输到根部和茎部，并存储起来，来年萌芽时再从根系输送至地上部，为叶芽、花芽的萌发、坐果率的提高提供足够的养分。
3、吸收作用
根系对于水分和养分的吸收是我们最为熟知的最为重要功能之ー。吸收水分，来满足叶片蒸腾作用的需要和开花结果的需要。吸收氮、磷、钾和中微量元素，来满足植物植株的各种生理需要。例如大樱桃如果结果过多，枝条和叶片少，营养竞争导致根系缺乏繁殖生长所需营养和内源激素，从而根系先弱下来，吸收水分和养分的能力下降，树势进而很容易衰弱下来，表现为：果个小、叶片小且向上纵卷、新生枝条短少。
4、输导作用
这部分作用是继前一部分作用的延续，整体根系参与其中，将根毛等吸收的养分通过木质部输送到枝叶果，同时叶片的光合产物也通过韧皮部输送到根系各部位，用以维持根系生长。
5、合成与分泌作用
根系可以合成多种必需氨基酸、诸多内源激素等供植物生长，葡萄早春发生冻害后，重新萌发枝条就是根系合成细胞分裂素产生的作用。另外根系分泌碳水化合物、有机酸等其他化合物，对根际环境产生影响，进一步促进养分的吸收。
6、根系还有繁殖作用
有些果树的根系还有繁殖作用，其根较易形成不定芽，进而形成新枝（如葡萄、桑葚等），利用这种特性进行扦插繁殖，是繁育苗木常用的方法。
1、植株长势弱
连作障碍及不合理施肥，会导致根系生长受到制约，从而造成叶子黄、植株弱小、产量低等问题。
2、作物倒伏
2015年7月，我们来到中农大试验站任县分站跟踪德新缓释肥的效果，对照是河北秦皇岛产的某品牌缓释肥，每实验各十亩。一场风雨效果明显出现差异，施用德新缓释肥的根系发达几乎没有倒伏，而对照却呈分散式片状倒伏。
3、根系受害导致作物死亡
作物常常因为施肥不当、涝害、药害等原因导致根系及地上部死亡的现象，如樱桃雨季受涝、排水不及时造成的树体死亡。皮之不存毛将焉附，树都死掉了，就谈不上种植收益了。
1、选择适宜的根系（砧木）
以苹果为例，要实现早果丰产优质高效栽培，砧木选择非常重要。对于土层深厚、肥沃的土壤，宜选用M9-T337矮化作用强的砧木，对于山岭瘠薄的果园宜选用怀来海棠、平邑甜茶等根系发达的砧木，这样可以减轻劳动强度和管理难度，较容易实现理想种植效益。
2、改善土壤环境
除小规模的无土栽培外，作物的根系多生长在土壤中，所以土壤环境的好坏直接影响到作物长势和产量。而当前我们的土壤存在着诸多板结、酸化、盐渍化、微生物菌群失调等不利根系生长的诸多因素，因此改善土壤环境对于增产提质至关重要。
针对土壤的情况，我们可以通过增施生物有机肥、土壤调理剂、适量施用氮磷钾、补充中微量元素和含解磷解钾菌、枯草芽孢杆菌等菌群的微生物菌剂来调理土壤。
3、促根抗逆
对于无法及时进行土壤修复的，可以采用促根类措施，地面冲施态康科或凯尔帕克1升/亩，或根旺10-20斤/亩，结合喷药叶面补充态康科500倍液效果更佳。
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