miRNAscope
miRNAscope是一种新型、稳定的RNA原位杂交实验，能够检测非编码小RNA和短链寡核苷酸在组织中的原位空间形态，包括Antisense oligonucleotides (ASOs)、Small interfering RNAs (siRNAs)、microRNAs (miRNAs)、Small RNA sequences that are 17-50nt in length。在同一张切片上可实现ISH与IHC共染同时检测RNA和蛋白，进一步描述细胞基因表达情况。
•检测和识别细胞亚型
•利用形态学背景可视化基因调控过程
•在原位组织中验证miRNA生物标志物
•评估小RNA治疗传递机制
•评估治疗的生物分布和疗效
•为异质组织生物学研究提供视觉维度
ACD家族探针原理
*～20 ZZ pairs per each target
*单分子检检测mRNA or LncRNA target（﹥300nt）
*单染、双染可见光：手动和自动
*多达4色荧光共染：手动和自动最多12色荧光共染：手动
*1～3 ZZpairs per each target
*单分子检测可变剪切，高度同源序列和点突变(50-300nt)
*单染可见光：手动和自动
*双染可见光：手动
*新型探针设计策略
*RNA单细胞、单分子检测ASOs、miRNAs、siRNAs和其他小RNA序列(17～50nt)
*单染红色可见光:自动和手动
miRNAscope实验工作流程
实验步骤流程图
*无需RNase free环境，只需6-8h就得到可视化结果
miRNA应用举例
癌症组织样本中检测miRNA表达
脑组织样本中检测miRNA表达
脑组织样本中检测miRNA表达
眼球样本中检测miRNA表达
miRNAscope – IHC共染检测:MIR-223-3P/CD3
siRNA应用举例
小鼠肝脏中siRNA的分布
ASO应用举例
Antisense oligo(ASO) 检测
miRNAscope通用control probe针对所有的样本
数据分析—半定量评分指南
泽浩小编
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