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RNAscope 原位检测调节血管重构的 lncRNA 的组织定位

RNAscope 原位检测调节血管重构的 lncRNA 的组织定位 云南泽浩
2024-02-20
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导读:RNAscope™ 是一项新颖的用于检测位于完整细胞中目标RNA的原位杂交检测技术。


   RNAscope™ 是一项新颖的用于检测位于完整细胞中目标RNA的原位杂交检测技术。该技术所用的「Z」探针底部特异结合靶标RNA序列,只有两个探针串联杂交时,顶部才能识别信号放大系统,由此可以放大特异性信号而非噪音信号,从而原位显示RNA的表达部位和相对丰度。其操作流程非常简单,适用于任意种属、任意组织、任意基因的原位检测,可以高质量地对测序结果进行验证和完善。


血管重构是高血压或血管损伤后常见的病理改变,也是导致动脉粥样硬化、心肌梗死、卒中、血管再狭窄等心血管疾病的关键病理过程。血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cell, VSMC)是参与血管重构的重要细胞成分,在健康状态下主要表现为收缩态表型,而当受到外界不良刺激时,会转分化为增殖分泌态表型,VSMC的表型转换是治疗血管重构的潜在干预环节,揭示VSMC表型转换的分子机制,将有助于开发新的治疗血管重构的防治手段。














2022年9月,来自陆军军医大学陆军特色医学中心(大坪医院)曾春雨、吴庚泽教授团队与杜克-新加坡国立大学医学院王义斌教授团队在Circulation Research上发表题为“LncRNA PSR Regulates Vascular Remodeling through Encoding a Novel Protein Arteridin”的研究论文。该研究发现了由长链非编码RNA(lncRNA)编码的Arteridin蛋白通过“lncRNA转录本-蛋白双重作用”诱导VSMC表型转换、加重血管重构的功能和分子机制,首次提出lncRNA及其编码短肽/蛋白共同发挥相同生物学功能,为lncRNA研究领域提供了新的理论基础,克隆并命名的全新蛋白Arteridin或可成为VSMC表型转换相关血管重构的潜在治疗靶点。

曾春雨教授团队多年深耕于高血压及其并发症的基础研究,通过lncRNA表达谱芯片检测发生血管重构的自发性高血压大鼠主动脉组织与正常血压大鼠健康主动脉组织中差异性表达的lncRNA,发现了一条丰富表达于血管组织、且在血管重构时表达升高的lncRNA。这条lncRNA具有物种间保守性,主要分布在血管中层平滑肌细胞中。为了直观显示lncPSR在血管中的组织分布,RNAscope被用来精确检测其组织定位,发现lncPSR在与VSMCs共定位的血管壁的中膜中高度富集(图1E)。RNAscope荧光检测也揭示了lncPSR的亚细胞定位,在VSMCs中,lncPSR主要分布在细胞质中(图1F)。

图1. RNAscope检测lncPSR在血管组织中的分布以及在血管平滑肌细胞(VSMCs)中的亚细胞定位。


在自发性高血压大鼠模型中,研究人员检测了lncPSR在高血压血管重构、颈动脉球囊损伤诱导的血管重构中均表达升高。为了更直观显示上调的lncPSR的组织定位,研究人员进一步利用RNAscope与免疫荧光共检测技术(ICW)检测了lncPSR与α-SMA(平滑肌肌动蛋白),揭示了上调表达的lncPSR主要存在于球囊损伤的大鼠颈动脉中VSMCs中(图2)。


图2. RNAscope与免疫荧光共检测揭示了上调表达的lncPSR主要存在于球囊损伤的大鼠颈动脉中VSMCs中。



RNAscope技术是由Bio-Techne旗下Advanced Cell Diagnostics (ACD)公司研发的RNA原位杂交产品,在近年来的生物检测领域发展迅速。与传统的RNA原位杂交相比,RNAscope技术属于新一代RNA原位杂交技术,其特异性的双Z探针设计避免了传统长链RNA探针的弊端,配以自身级联放大检测原理,可以高效敏感地检测到目标RNA。该方法的具体优势如下:


应用广泛

使用RNAscope技术,靶点RNA为大于等于300个碱基的特异序列,即可进行探针设计。因而RNAscope技术可以应用于几乎所有物种,所有组织以及所有基因的检测。

特异性强

RNAscope独特的双Z(ZZ) 探针设计有效的防止了探针的非特异性结合,同时降低了背景干扰。由于结合在非特异性位点的单个的Z 探针不会产生完整的信号放大分子结合位点,并会在杂交过程中被洗脱掉,从而防止非特异性信号的放大,使得探针的信号具有高度特异性。探针设计合成需要2~4周时间即可完成。

灵敏度高

RNAscope方法检测每个RNA 分子时,只需三对双Z(ZZ)探针即可完成杂交和信号的可视化。

单分子可视化和单细胞定量

使用RNAscope技术杂交上三对及以上双Z 探针即可在标准的显微镜下呈现可观察到的点状信号。ACD公司提供的分析软件更可以定量每一个单细胞内RNA 的表达水平。

兼容降解的RNA

由于RNAscope三对双Z探针即可检测到目标RNA,而通常针对靶点RNA设计的探针为20对双Z 探针,因而即使目标RNA发生部分降解,仍可以稳定有效地检测到靶点RNA。

检测结果稳定一致性

RNAscope技术用到的探针以及所有检测试剂全部由工业化合成,且该技术针对不同样本类型(冰冻切片, 石蜡切片,悬浮细胞,贴壁细胞等)已经有成熟的实验操作流程,故使得RNAscope技术检测结果具有稳定性和一致性。除了可以在实验室进行手工操作外,该产品也可以在Leica以及罗氏Ventana自动平台上运行,为结果的一致性和稳定性提供了可靠的依据。

多通道多靶点同时检测

由于RNAscope技术可以同时进行多通道探针杂交以及信号放大,故在可见光检测中可以在同一张切片上同时检测两个靶点;而在荧光检测过程中,可以在同一张切片上检测三个或三个以上靶点RNA。


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