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3月封面聚焦:首个癌变动态图谱,IL-18抑肿瘤机制,伤口愈合,新型细胞外囊泡,基因编辑应用…

3月封面聚焦:首个癌变动态图谱,IL-18抑肿瘤机制,伤口愈合,新型细胞外囊泡,基因编辑应用… 云南泽浩
2025-04-22
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导读:叮咚!封面文章如约而至!在这个月份里有哪些新的科研火花正在绽放呢?原文链接:https://www.cell


叮咚!

封面文章如约而至!

在这个月份里

有哪些新的科研火花正在绽放呢?



原文链接:https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(25)00061-3

来自中国医学科学院肿瘤医院的林东昕院士、吴晨教授、华中科技大学常江教授、北京师范大学王晓群教授以及中国科学院上海营养与健康研究所的Andrew Teschendorff教授在《Cancer Cell》上发表了题为“Single-cell multi-stage spatial evolutional map of esophageal carcinogenesis”的研究论文。

癌症的发展涉及癌细胞与周围微环境的共同进化,但这种相互作用在物理结构内的动态仍不清楚。

该研究构建了一份单细胞分辨率的空间转录组图谱,涵盖43名患者的127个多阶段视野,描绘了人类食管鳞状细胞癌(ESCC)的空间转录组图谱。研究发现,ESCC的进展是由一个获得去分化和侵袭性特征的增殖性上皮细胞亚群所驱动。在癌前病变晚期阶段,这些细胞通过JAG1-NOTCH1信号通路破坏上皮-间质界面,招募正常成纤维细胞并将其转化为癌症相关成纤维细胞(CAFs),形成了“CAF-Epi”(CAF和上皮细胞)微环境,帮助肿瘤逃避免疫监视。

CAF-Epi微环境的形成是ESCC及其他鳞状细胞癌进展和患者预后的关键指标。该研究为开发新的治疗策略提供了理论基础。

文中使用的Collagen Type I兔多抗(货号:14695-1-AP)、Collagen Type III (N-terminal)兔多抗(货号:22734-1-AP)、CXCL1兔多抗(货号:12335-1-AP)、CXCL8/IL-8兔多抗(货号:27095-1-AP)、Alpha Tubulin兔多抗(货号:11224-1-AP)、RBPJ兔多抗(货号:30044-1-AP)、MMP11兔多抗(货号:30615-1-AP)、VEGFA兔多抗(货号:19003-1-AP)、VEGF-C兔多抗(货号:22601-1-AP)、EPCAM/CD326兔多抗(货号:21050-1-AP),共10个抗体,均来源于Proteintech。


原文链接:https://www.nature.com/articles/s41590-024-02074-7

来自中国科学院上海免疫与感染研究所孟广勋课题组和上海交通大学医学院附属新华医院刘辰莹课题组在《Nature Immunology》上发表了题为“Short IL-18 generated by caspase-3 cleavage mobilizes NK cells to suppress tumor growth”的研究论文。

白介素18(IL-18)主要通过其由caspase-1切割产生的18 kDa成熟形式发挥作用,刺激NK细胞和T细胞的抗肿瘤反应。此外,IL-18也可以被其他蛋白酶切割,从而产生不同功能的片段。

研究发现,在癌细胞中,caspase-3切割IL-18生成短IL-18,该片段不被分泌,也不与IL-18Rα结合,而是进入细胞核。尽管短IL-18缺乏核定位信号,但能通过与核孔蛋白sec13相互作用进入细胞核。在小鼠肿瘤模型中,与野生型IL-18相比,短IL-18显著抑制了肿瘤生长,且这种抑制作用不依赖于IL-18Rα。进一步分析发现,短IL-18过表达时,肿瘤中的NK细胞被激活,从而抑制肿瘤生长。此外,临床样本分析显示,肿瘤组织中短IL-18的表达水平较低,而高表达短IL-18的患者预后更好。

综上所述,本研究揭示了短IL-18通过激活NK细胞抑制肿瘤生长的独特机制,为肿瘤免疫治疗提供了新的靶点和策略。

文中使用的NCAM1/CD56兔多抗,货号:14255-1-AP,来源于Proteintech。


原文链接:https://www.cell.com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(24)00412-0

来自瑞典的Ning Xu Landén团队和中国医学科学院皮肤病研究所的李冬青团队在《Cell Stem Cell》上发表了题为“Spatiotemporal single-cell roadmap of human skin wound healing”的研究论文。

伤口愈合是一个复杂的生物学过程,涉及炎症、增殖和重塑三个阶段。以人类皮肤研究伤口愈合将突破现有的基础动物模型研究,有助于临床的慢性疾病治疗。

研究团队通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组测序(ST-seq)技术,分析了健康志愿者皮肤伤口边缘组织在三个阶段(炎症期、增殖期和重塑期)的细胞动态变化,首次构建了人类皮肤伤口愈合的时空单细胞图谱。研究发现,FOSL1是角质形成细胞迁移的关键调节因子。在慢性伤口中,迁移性角质形成细胞显著减少,促炎性巨噬细胞和成纤维细胞的功能受损,导致再上皮化受阻、炎症反应不足和肉芽组织形成受阻。此外,研究还发现人类和小鼠在角质形成细胞迁移和增殖机制上存在显著差异。

这项研究提供了人类皮肤伤口愈合的详细时空单细胞图谱,揭示了关键的细胞类型和分子机制,为开发治疗慢性伤口的新疗法提供了潜在靶点。

文中使用的人ADAM17重组蛋白,货号:Ag32418,来源于Proteintech。


原文链接:https://www.nature.com/articles/s41556-025-01621-0

来自美国范德比尔特大学医学院的Dennis K. Jeppesen团队和Dylan T. Burnette 团队在《Nature Cell Biology》上发表了题为“Blebbisomes are large, organelle-rich extracellular vesicles with cell-like properties”的研究论文。

细胞外囊泡(EVs)是细胞间通讯的重要介质,参与多种生理和病理过程。尽管已有大量研究,但对EVs的认识仍不全面。

研究团队观察到细胞能够主动释放一种新型的细胞外囊泡,是目前已发现的最大尺寸(直径可达20 µm)。这些囊泡表现出明显的膜出芽行为,因此被命名为blebbisomes。与传统的EVs不同,blebbisomes包含有多种细胞器,包括功能性的线粒体和多囊泡内体,但缺乏可辨识的细胞核。研究团队发现,癌症细胞释放的blebbisomes富含免疫抑制因子,如PD-L1、PD-L2、B7-H3、VISTA、PVR和HLA-E。这些蛋白质可能有助于癌症细胞逃避免疫监视。

这项研究不仅揭示了一种新的细胞外囊泡类型,还为癌症治疗提供了新的潜在靶点。

文中使用的Cytokeratin 18鼠单抗(货号:66187-1-Ig)、TUFM兔多抗(货号:26730-1-AP)、TOM20兔多抗(货号:11802-1-AP)、RPS8兔多抗(货号:18228-1-AP)、PEX14兔多抗(货号:10594-1-AP),共5个抗体,均来源于Proteintech。


原文链接:https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.adr8941

来自瑞士洛桑大学Yannick D. Muller团队在《Science Translational Medicine》上发表了题为“T cell receptor precision editing of regulatory T cells for celiac disease”的研究论文。

乳糜泻是一种由麸质引起的慢性炎症性肠病,与人类白细胞抗原(HLA)DQ2.5等位基因密切相关。目前唯一的治疗方法是严格的终身无麸质饮食。因此,开发替代治疗方法,尤其是恢复对麸质的免疫耐受,是当前的研究重点。

研究团队通过CRISPR-Cas9和同源定向修复(HDR)将特定的T细胞受体(TCRs)导入调节性T细胞(Tregs),可以使其工程化效应T细胞(eTeffs)和调节性T细胞(eTregs)。在HLA-DQ2.5转基因小鼠模型中,口服麸质后小鼠体内eTeffs迁移至肠道派伊尔结(Peyer’s patches)和肠系膜淋巴结,并上调肠道归巢受体(CCR9和α4β7)。eTregs通过“旁观者抑制”机制,抑制不同表位特异性的eTeffs,且需抗原激活才能发挥功能。

这项研究为乳糜泻的治疗提供了新的思路,即通过基因编辑技术改造Tregs来恢复对麸质的免疫耐受。这种方法不仅具有潜在的临床应用价值,还为理解Tregs在自身免疫性疾病中的作用机制提供了新的见解。

文中使用的Phantom Dye Violet 450 死活细胞鉴定染料,货号:PD00004,来源于Proteintech。


原文链接:https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(25)00055-3

来自中山大学生命科学学院张锐团队在《MOLECULAR CELL》上发表了题为“Type III CRISPR-mediated flexible RNA excision with engineered guide RNAs”的研究论文。

大多数RNA编辑技术主要限于单碱基编辑。III型CRISPR复合体能够基于gRNA长度以6个核苷酸为增量来确定目标切割位置。然而,这种方法仅限于6-nt的倍数进行删除,限制了其在修复移码突变等应用中的潜力。

研究团队报道了一种名为SCISSOR的创新型技术,通过在gRNA中引入凸起环(bulge loops),可以绕过III型CRISPR系统的6-nt切割规则,实现更灵活的RNA切除。通过胞内验证,证实了引入1-nt或2-nt凸起环的gRNA能够实现对目标RNA的非6-nt间隔切割,同时编辑效率显著提高。研究团队进一步评估了SCISSOR在修复和引入移码突变的治疗潜力。以HEXA基因中导致Tay-Sachs病的4-bp插入突变为靶标,研究团队设计了移码突变,并在细胞模型中验证了其效果。另外研究团队引入移码突变,成功地在肿瘤细胞中生成了具有高度免疫原性的多肽,为癌症免疫治疗提供了新的可能性。

总的来说,SCISSOR技术在修复导致遗传性疾病的移码突变以及用于癌症免疫治疗方面显示出巨大的潜力。

文中使用的HA tag兔多抗(货号:51064-2-AP)、Vinculin兔多抗(货号:26520-1-AP)和GAPDH鼠单抗(货号:60004-1-Ig),均来源于Proteintech。


原文链接:https://www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(25)00068-0

来自中南大学湘雅医院皮肤科陈翔教授和印明柱教授、重庆大学三峡医院Xin Li团队在《Cell Reports Medicine》上发表了题为“BET inhibitor in combination with BCG vaccine enhances antitumor efficacy and orchestrates T cell reprogramming for melanoma”的研究论文。

黑色素瘤是一种高侵袭性皮肤癌,免疫治疗是其重要治疗手段。进一步提升治疗效果仍是当前研究的重点。

研究表明,其自主研发的溴化结构域(BET)蛋白抑制剂NHWD-870,与卡介苗(BCG)联合使用显著抑制了黑色素瘤的生长,效果优于单独使用。这种联合疗法通过增强T细胞的活性和功能,促进其增殖和细胞毒性,同时改善肿瘤免疫微环境,增加T细胞浸润并减少免疫抑制细胞比例。实验中,小鼠模型接种黑色素瘤细胞后,接受NHWD-870口服或BCG肿瘤内注射,结果显示联合治疗显著缩小肿瘤体积并延长生存时间。此外,联合疗法还通过调节T细胞功能,增强抗肿瘤免疫反应。

总而言之,NHWD-870与BCG的联合使用在黑色素瘤治疗中具有显著的协同效应,为未来黑色素瘤的免疫治疗提供了新的策略和方向。

文中使用的CDK2兔多抗(货号:10122-1-AP)和GAPDH鼠单抗(货号:60004-1-Ig),均来源于Proteintech。


原文链接:https://www.cell.com/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(25)00038-2

来自军事医学研究院周钢桥团队与国内众多团队在《Cell Genomics》上发表了题为“A highland-adaptation variant near MCUR1 reduces its transcription and attenuates erythrogenesis in Tibetans”的研究论文。

藏族人群在青藏高原极端低氧和寒冷环境中生活数千年,进化出独特的遗传适应性。此前研究已发现与高原适应相关的基因,如EGLN1和EPAS1,均与缺氧诱导因子通路有关。

本研究基于前期成果,对藏汉人群全基因组测序并扫描自然选择信号,发现MCUR1等新的高海拔适应候选基因。通过建立造血细胞谱系条件敲除Mcur1基因的小鼠模型,结合单细胞转录组测序和功能研究,团队首次证实MCUR1缺失在缺氧或常氧条件下均显著抑制红细胞生成。机制研究显示,MCUR1缺失降低线粒体钙离子内流,升高胞浆钙离子水平,激活CAMKK2激酶,进而调控AMPK-mTOR通路抑制红细胞生成。

该研究首次揭示MCUR1介导的线粒体钙离子稳态对红细胞生成的调控作用,解释了藏族人群红细胞生成先天性减少现象,为高原相关疾病如贫血、缺氧性红细胞增多症的诊治提供了新的靶点和思路。

文中使用的P62/SQSTM1兔多抗(货号:55274-1-AP)、PGC1a鼠单抗(货号:66369-1-Ig)、Raptor兔多抗(货号:20984-1-AP)、TFAM兔多抗(货号:19998-1-AP)、ULK1兔多抗(货号:20986-1-AP)、YY1鼠单抗(货号:66281-1-Ig)、Beta Actin鼠单抗(货号:60008-1-Ig)、NRF1/nuclear respiratory factor 1兔多抗(货号:12482-1-AP),8个抗体,均来源于Proteintech。


原文链接:https://doi.org/10.1038/s44318-024-00350-8

来自东京大学的Shoji Hata团队和Daiju Kitagawa团队在《EMBO JOURNAL》上发表了题为“Multimodal mechanisms of human centriole engagement and disengagement”的研究论文。

中心粒(centriole)是细胞中负责染色体精确分离的关键结构,通过复制产生与母中心粒(mother centriole)完全相同的子中心粒(daughter centriole)。子中心粒在完全成熟后才会从母中心粒解离,成为独立的功能性中心体(centrosome)。然而,未成熟的子中心粒如何避免过早解离的机制尚不明确。

研究团队确定了三种维持中心粒结合的关键机制:车轮(cartwheel)、环状(torus)和中心粒周围物质(PCM)。其中,环状结构在建立母子中心粒的特征性正交接合中起着关键作用。随着中心粒的成熟,由车轮和环状结构介导的接合逐渐释放。这一释放涉及子中心粒的结构变化,称为中心粒开花(bloom)和分离(distancing)。破坏这些结构转变会阻止后续步骤,从而防止在G1期分离和中心体转换。在细胞周期的不同阶段,中心粒接合的配置和机制会发生变化。例如,在早期S期,中心粒结合主要依赖于车轮结构;而在晚期S期和G2期,结合则依赖于Cep57、Cep57L1、Cep63和PCNT等蛋白。

这项研究提供了对成熟子中心粒如何逐步从母中心粒分离的全面理解,这对于确保中心粒的完整结构和向独立中心体的转换至关重要。

文中使用的Ninein兔多抗,货号:13007-1-AP,来源于Proteintech。


原文链接:https://www.nature.com/articles/s44161-025-00610-8

里约热内卢联邦大学Emiliano Medei 团队在《Nature Cardiovascular Research》上发表了题为“IL-1β enhances susceptibility to atrial fibrillation in mice by acting through resident macrophages and promoting caspase-1 expression”的研究论文。

心房颤动(AF)是最常见的心律失常疾病之一,与多种心血管事件风险增加有关。IL-1β是一种炎症介质,其表达水平升高与AF的发病率增加相关,但具体机制尚不明确。

研究团队发现IL-1β增加AF易感性,IL-1β处理的小鼠表现出心房纤维化增加,胶原蛋白沉积紊乱,以及β-折叠蛋白含量增加。研究证实IL-1β通过IL-1R活性在心脏驻留巨噬细胞中形成正反馈循环,增加caspase-1成熟和IL-1β转录,调节AF的发生发展。通过Csf1rcreIL-1rfl/fl小鼠模型,研究团队发现仅在驻留巨噬细胞中敲除IL-1R即可防止IL-1β诱导的AF易感性增加。

这些发现为靶向IL-1β/IL-1R信号转导治疗AF患者的潜力提供了新的见解,并强调了识别此类患者群体中不同潜在病因的重要性,这对于精准医疗的发展具有重要意义。

文中使用的Caspase 1/p20/p10兔多抗(货号:22915-1-AP)和IL-1 Beta鼠单抗(货号:66737-1-Ig),均来源于Proteintech。


原文链接:https://doi.org/10.1083/jcb.202306101

来自广州实验室徐涛团队和李总红团队、中科院生物物理所薛艳红团队和纪伟团队、中科院上海感染与免疫研究所酒亚明团队、广州海关技术中心卫生检疫研究所师永霞团队在《Journal of Cell Biology》上发表了题为“SARS-CoV-2 NSP3/4 control formation of replication organelle and recruitment of RNA polymerase NSP12”的研究论文。

SARS-CoV-2是一种正链RNA病毒,属于β冠状病毒家族。这种病毒进入宿主细胞后,产生16种非结构蛋白(NSPs),在病毒复制器的形成中起关键作用。双膜囊泡(DMVs)作为病毒RNA复制的场所,其复制转录复合物(RTC)锚定在DMV上,构成复制细胞器(RO),从而进行病毒基因组的转录和复制。

研究发现,NSP3的N端和C端结构域(NTD和CTD)对于DMVs的形成至关重要,而NSP4的CTD虽然不是DMVs形成所必需的,但它调节DMVs的数量。此外,NSP12通过与NSP3的NTD直接相互作用被招募到DMVs上,这一过程涉及NSP3的PLP2和PLnc结构域。研究也证实RTC(包括NSP12)定位于DMVs的细胞质面,而不是DMVs的内部。NSP3/4诱导的DMVs大小(约100 nm)小于病毒诱导的DMVs(约300 nm)。

这项研究提供了对SARS-CoV-2复制器形成机制的深入理解,特别是NSP3和NSP4在DMVs形成中的作用以及NSP12的招募机制。这些发现对于理解病毒复制的分子机制以及开发抗病毒策略具有重要意义。

文中使用的DYKDDDDK tag鼠单抗(货号:66008-4-Ig)、mCherry兔多抗(货号:26765-1-AP)、SARS-COV-2 NSP5兔多抗(货号:29286-1-AP)、SARS-COV-2 NSP12兔多抗(货号:29264-1-AP),HRP羊抗鼠二抗(货号:SA00001-1),共6个抗体,均来源于Proteintech。此外SARS-CoV-2 NSP12 / RdRp重组蛋白(货号:81354)来源于Proteintech独家代理品牌Active Motif。


原文链接:https://www.cell.com/structure/abstract/S0969-2126(25)00002-4

来自中国医学科学院的杨威团队在《Structure》上发表了题为“Computational design and improvement of a broad influenza virus HA stem targeting antibody”的研究论文。

广谱中和抗体 (nAbs) 是应对大流行和季节性流感威胁的重要治疗工具。优化nAbs的传统策略通常依赖于劳动密集型、高通量诱变筛选。

研究团队采用了一种创新的结构设计框架来优化nAbs,该框架集成了表位-抗原位分析、计算建模和合理设计方法,并辅以全面的实验评估。该方法被应用于优化MEDI8852,这是一种针对甲型流感病毒血凝素 (HA) 茎部的nAb。

在体内和体外实验中,优化后的M18.1.2.2在亲和力和中和活性方面均显示出显著增强。

这项研究提供了一种计算设计框架,用于优化针对流感病毒的广谱中和抗体。既提高了抗体的亲和力和中和活性,还在动物模型中验证了其保护效果,为开发基于抗体的流感治疗药物提供了新的策略。

文中使用的HRP-6*His, His-Tag直标抗体,货号:HRP-66005,来源于Proteintech。



以上是3月使用Proteintech产品发表的封面文章,共12篇。

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