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盘点十大细胞死亡及关键靶点检测技巧解析(下)

盘点十大细胞死亡及关键靶点检测技巧解析(下) 云南泽浩
2025-05-27
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导读:作为上期的延续(上期内容回顾),本期将介绍焦亡、铜死亡、双硫死亡、失巢凋亡、泛凋亡五种细胞死亡方式,及其关键


作为上期的延续(上期内容回顾),本期将介绍焦亡、铜死亡、双硫死亡、失巢凋亡、泛凋亡五种细胞死亡方式,及其关键靶标的实验技巧,篇幅较长,可跳转到感兴趣的主题哦~



Chapter6 细胞焦亡

1、什么是细胞焦亡?  

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细胞焦亡(Pyroptosis)是一种炎症性程序性细胞死亡,主要通过炎症小体依赖的经典途径(激活Caspase-1)或非经典途径(如Caspase-4/5/11)剪切Gasdermin家族蛋白(如GSDMD),剪切后的GSDMD-N端寡聚化并在细胞膜上形成孔道,导致细胞渗透压失衡、破裂,并释放IL-1β等促炎因子[1~2]。

其形态学特征主要表现为细胞膜上Gasdermin蛋白介导的孔洞形成,导致细胞肿胀、膜破裂并释放内容物,同时伴随核浓缩(但无典型核碎裂)和细胞器膨胀,最终细胞膜完整性丧失并引发强烈的炎症反应[3~5]。

细胞焦亡与多种疾病密切相关,包括感染性疾病、自身免疫性疾病、心血管疾病和癌症等,过度或持续的细胞焦亡可通过放大炎症反应导致组织损伤,而靶向调控焦亡通路已成为相关疾病治疗的潜在策略[6~7]。

图1.png

图1 细胞焦亡的经典和非经典途径


2、GSDMD、Caspase 1检测技巧解析 

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  • GSDMDGasdermin D

GSDMD(消皮素D)是细胞焦亡的关键执行者,当细胞受到病原体感染或危险信号刺激时,炎症小体(如NLRP3、AIM2等)被激活,进而激活Caspase-1(经典途径)或Caspase-4/5/11(非经典途径)。活化的Caspase切割GSDMD,释放其N端结构域(GSDMD-N),该片段易位至细胞膜并寡聚化,形成孔道,导致细胞渗透压失衡、肿胀破裂,释放炎症因子和细胞内容物,引发强烈炎症反应[1~5]。

组织表达特异性:广泛表达于几乎所有类型的组织和细胞中。

分子量:GSDMD存在多种蛋白形式,包括约53 kDa的GSDMD前体、约31 kDa的剪切体GSDMD-N(活性形式)、约22 kDa的剪切体GSDMD-C等。

亚细胞定位:GSDMD以无活性的全酶形式(53 kDa)定位于细胞质,GSDMD-N端定位于细胞膜内侧(质膜)。

GSDMD检测Tips

1. 样本制备时使用含蛋白酶抑制剂的裂解液,防止降解;
2. GSDMD-N易聚集,建议使用新鲜样本,避免反复冻融;
3. 全长GSDMD(53 kDa)和GSDMD-N(31 kDa)建议用12-15% SDS-PAGE,确保清晰分离;
4. 剪切体GSDMD-C约22 kDa,是前体经Caspase-1剪切后产生的活性片段,可直接作用于细胞膜诱导细胞焦亡。
5. 由于GSDMD的打孔功能主要由N端执行,需要适当的诱导才能产生活性片段。故在检测GSDMD-N时,建议需设置合理的阳性和阴性对照,并同时检测全长前体蛋白,有助于准确判断变化趋势。例如使用LPS+Nigericin(NLRP3炎症小体激活,诱导GSDMD切割)处理,或者Caspase抑制剂(如Z-VAD-FMK)来阻断对GSDMD的切割,抑制GSDMD-NT生成[8]。
6. 抗体货号20770-1-AP只能识别全长GSDMD,不能识别剪切体。
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使用GSDMD抗体的WB(80918-1-RR)和IF(20770-1-AP)检测图

  • Caspase-1

Caspase-1(半胱天冬酶-1)是一种关键的炎症相关蛋白酶,属于半胱氨酸蛋白酶家族。当细胞感知病原体感染或危险信号时,Caspase-1被激活并切割Gasdermin D(GSDMD),释放其N端结构域(GSDMD-N),后者在细胞膜上形成孔道,导致细胞渗透性肿胀、内容物释放,最终引发细胞焦亡。同时,Caspase-1还剪切并激活IL-1β和IL-18前体,促进这些炎性因子的分泌,放大免疫应答[9]。

组织表达特异性:广泛表达于几乎所有类型的组织和细胞中。

分子量:酶原形式(Pro-caspase-1)的分子量为45 kDa,激活后会自身切割形成两个亚基:p20亚基(约20 kDa,与炎症小体复合物结合的关键片段)和p10亚基(约10 kDa)。

亚细胞定位:无活性的酶原(pro-caspase-1)形式主要位于细胞质。

Caspase 1检测Tips

1. 样本制备时使用含蛋白酶抑制剂的裂解液,Caspase-1活性易受降解影响,需在冰上操作,防止降解;
2. 建议使用新鲜样本,避免反复冻融;
3. 全长Caspase-1(~45 kDa)和活化片段p20(20 kDa)、p10(10 kDa)的WB检测建议用12-15% SDS-PAGE,确保各条带清晰分离;
4. 在检测Caspase-1片段以评估细胞焦亡水平时,设置合理的阳性和阴性对照至关重要,以确保实验的特异性和结果的可靠性。例如使用LPS + Nigericin(NLRP3炎症小体激活,诱导Caspase-1切割和焦亡)处理或者caspase抑制剂(如Z-VAD-FMK)来阻断对阻断Caspase-1活性[8]。
5. 抗体货号22915-1-AP/81482-1-RR既可以测到全长形式的Caspase-1(45kDa),又可以测到剪切形式。
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使用Caspase-1抗体的WB(81482-1-RR)和IHC(22915-1-AP)检测图


3、焦亡相关抗体推荐

焦亡主要由Gasdermin家族蛋白(如GSDMD)介导。关键靶点包括NLRP3炎症小体、Caspase-1/4/5/11等,它们激活后切割GSDMD,释放其N端结构域在膜上形成孔洞,导致细胞肿胀破裂并释放IL-1βIL-18等炎症因子。

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Chapter7 铜死亡

1、什么是铜死亡?  

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铜死亡代表一种独特的细胞死亡方式,其过程涉及对铜离子的依赖、脂酰化蛋白的积累以及铁硫簇蛋白的减少,导致细胞发生不同于氧化应激相关的细胞死亡(如凋亡、铁凋亡和坏死)的新型调节性细胞死亡。

在正常情况(铜稳态)下:铜离子在细胞内保持稳态,主要依赖于三个铜转运蛋白SLC31A1、ATP7A以及ATP7B。SLC31A1负责摄入铜,并依赖ATP7A/B负责转出铜,从而维持细胞内铜离子的动态平衡;

在非正常情况下:铜离子在依赖线粒体呼吸的细胞中发生累积,并通过与硫辛酰化DLAT结合,致使其发生异常的寡聚,形成不溶性DLAT,诱导细胞死亡;另一方面,FDX1能够将铜离子还原成更加具有毒性的一价铜离子,抑制铁硫簇蛋白的合成,从而诱导细胞死亡[10]。

图2 铜死亡[12]


2、SLC31A1、FDX1检测技巧解析 

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  • SLC31A1

SLC31A1是细胞膜上的铜转运蛋白,负责铜离子的跨膜运输。其功能缺失会导致线粒体铜耗竭,进而影响能量代谢。 

组织表达特异性:广泛表达,多种肿瘤组织中表达水平上调。

分子量:计算分子量为21 kDa,实际检测分子量为21-25 kDa,35-40 kDa,60-70 kDa。

亚细胞定位:细胞膜(多次跨膜蛋白)。

SLC31A1检测Tips:

1. SLC31A1通常以三聚体形式存在于细胞内,但在WB检测过程中需注意其复杂的蛋白形式。除了可观察到60-70 kDa(三聚体)和35-40 kDa(部分解聚形式),还包括28 kDa(糖基化单体)和24 kDa(非糖基化单体),17 kDa(C端片段)[11]。
2. 在收集细胞时,不建议用胰蛋白酶消化,避免目的蛋白被胰酶切割。可在培养瓶或培养皿内直接裂解,也可以刮细胞后再裂解。
3. 对于跨膜蛋白而言,煮沸的样品可能会致使蛋白质聚集,因此更推荐在不煮沸条件下进行处理,例如在4℃-37℃条件下进行处理;
4. 此外也可以在样品缓冲剂中保留部分还原剂,如β-巯基乙醇或二硫苏糖醇等,可能有助于消除部分二硫键。
5. 推荐使用膜蛋白提取试剂盒进行样本制备(货号:PK10015)。
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使用SLC31A1抗体的KO验证图(83844-5-RR)和IF(27499-1-AP)检测图

  • FDX1

FDX1主要参与线粒体内的电子转移过程,是铜死亡过程中的核心靶标之一。它在铜离子载体(如elesclomol)诱导的铜死亡中起关键作用。FDX1能够将Cu²⁺还原为Cu⁺,这种还原形式的铜具有更高的细胞毒性。此外,FDX1还通过促进DLAT的硫辛酰化,使DLAT与Cu⁺结合并寡聚化,导致蛋白质毒性应激和细胞死亡。

组织表达特异性:正常组织中表达,脑组织中高表达,在部分肿瘤组织中表达水平降低。

分子量:14-19 kDa。

亚细胞定位:主要定位于线粒体,内质网和细胞质中也有所表达。

FDX1检测Tips:

1. FDX1分子量较小,建议使用高浓度分离胶(12%~15%)进行分离,推荐使用0.22um转印膜转膜;
2. 保留全膜,避免裁切时蛋白丢失。
3. FDX1蛋白的表达量较丰富,正常组织和肿瘤组织均表达。
4. 推荐使用线粒体分离及蛋白提取试剂盒进行提取(货号:PK10016)。
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使用FDX1抗体(82957-1-RR)的KO验证和IF检测图


3、铜死亡相关抗体推荐

铜死亡是一种铜依赖性细胞死亡方式,主要由过量铜离子与线粒体三羧酸循环(TCA)中的脂酰化蛋白DLAT结合,导致蛋白聚集和毒性应激,引发细胞死亡。关键靶点包括FDX1(铁氧还蛋白1)、LIAS(脂酰转移酶)及DLAT(二氢硫辛酰胺转乙酰酶)。

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Chapter8 双硫死亡

1、什么是双硫死亡?  

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双硫死亡 (Disulfidptosis)是由于细胞内二硫化物(如胱氨酸)异常积累而引发的一种程序性细胞死亡形式。当SLC7A11高表达的癌细胞,在葡萄糖饥饿条件下,NADPH合成减少,从而抑制了胱氨酸向半胱氨酸的转化过程。导致胱氨酸的大量积累。大量二硫化物的积累,从而引发了细胞死亡,即双硫死亡[13,14]。

图3 双硫死亡与胞内二硫化物氧化还原过程的分子机制[13]


2、SLC7A11/xCT、GLUT1检测技巧解析 

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  • SLC7A11/xCT

SLC7A11(也称为 xCT)是一种参与胱氨酸摄取的膜转运蛋白。它可以保护细胞免受氧化应激,维持细胞氧化还原平衡,并防止脂质过氧化引起的细胞死亡;SLC7A11已被确定为癌症治疗的潜在靶点。 

组织表达特异性:SLC7A11在肝癌、肺癌、胰腺癌、恶性胶质瘤中表达均增高。

分子量:SLC7A11的预估分子量约为55 kDa,主流分子量在35-40 kDa,可能为截短形式。

亚细胞定位:通常定位于细胞膜。

SLC7A11/xCT检测Tips

1. WB优化建议

(1)样本处理:SLC7A11是跨膜蛋白,建议上样前避免常规煮沸(100℃),可尝试不煮样或37℃煮样,以防止蛋白聚集。

(2)分子量注意:理论分子量约55 kDa,但实际检测中常出现35-40 kDa 条带(可能为截短形式)。

2. IF检测优化

(1)固定与通透:SLC7A11为多次跨膜蛋白,需先固定(如4% PFA)后通透,建议使用温和通透剂(如Digitonin、Saponin 或低浓度的Triton X-100),避免过度破坏膜结构。

(2)抗体选择:优先推荐IF验证通过的抗体。

3. 其他建议

(1)阳性对照:使用高表达SLC7A11的细胞(如细胞系Hela)作为对照。

(2)刺激处理:可尝试erastin处理(抑制xCT功能)。

(3)推荐使用膜蛋白提取试剂盒进行样本制备(货号:PK10015)。

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使用SLC7A11抗体的WB(26864-1-AP)、IHC(26864-1-AP)和IF(82115-2-RR)检测图

  • GLUT1

GLUT1,也被称为SLC2A1,是一种普遍表达的葡萄糖转运蛋白,在大多数细胞类型中负责葡萄糖摄取的基础水平,人红细胞表达GLUT1的水平最高。缺陷是导致1型和2型GLUT1缺乏症的原因。据报道,GLUT1的高表达是青少年血管瘤的可靠免疫组织化学标志物。

组织表达特异性:在红细胞中检测到。在许多人体组织中以不同水平表达。

分子量:主流分子量是50kDa。由于该蛋白是多次跨膜蛋白,且存在糖基化和磷酸化修饰,实际检测MW在43 kDa至55 kDa,且可能出现多条带。

亚细胞定位:通常定位于细胞膜。

GLUT1实验检测技巧

1. WB优化建议

(1)样本处理:GLUT1是跨膜蛋白,常规煮沸可能导致蛋白聚集,建议尝试不煮样或37℃煮样。

(2)GLUT1是多次跨膜蛋白,且存在糖基化和磷酸化修饰,在43 -55 kDa之间可能检出多条带。

2. IF检测优化

(1)固定与通透:GLUT1为多次跨膜蛋白,需先固定(如4% PFA)后通透,建议使用温和通透剂(如Digitonin、Saponin 或低浓度的Triton X-100),避免过度破坏膜结构。

(2)抗体选择:优先推荐IF验证通过的抗体。

3.推荐使用膜蛋白提取试剂盒进行样本制备(货号:PK10015)。

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使用GLUT1抗体(81463-1-RR)的WB和IHC检测图


3、双硫死亡相关抗体推荐

双硫死亡机制涉及NADPH耗竭导致二硫化物应激,使肌动蛋白(如SLC7A11、ACTB)发生异常二硫键交联,破坏细胞骨架稳定性,最终引发细胞死亡。

工作簿(71)_Sheet2.jpg

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Chapter9 失巢凋亡

1、什么是失巢凋亡?  

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失巢凋亡(Anoikis,希腊语为“无家可归者”)是一种特殊的细胞程序死亡,它是由细胞与细胞外基质或相邻细胞脱离接触而诱发的。当正常细胞失去对细胞外基质的粘附时,就会发生细胞凋亡,因为机体阻止了细胞之间的错误接触。

然而,肿瘤细胞具有转移特性,它失去对细胞外基质的粘附后,会产生耐药性,也称为失巢凋亡抗性(anoikis resistance)。在不粘附到细胞外基质的情况下也可以存活,并且可以通过血液和淋巴液流向其他组织和器官进行粘附和转移[15]。

图4 细胞与细胞外机制粘附丧失的细胞进程[15]


2、FAK、PI3K p110 Beta检测技巧解析 

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  • FAK

FAK(Focal Adhesion Kinase,黏着斑激酶)是一种非受体酪氨酸激酶,在细胞信号转导中起着关键作用。它广泛存在于真核细胞中,参与细胞黏附、迁移、增殖、存活以及细胞周期调控等多个生物学过程。FAK的异常激活与肿瘤细胞的侵袭、转移、增殖和凋亡抑制密切相关。

组织表达特异性:肿瘤中的高表达和在正常组织中的低表达。

分子量:100-120kDa和40-60kDa。

亚细胞定位:主要位于细胞质,细胞核和细胞外基质也有表达。

FAK检测Tips

1. FAK易发生降解,建议使用新鲜样本,并添加蛋白酶抑制剂,避免反复冻融。
2. FAK存在剪切和异构体形式,分子量范围在100-120kDa和40-60kDa。
3. FAK定位于黏着斑,建议4%多聚甲醛或-20℃冰乙醇固定后通透,注意避免过度透化。
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使用FAK抗体的WB(81334-5-RR)和IF(12636-1-AP)检测图

  • PI3K p110 Beta

PI3 Kinase p110 Beta(磷脂酰肌醇3激酶p110β)是PI3K(磷脂酰肌醇3激酶)家族中的一个催化亚基,属于Class IA PI3Ks。PI3Ks在细胞信号传导中起着关键作用,通过生成磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸(PIP3)来调节多种细胞过程,包括细胞生长、存活、迁移和代谢。PI3K是FAK激活的蛋白之一,它反过来招募并激活其下游靶蛋白激酶B (PKB/Akt)[16]。

组织表达特异性:p110β在多种组织和细胞类型中广泛表达。

分子量:110-130 kDa。

亚细胞定位:位于细胞质、细胞核。

PI3 Kinase p110 Beta检测Tips

1. PI3K p110 Beta预估分子量为123 kDa,主流分子量为110-130 kDa。
2. 通常PI3K是由调节亚基p85和催化亚基p110组成的异二聚体。p110目前鉴定出4个催化亚基,分别是PIK3CA(p110α)、PIK3CB(p110β)、PIK3CD(p110δ)和PIK3CG(p110γ)。建议选择特异性识别的抗体。
3. 20584-1-AP特异性识别PIK3CB。
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使用PI3 Kinase p110 Beta抗体的WB(67121-1-lg)、IHC和IF检测图(20584-1-AP)


3、失巢凋亡相关抗体推荐

失巢凋亡关键靶点包括FAK/PI3K通路抑制Bcl-2家族失衡(如Bim上调)、caspase级联反应(如caspase-3/8)等。该机制可阻止细胞异常迁移,若失调则促进肿瘤转移。EMT过程可通过激活ERK/MAPK或NF-κB通路来协助癌细胞抵抗失巢凋亡。

工作簿(67)_Sheet1.jpg

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Chapter10 泛凋亡

1、什么是泛凋亡?  


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PANoptosis(泛凋亡)是一种新定义的PCD,于2019年首次提出,同时涉及焦亡(P)、凋亡(A)和坏死(N)的关键分子。与其他形式类似,它可以被多种触发因素刺激,如病毒、细菌和细胞因子。与细胞凋亡相反,PANoptosis是一种类似于焦亡和坏死的炎症过程,导致细胞膜破坏,细胞因子和损伤相关分子模式(DAMPs)的释放[17]。

图5.png

图5 凋亡、焦亡、坏死性凋亡的分子机制(左);泛凋亡复合体(PANoptosome)组分(右)[17]


2、Caspase 8检测技巧解析 

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  • Caspase 8

Caspase-8是调控泛凋亡(panoptosis)的关键分子,作为细胞凋亡的启动酶,它既能激活经典凋亡通路(切割caspase-3),也可通过抑制RIPK3/MLKL通路阻断坏死性凋亡(necroptosis)。在泛凋亡复合体(panoptosome)中,Caspase-8与炎症小体组分(如NLRP3)协同作用,整合凋亡、焦亡和坏死性凋亡信号,触发混合型细胞死亡并释放大量炎症因子,参与抗感染和肿瘤免疫调控。

组织表达特异性:在多种组织中广泛表达。

分子量:约55 kDa。

亚细胞定位:位于细胞质和细胞核。

Caspase-8检测Tips

1. 样本制备时使用含蛋白酶抑制剂的裂解液,Caspase-8活性易受降解影响,需在冰上操作,防止降解;
2. 建议使用新鲜样本,避免反复冻融;
3. 天然全长的Caspase-8通常以非活性酶原形式存在,经剪切后可形成活性异二聚体(如43/57 kDa)。
4. 抗体货号13423-1-AP 可以识别全长55kD左右的Caspase-8,也可以识别Caspase-8被剪切后产生的45kD(mouse)或43kD(human)。
5. 结构研究表明, 所有的Caspases都具有相同的基本催化折叠结构。其活性形式是特定的二聚体,但是初始形式(酶原)的潜在形式是单体形式,效应子形式是二聚体。在活化和/或成熟过程中,催化区域被切割成大的(-20kDa)和小(-10kDa)亚基;它们一起形成特征性(p20/p10)2全酶。
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使用Caspase-8抗体的WB(85171-3-RR)、IHC和IF检测图(13423-1-AP)


3、泛凋亡相关抗体推荐

泛凋亡核心靶点包括PANoptosome复合体(含ZBP1、RIPK1、caspase-8等),通过激活caspase-3/8(凋亡)、GSDME(焦亡)和MLKL(坏死性凋亡)等效应分子,协同触发炎症性细胞死亡。

工作簿(71)_Sheet3.jpg

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以上是十种细胞死亡形式,及其热门靶标检测技巧,希望能够给从事相关研究的老师们一些帮助!

下期预告:我们将继续解细胞增殖研究及关键靶点检测技巧。欢迎持续关注,下期见~


参考文献

[1] Shi, Jianjin et al. “Cleavage of GSDMD by inflammatory caspases determines pyroptotic cell death.” Nature vol. 526,7575 (2015): 660-5. 

[2] Kayagaki, Nobuhiko et al. “Caspase-11 cleaves gasdermin D for non-canonical inflammasome signalling.” Nature vol. 526,7575 (2015): 666-71. 

[3] Liu, Xing et al. “Inflammasome-activated gasdermin D causes pyroptosis by forming membrane pores.” Nature vol. 535,7610 (2016): 153-8. 

[4] Shi, Jianjin et al. “Pyroptosis: Gasdermin-Mediated Programmed Necrotic Cell Death.” Trends in biochemical sciences vol. 42,4 (2017): 245-254. 

[5] Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018.” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541. 

[6] Jorgensen, Ine, and Edward A Miao. “Pyroptotic cell death defends against intracellular pathogens.” Immunological reviews vol. 265,1 (2015): 130-42. 

[7] You, Ruixuan et al. “Pyroptosis and Its Role in Autoimmune Disease: A Potential Therapeutic Target.” Frontiers in immunology vol. 13 841732. 25 May. 2022,

[8] Zhang, Bao-Li et al. “Inhibition of GSDMD activation by Z-LLSD-FMK or Z-YVAD-FMK reduces vascular inflammation and atherosclerotic lesion development in ApoE-/- mice.” Frontiers in pharmacology vol. 14 (2023): 1184588. 

[9] Li, Yang, and Qianzhou Jiang. “Uncoupled pyroptosis and IL-1β secretion downstream of inflammasome signaling.” Frontiers in immunology vol. 14 (2023): 1128358. 

[10] Tsvetkov P, Coy S, Petrova B, et al. Copper induces cell death by targeting lipoylated TCA cycle proteins. Science. 2022 Mar 18;375(6586):1254-1261.  

[11] Petris MJ. The SLC31 (Ctr) copper transporter family. Pflugers Arch. 2004 Feb;447(5):752-5. 

[12] Tsui KH, Hsiao JH, Lin LT, et al. The Cross-Communication of Cuproptosis and Regulated Cell Death in Human Pathophysiology. Int J Biol Sci. 2024 Jan 1;20(1):218-230.

[13]  Liu, Xiaoguang et al. Cystine transporter regulation of pentose phosphate pathway dependency and disulfide stress exposes a targetable metabolic vulnerability in cancer. Nature cell biology vol. 22,4 (2020): 476-486. 

[14] Liu, Xiaoguang et al. Actin cytoskeleton vulnerability to disulfide stress mediates disulfidptosis. Nature cell biology vol. 25,3 (2023): 404-414.  

[15] Han YH, Wang Y, Lee SJ, et al. Regulation of anoikis by extrinsic death receptor pathways. Cell Commun Signal. 2023 Sep 4;21(1):227.

[16] Paoli P, Giannoni E, Chiarugi P. Anoikis molecular pathways and its role in cancer progression. Biochim Biophys Acta. 2013 Dec;1833(12):3481-3498. 

[17] Chen S, Jiang J, Li T, Huang L. PANoptosis: Mechanism and Role in Pulmonary Diseases. Int J Mol Sci. 2023 Oct 19;24(20):15343. 

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