重磅消息
虽然小编的朋友圈前段时间被2017年诺贝尔奖霸屏了。但今天还是想为大家带来一篇核酸研究领域中的重磅消息——2017年10月3日，纽约的GenomeWeb发布了一篇报道题为：“International Barcode of Life Project to Expand, Switch From Sanger to PacBio Sequencing”。报道依据来源于加拿大圭尔夫大学生物多样性基因组学中心总监Paul Hebert领导的约有100名研究人员在BioRxiv上发布的报告。
iBOL是类似于人类基因组计划的重大国际合作计划，涉及十几个国家的生物多样性中心的合作，其目的是在地球上建立可用于识别每个物种的短基因序列（DNA条形码），并将DNA条形码收集在生命数据系统（BOLD）数据库中。iBOL项目于2010年底启动，截止2015年夏季BOLD数据库已登记50万个物种的约500万份样本。他们的目标是对世界上多细胞生物进行测序建立条码，这将涉及数十亿个样本的条形码测序。如果依然采用Sanger测序方法，该项目的预估成本至少是20亿美元。研究团队希望通过新的测序技术来减少这个数字。起初研究团队尝试用二代测序代替Sanger。但研究结果表明：“短读长测序技术因高错误率、系统性误差限制其在该方面的应用；尽管最近研究结果表明illumina和Ion torrent平台在分析1kb左右扩增子时准确度有所改善，但后期数据拼接会影响最终数据质量，假基因及同源区域严重影响数据分析结果；此外，用这些平台的检测成本也仅仅比Sanger 低3-4倍。”
众所周知，曾获诺贝尔奖的Sanger测序技术可谓经久不衰，被誉为测序行业金标准。为啥iBOL要由Sanger向PacBio测序过渡呢？其中缘由且听小编娓娓道来。
BioRxiv上发布的文献报告描述了测试PacBio Sequel平台的试验项目，作者提到了该转变的原因，小编提炼出来以下关键点。
成本！成本！成本！
重要的事情说三遍
报告共测试了20,000多个动物标本，对每个样品658bp的COI（线粒体细胞色素C氧化酶I）基因扩增子进行测序。通过添加barcode，一个SMRT cell可同时运行多达10,000个样品。与Sanger相比，Sequel平台进行扩增子检测可以将每个样本测序成本降低约40倍。且随着明年Sequel通量的提升，每个样本的测序成本可进一步降低。
高低GC区域均一覆盖
2
无GC偏好性
项目测试的20,000个扩增子样品，每个样品COI基因区域在物种之间的GC含量均不同。因PacBio SMRT测序技术对单个DNA分子进行测序，不涉及PCR扩增，高GC或高AT区域同样均一覆盖。使用Sanger测序，总是需要手动查看文件以获得完整的读取数据，而Sequel平台则不需要。
与Sanger媲美的准确度
3
CCS测序模式
Hebert表示，最初接触PacBio Sequel是chi表示怀疑的，研究团队感兴趣的区域是650bp到900bp 的扩增子，Sequel平均10 kb读长对于其而言是过度的。然而，当他们发现Sequel平台的CCS（circular consensus sequencing）测序模式，可通过对同一序列进行多次检测，自我矫正，数据一致性准确率极高，他们非常感兴趣。测试结果表明Sequel所得序列的准确度可与Sanger相媲美，有时甚至更好。
Hebert说：“我们现在正逐步减少使用Sanger测序服务，明年我们将完全致力于用Sequel测序建设生命条形码图书馆。”他们已经安装了一个Sequel平台，并计划在2018年再引进至少一台。
好了，小编的解析到此为止，如此强大的研究利器，您是否心动了呢？预知更多进展请锁定基因快讯公众号，小编会定期剖析Sequel平台的最新进展。
基因有限公司作为Pacific Biosciences公司在中国区的独家代理商，自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内，一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训，技术支持，应用培训与售后维护工作，赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。
