
NGS文库的构建过程中,多个步骤的产物需要被纯化,如片段化、末端修复、接头连接及PCR扩增后(取决于文库构建方法),磁珠法纯化由于操作简便而倍受青睐。
大家可能比较熟悉的就是Beckman的AMPure XP Beads,AMPure XPBeads原是极好的
,可是对于不是土豪的我们,价格太贵了
。
德国老牌核酸纯化厂家MN公司也推出了用于NGS建库的磁珠片段选择试剂盒,效果和AMPure XP一样好
,现在就聊聊基因有限公司代理的这一款产品,合适的话,就约吧。
NGS上机前往往要经过双重选择,去除过大和过小的片段来保证测序的通量不被浪费,需要经过这么一个过程:

之所以使用磁珠有效的对核酸片段进行片段选择和纯化,主要因为使用不同比例的(磁珠:样本)比例会改变不同片段大小的DNA和磁珠的结合能力。下表展示了在使用不同比例(磁珠:样本)时,得到的各个片段长度(100bp-1000bp)的回收率。大家可以和手头上的AMPureXP磁珠比一比,是否性能很相近啊?

为了证明自己磁珠也是极好的,MN厂家蛮拼的
,做了不少平行测试
。
测试方法就是使用Truseq DNA PCR Free Kit(Illumina)产生文库进行纯化,比较不同厂家产品结果。
图A为1μg大肠杆菌DNA进行片段化后分布,将其作为文库构建样本,图B分别使用AMPure XP(蓝色),Illumina(红色)和MN(绿色)产品纯化650bp片段,得到的回收率峰图。图C和图D为比较三者纯化文库片段的覆盖度和插入片段大小。以您的脑力,理解这几张图,毫无压力吧。


今天给大家介绍了MN磁珠法做NGS建库的片段选择和纯化产品,它能够有效纯化1000bp以下的核酸片段,以更经济的支出,达到同样的实验效果,所以,可以说是更优的选择。
大家对这款产品感兴趣
,请立刻联系我们
。
那么对于需要做1000bp以上核酸片段选择和纯化的客户,我们下次就聊聊FlashGel™ DNA Recovery System吧,期待中,
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感谢您的关注与阅读,有任何问题,请联系基因有限公司销售人员,或在本微信回复进行咨询。


