全长转录组测序(Iso-Seq)是基于单分子实时测序技术,凭借超长读长的优势,无需打断RNA分子,直接对反转录的全长cDNA测序,即可得到从5’末端到3’PolyA尾的高质量全长转录本序列,从而对同源异构体(isoform)、可变剪接、融合基因、同源基因、超家族基因、等位基因表达等进行精确分析。
基因有限公司独家代理的美国 PacBio公司推出的快速建库试剂盒2.0(SMRTbell Express Template Prep Kit 2.0 PN 100-938-900 ),兼容多种文库类型。近期,快速建库试剂盒 2.0 用于Iso-Seq测序中前期文库构建的完整实验操作流程(Iso-Seq Express)已发布,使得Iso-Seq 的实验开展更容易,更快速。
在Iso-Seq Express 流程中,官方还提供文库构建所需的Oligo试剂盒(Iso-Seq Express Oligo Kit,PN: 101-737-500),搭配 NEB 的 Next Single Cell/Low Input RNA Library Prep Kit (E6420S/E6420L) 开展相应实验。
采用Iso-Seq Express方案建库,在Sequel II测序系统上测序,单张测序芯片产出最高可达400 Gb, 一张芯片即可深度表征全部转录本信息,成本大幅降低。此外,在Sequel系统上采用最新的3.0试剂测试,单张芯片产出高达30 Gb。
下调RNA需求量
Iso-Seq Express方案对RNA投入量需求为300ng,较之前流程下调了3倍
2
简化操作流程
快速建库试剂盒2.0 建库在一个管中进行,最大程度减少文库的损失
3
缩短实验周期
一天内即可完成从RNA到SMRTbell 测序文库的制备工作
4
无需片段大小筛选
无需额外用BluePippin 或 SageELF 进行片段大小筛选,改用 Promega 的 ProNex bead(替代AMPure PB bead)来灵活调整所需的转录本尺寸
BetaSite1 (US)
“Just to let you know my first plant sample looks amazing as well. Fantastic!
Never got this much data and long polymerase read length. cDNA length is also way better than any previous data.”
“只是为了让你知道我的第一个植物样本看起来也很棒。太棒了!
从来没有得到这么多的数据和这么长的酶读长。cDNA长度也比以前的数据更好。”
Beta Site 2 (EU)
“They were blown away by the data output from this run. Customer is thrilled”
“他们被这次运行的数据输出所震惊。客户很激动”
Beta Site 3 (EU)
“This kit is a clear improvement when making IsoSeq libraries”
“快速建库试剂盒明显提升了Iso-Seq文库的制备工作”
Beta Site 4 (US)
“Love how quick the protocol is! Any chance we can get a targeted protocol
similar to this?”
“多么快速方便的Iso-Seq建库流程啊!希望后续进一步提供类似的靶向测序方案。”
Iso-Seq Express方案支持多达12个样品的混样测序,以进一步节省成本。这对于研究不同组织,不同时间点或不同实验条件下基因表达的多样性的科研人员特别有利。此外,改进的SMRTLink 7.0 分析软件缩短您的分析周期。
完整的Iso-Seq Express 操作流程请点击"阅读原文"下载...
基因有限公司作为PacBio公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内,一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。

