什么是PacBio HiFi reads?
PacBio HiFi reads是准确度超过Q20(>99%),并且还能兼顾超过10kb,甚至可达20 kb的长读长。因而包括基因组 de novo 组装,结构变异,甚至是单碱基变异(Single Nucleotide Variant,SNV)在内的变异,都能通过HiFi reads进行复杂的基因组学分析。为了让大家能够更深入的了解HiFi reads在基因组学研究中的强大应用优势,我们特别邀请您参加于3月27日上午举办的PacBio研讨会,届时通过多位专家的介绍,您将了解到
运用HiFi reads来进行包括人类在内的多种生物的基因组组装将会何等的简便。
如何运用连续性,完整性和正确性来评估HiFi组装的数据质量
Google AI如何为PacBio HiFi数据再次训练高度准确检测SNV和Indel的软件DeepVariant
PacBio HiFi数据如何提升Genome in A Bottle Benchmark中的基因组数据库质量。
使用PacBio HiFi Reads
进行基因组组装和变异检测
3月27日 星期五 11:00 AM
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主讲人及内容简介
Andrew Carroll,Ph.D.
Product Lead, Genomics
Google AI
Google的Andrew Carroll博士,他将会介绍Google AI团队如何针对PacBio HiFi数据对DeepVariant进行训练。所得的DeepVariant模型可实现与短读长测序方法相同的精度,并且HiFi数据可以检测那些短读长测序难以检测的基因组区域。他还将探讨PacBio HiFi数据如何提升Genome in A Bottle Benchmark中的基因组数据库质量。
Sarah Kingan,Ph.D.
Staff Scientist, Bioinformatics Applications
PacBio
PacBio的生信应用专家Sarah Kingan博士将介绍使用PacBio HiFi Reads进行从基因组从头组装的最新工作。她将重点介绍HiFi数据在碱基水平的准确性,单倍型定相和生信分析方面的优势。在从人到植物的样本中,她将对用于HiFi组装和定相的各种工具进行基准测试,包括新扩展的FALCON-Unzip组装工具。
Billy Rowell
Sr. Bioinformatics Scientist, Bioinformatics Applications
PacBio
William(Billy)Rowell是PacBio生物信息学应用团队的高级生物信息科学家。他致力于改善长读长测序数据中SNP和small Indel的检测和定相。他与Google DeepVariant团队合作进行了HiFi模型的改进和评估,并与Genome in A Bottle联盟合作改善了SNP和small Indel基准测试。他在经典模型生物遗传学,行为神经遗传学和人类遗传学方面拥有丰富的经验。Billy 将参与此次线上研讨会的答疑。
近期,PacBio中文在线讲座陆续进行,如果您也有运用PacBio技术获得了不错的研究结果,或者基于PacBio数据开发了相应的分析工具,希望与大家分享,我们也非常欢迎您与我们联系。
联系人:张 烨
zhangye@genecompany.com
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基因有限公司作为PacBio公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内,一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。

