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在线研讨会 | 使用PacBio HiFi Reads进行基因组组装和变异检测

在线研讨会 | 使用PacBio HiFi Reads进行基因组组装和变异检测 基因快讯
2020-03-23
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导读:3月27日上午PacBio HiFi数据专门研讨会!你想知道的HiFi都在这里!

什么是PacBio HiFi reads?

PacBio HiFi reads是准确度超过Q20(>99%),并且还能兼顾超过10kb,甚至可达20 kb的长读长。因而包括基因组 de novo 组装,结构变异,甚至是单碱基变异(Single Nucleotide Variant,SNV)在内的变异,都能通过HiFi reads进行复杂的基因组学分析。为了让大家能够更深入的了解HiFi reads在基因组学研究中的强大应用优势,我们特别邀请您参加于3月27日上午举办的PacBio研讨会,届时通过多位专家的介绍,您将了解到

  • 运用HiFi reads来进行包括人类在内的多种生物的基因组组装将会何等的简便。

  • 如何运用连续性,完整性和正确性来评估HiFi组装的数据质量

  • Google AI如何为PacBio HiFi数据再次训练高度准确检测SNV和Indel的软件DeepVariant

  • PacBio HiFi数据如何提升Genome in A Bottle Benchmark中的基因组数据库质量。


 使用PacBio HiFi Reads

进行基因组组装和变异检测


3月27日 星期五 11:00 AM

北京时间

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 主讲人及内容简介 



Andrew Carroll,Ph.D.

Product Lead, Genomics

Google AI


Google的Andrew Carroll博士,他将会介绍Google AI团队如何针对PacBio HiFi数据对DeepVariant进行训练。所得的DeepVariant模型可实现与短读长测序方法相同的精度,并且HiFi数据可以检测那些短读长测序难以检测的基因组区域。他还将探讨PacBio HiFi数据如何提升Genome in A Bottle Benchmark中的基因组数据库质量。


Sarah Kingan,Ph.D.

Staff Scientist, Bioinformatics Applications

PacBio


PacBio的生信应用专家Sarah Kingan博士将介绍使用PacBio HiFi Reads进行从基因组从头组装的最新工作。她将重点介绍HiFi数据在碱基水平的准确性,单倍型定相和生信分析方面的优势。在从人到植物的样本中,她将对用于HiFi组装和定相的各种工具进行基准测试,包括新扩展的FALCON-Unzip组装工具。


Billy Rowell

Sr. Bioinformatics Scientist, Bioinformatics Applications

PacBio


William(Billy)Rowell是PacBio生物信息学应用团队的高级生物信息科学家。他致力于改善长读长测序数据中SNP和small Indel的检测和定相。他与Google DeepVariant团队合作进行了HiFi模型的改进和评估,并与Genome in A Bottle联盟合作改善了SNP和small Indel基准测试。他在经典模型生物遗传学,行为神经遗传学和人类遗传学方面拥有丰富的经验。Billy 将参与此次线上研讨会的答疑。



近期,PacBio中文在线讲座陆续进行,如果您也有运用PacBio技术获得了不错的研究结果,或者基于PacBio数据开发了相应的分析工具,希望与大家分享,我们也非常欢迎您与我们联系。

联系人:张  烨

zhangye@genecompany.com

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      基因有限公司作为PacBio公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内,一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。







【声明】内容源于网络
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基因生物技术国际贸易(上海)有限公司拥有仪器,试剂,市场与技术支持,售后等各部门组成的完整体系,是国内生命科学领域主要供应商之一,代理国际一流的高科技产品。积极利用公众号,进行最新资讯的共享,希望得到您的关注和支持。
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