污染物鉴定界面
图1:Acclaro智能样本检测技术鉴定的DNA污染的RNA光谱,以及校正的RNA浓度和光谱(黄色)
图2所示为dsDNA和RNA应用AcclaroTM智能样本检测技术可以识别的污染物。
图2:可以识别的dsDNA和RNA中的污染物
Part 01.
一、RT-qPCR实验
图4显示当RNA中掺入gDNA时对Cq值的影响。与对照组相比,不管模板使用校正浓度还是原始浓度构建的两组PCR体系,其Cq值均升高。使用校正浓度构建的PCR体系,其Cq值仍然高于对照组,因为样品中仍然存在gDNA污染。
AcclaroTM智能样本检测技术可以鉴定RNA样本中DNA污染,但结果表明,必须在RT-qPCR之前对RNA进行纯化,以提高准确性和重复性。
图4:RNA中的DNA污染对Cq值的影响
Part 02.
二、qPCR实验
图5显示当DNA中掺入RNA时对Cq值的影响。与对照组相比,不管模板使用校正浓度还是原始浓度构建的两组PCR体系,其Cq值均有误差。使用校正浓度构建的PCR体系,其Cq值低于对照组,因为样品中仍然存在RNA污染。
Acclaro™智能样本检测技术可以鉴定DNA样本中RNA污染,但结果表明,必须在qPCR之前对DNA进行纯化,以提高实验的准确性和重复性。
图5:DNA中的RNA污染对Cq值的影响
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