七、硅酸盐菌剂
硅酸盐菌剂主要是利用硅酸盐细菌，如胶质芽孢杆杆菌等有效菌制成的活体微生物制品。它是从土壤中分理出的一种细菌，能够分解伊利石、钾长石、磷灰石等不溶性的硅铝酸盐无机矿物质，促进难溶性的钾、磷、硅等养分元素转化成可溶性养分，增加土壤中速效养分的含量。硅酸盐细菌又称为钾细菌，是目前微生物肥料中广泛应用的一种重要功能菌。解钾细菌能将土壤中的不溶性钾素溶解并供植物吸收，并且会将施入土壤中一时用不完的钾吸收，避免可溶性钾肥遇到大雨冲刷或大水浸灌时流失，大大提高钾肥的利用率，具有溶钾、保钾及保肥的功能。有的钾细菌除了解钾和保钾功能外，还能分泌一定的植物激素和小分子营养物质，促进生长、保花保果，提高作物品质。
硅酸盐菌剂适合于作基肥，与有机肥混施覆土；也可用于拌种，加适量水制成悬液喷在种子上拌匀；还可用于蘸根，蘸后立即栽植避免阳光直射。
八、溶磷菌剂
溶磷菌剂是既能把土壤中缓效态的磷转化为能被作物直接吸收利用的有效态磷，又能分泌激素刺激作物生长的活体微生物制品。溶磷菌能利用微生物在繁殖和代谢过程中产生的乳酸、柠檬酸等低分子有机酸和植酸酶类物质，使固定在土壤中的无机磷酸盐溶解、有机磷酸盐矿化或将难溶性磷酸盐类变成可溶性磷，供植物吸收利用。如芽孢杆菌属、假单胞菌属、氧化硫硫杆菌、AM菌根菌、节杆菌属、胞杆菌属。其中，发现最早、溶磷效果最好、应用最广泛的解磷巨大芽孢杆菌。可用于拌种，随用随拌；用作追肥时，宜在作物开花前使用。
溶磷菌剂根据分解底物不同可分为：有机磷菌剂和无机磷菌剂。有机磷菌剂是指在土壤中能分解卵磷脂、核酸、植素等有机态磷化物的有益微生物发酵制成的活体微生物制品；无机磷菌剂是指能把土壤中惰性的、不能被作物直接吸收利用的无机态磷化物，溶解转化为作物可以吸收利用的有效态磷的活体微生物制品。
解磷细菌一般还具有降解有机磷的作用，减少含磷农药的农药残留毒性。并有促进微量元素吸收的功能，能大大提高磷肥的有效性和植物对微量元素的需求。
九、光合菌剂
光合菌剂主要是用光合细菌制成的活体微生物制品。光合细菌是指能利用小分子有机物合成作物所需的养分，并产生促生长因子，激活植物细胞的活性，使植物提高光合作用能力并增加产量的一类细菌。光合细菌具有固碳、固氮、氧化分解硫化物和胺类等有毒物质、改善水质、分解有机质、抗病的生理生态特征。光合细菌在农作物上施用具有独特功效，比其他微生物肥料更具有综合效应；不但能作种肥，固定氮气生成氨，同时还能与其他根瘤菌联合固氮，甚至在黑暗条件下能分解许多有机化合物，促进土壤、肥料中某些养分有效化，从而改善土壤结构和养分状况；且富含生理活性物质，进行叶面喷施，可改善植物营养，增强植物生理功能和抗病能力，从而起到增产和改善品质的作用。
十、有机物料腐熟剂
有机物料腐熟剂是指能加速各种有机物料（包括农作物秸秆、畜禽粪便、生活垃圾及城市污泥等）分解、腐熟的微生物活体制剂。按腐熟对象可分为农作物秸秆腐熟剂和畜禽粪便腐熟剂，其中前者要求纤维素酶活性≥30.0U/g（ml），注重降解纤维素的效果；后者要求蛋白酶活性≥15.0U/g（ml），注重降解蛋白质的效果。按产品形态的不同可分为液体剂、粉剂、颗粒剂三种剂型。其中液态产品要求有效活菌数≥1.0亿个/ml；粉剂、颗粒剂产品要求有效活菌数≥0.50亿个/g。
有机物料腐熟菌是不致病的微生物，含有一种或多种能降解纤维素、木质素、蛋白质等大分子的酶类。在适合的温度和湿度下，附着于秸秆表面的腐熟菌，分泌纤维素酶，将纤维素分解成小分子的葡萄糖，并吸收这些糖类进入菌体细胞称为进一步繁殖所需要的能量和组成新菌体的物质。腐熟菌分泌的木质素酶分解木质素，土壤中的微生物利用木质素分解产生的小分子物质合成腐殖酸。腐熟菌分泌蛋白质酶将蛋白质分解为小分子的氨基酸，可以直接被植物吸收。微生物菌体分泌不同酶分解秸秆中的大分子物质形成葡萄糖、氨基酸等小分子物质时，还会产生许多含碳中间产物，小分子量的可以被植物直接吸收，这些能被吸收的含碳物质常被俗称为“碳肥”。
十一、植物根际促生菌（PGPR）菌剂
PGPR菌剂主要是用植物根际促生菌制成的活体微生物制品。促生菌是自由生活在土壤或附生于植物根基的一类可促进植物生长、防治病害、增加作物产量的有益菌类。植物根际促生菌简称PGPR，又名增产菌或多效菌剂。主要作用是分泌植物促生物质、促生豆科植物结瘤、促进植物出芽、对土传病害进行生物调控；可使寄主植物更好的摄取移动性弱的养分元素，扩大根的吸收面积，保护根部免受病原菌的侵袭，产生阻抑其他微生物的类似抗生素的物质等。植物根际促生菌既可单独使用，也可与其他微生物肥料复合实用，使促生、肥效作用更好的结合起来，以提高和加强应用效果。PGPR中尤其以荧光假单胞菌中的某些菌株和芽孢杆菌属的某些菌株效果最明显，用它们处理种子，对防治水稻纹枯病、稻瘟病、小麦全蚀病、猝倒病、棉花枯萎病及蔬菜的根腐病效果显著。
PGPR根据它们生活方式的不同可以分为三类：生长在植物根际周围的独立存在的微生物，定殖在根表面的微生物和定殖在植物根内的内生菌。PGPR制剂主要通过调控植物内的激素、产生挥发性有机物、改善营养元素有效性、提高植物对非生物胁迫耐受性4种方式，实现其生物刺激素的功效。PGPR制剂具有菌种种类多、功能多样和应用范围广的特点。
十二、丛枝菌根（AM）真菌制剂
以丛枝菌根（AM）真菌为生产菌种制成的微生物制剂产品，称之为丛枝菌根（AM）菌根制剂。丛枝菌根是一类在陆地生态系统中广泛分布，能够与绝大多数高等植物根系形成共生体系的重要土壤微生物。
丛枝菌根真菌制剂具有以下5个方面的功效：一是AM菌根制剂能缓解植物对干旱产生的胁迫作用。在AM菌根植物良好共生的植物根系中，AM真菌根外菌丝延伸能超过植物根际的枯竭区，使根部在水缺乏环境中，吸收更充足的磷、锌和铜等难移动的营养元素，以及靠根系无法获得的水分；二是AM菌根制剂可缓解植物对盐产生的胁迫作用，提高植物的抗盐能力；三是AM菌根制剂可缓解植物对营养缺乏的胁迫作用，以磷尤为明显；四是AM菌根制剂可降低植物对重金属的吸收；五是AM菌根制剂可提高植物对土壤不良pH的适应及生长能力。
由于AM真菌是专性活体营养生物种类，不能自主独立繁殖，要借助植物体才能完成其生长周期。生产实践中常采用在露地种植或大棚种植植物的根部中接种AM真菌繁殖体，经过生长繁殖后获取AM的接种物的方法。这是AM真菌扩繁最为经济和简捷的方法。该方法的要点是，将接种AM真菌的寄主植物栽培在砂质土壤中，使AM真菌在土中繁殖；在生长周期结束后，将菌根和含有AM真菌繁殖体的土壤都收集起来，干燥并用作接种物。
