“多快好省”！一招搞定多样本检测！- 大数跨境

Biolinker

2022-08-19

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经过前两期的介绍，相信大家对BD Rhapsody单细胞多组学平台的强大功能有了一定的了解。今天小编给大家带来一位新朋友：BD单细胞多样本标签试剂盒（Single cell multiplexing kit, SMK）。这个样本标签可对多个样本进行标记，实现多样本同时上机实验，有效降低单细胞实验成本，减少批间差带来的影响，提高效率。

BD单细胞多样本检测试剂盒

突出亮点：

✪样本通量大：单次检测通量大12samples/run。

✪效率高：单次实验可以完成1-12个样本同时检测，相比传统方法，仅用到1/12的时间。

✪成本低：最多可12个样本同时检测，相比传统方法，每个样本显著降低建库建库成本、节约测序成本。

✪减少批间差：在同一次实验中进行，各样本没有批间差，利于样本间对照分析。

BD单细胞多样本检测基本原理

SMK试剂由通用抗体偶联寡核苷酸序列（Sample tag，Poly A尾巴）组成，通用抗体通过与细胞表面抗原结合来实现样本标记，之后在基因捕获环节又被磁珠捕获（磁珠上的寡核苷酸链尾端为Poly dT，与SMA Poly A尾巴互补结合），如下图示意，从而使得sample tag与UMI、CL一一对应，在最终的数据分析中可以根据sample tag来判断每个基因来自哪个样本。

Sample tag：特异性标记不同样本；CL – 特异性标记不同细胞；UMI：特异性标记不同基因;

SMK试剂结构及磁珠捕获原理

BD单细胞多样本检测工作流程

使用BD SMK试剂对不同的样本分别进行标记后，将样品混合（单次最多混合12个），一起上样到同一个BD Rhapsody微孔板（Cartridge）中后，一次检测即可对多个样品进行分析。

光说不练怎么行，接下来小编给大家介绍一个具体案例，一起来看看碧迪医疗多样本标签的优势吧！

应用案例

BD单细胞多样本检测

研究需要对两种细胞：A20（B 细胞）和EL4（T 细胞）进行分析。A20和EL4各6个样本，预期捕获的细胞数40 000，实际上样时，包含细胞的微孔数为43 336，同时存在细胞和磁珠的微孔数38 731，细胞捕获率达89.37%。

混合样本同时上样，到同一个BD Rhapsody微孔板中进行检测，示意图如下。

每种带样本标签（Sample tag）的细胞被检测的数量及在被检细胞中的比例如下，多细胞（multiplet）与不确定细胞（undetermined）会明显区分。

每个样本的检测情况

分析结果显示，去除多细胞前的数据：B细胞和T细胞分别聚集在一起，多细胞和不确定细胞形成第三簇(下图a黑色圈中)。样本分析的特异性可达97.82%，灵敏度达99.08%。去除多细胞和不确定细胞后：使用SeqGeq™软件进行二次分析，如下图混合样本结果分成了2个不同的亚群(下图b)。这些数据显示，碧迪医疗单细胞多样本检测方法有助于识别来自不同样本的多细胞数据，相比传统单个样本的检测能显著降低批间差。