胸主动脉瘤和夹层(TAAD)是一类起病隐匿,危及生命的疾病。该类疾病在每100,000人中就有6-10例患者,主要表现为胸主动脉内侧层退化,主动脉破裂后会导致患者死亡。目前TAAD主要依靠手术治疗,缺乏有效的靶向药物来预防和缓解。
2022年2月,中国医学科学院阜外医院周洲与舒畅团队在Cell Discovery(IF=38.079)上发表题为“Single-cell RNA sequencing identifies an Il1rn+/Trem1+ macrophage subpopulation as a cellular target for mitigating the progression of thoracic aortic aneurysm and dissection”的研究论文。
该工作利用基于微孔原理的BD Rhapsody单细胞多组学平台,对不同疾病时期的TAAD小鼠模型进行大规模单细胞转录组分析(scRNA-seq),系统地揭示了该疾病在发病及进展过程中的细胞、分子改变,同时发现Il1rn+/Trem1+巨噬细胞亚群有望作为缓解胸主动脉瘤和夹层进展的潜在细胞靶点。
● BD Rhapsody单细胞多组学分析系统
#633701 Rhapsody单细胞成像仪
#633702 Rhapsody上样工作站
● BD Rhapsody全转录组分析
#633801 BD Rhapsody全转录组扩增试剂盒
#664887 Rhapsody enhanced Cartridge配套试剂盒
#633733 Rhapsody Cartridge试剂盒
#633773 Rhapsody 反转录试剂
● BD Rhapsody全转录组分析Pipeline(Version 1.5.1)
▸解析胸主动脉中细胞异质性

Figure1. scRNA-seq分析TAAD进展过程中胸主动脉的细胞异质性
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▸通过细胞比例差异分析,揭示与TAAD进展相关细胞群的显著变化
接下来作者对实验组和对照组小鼠数据进行差异化分析,结果发现一些与TAAD进展相关的细胞群细胞数目发生了改变。相比对照组,血管平滑肌细胞(SMC)在实验组显著减少,而巨噬细胞则显著增加。

Figure2. 差异比例分析显示与TAAD进展相关的显著增加或减少的细胞群
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▸TAAD中平滑肌细胞显著减少,且与巨噬细胞的相互作用减少


Figure3. TAAD的平滑肌细胞数目减少,与巨噬细胞的细胞通讯减少
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▸TAAD的巨噬细胞具有异质性

Figure4. TAAD中的巨噬细胞的三个亚群 - 抗炎巨噬细胞,呈递型巨噬细胞和促炎巨噬细胞
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▸靶向抑制促炎巨噬细胞亚群可缓解TAAD
Figure5. 靶向抑制Trem-1可降低主动脉破裂率,缓解TAAD
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这项研究内容指出了在TAAD中抗炎症治疗的重要性,并且指出IL1RN+/TREM1+巨噬细胞亚群是TAAD进展的有害分子主要来源,而靶向阻断TRME+巨噬细胞则为TAAD的治疗提供了新的思路。在这项研究中,BD Rhapsody单细胞平台发挥了重要作用,快速准确地捕获了上万个单细胞并进行测序,全面解析了TAAD不同时间点转录组的变化情况,为深入研究TAAD疾病进展和治疗提供了依据,为寻找新的靶向治疗药物奠定了基础。
领克生物致力于新一代高通量测序技术(NGS)的应用和推广、生信分析、临床辅助诊断、产前检测、转化医学研究等领域。
业务包括单细胞多组学测序、基因组重测序、外显子测序、WGBS、RRBS、转录组测序、LncRNA测序、miRNA测序、ATAC-seq、CUT&Tag、Hi-C、4C-seq、m6A测序等前沿技术服务、各类组学数据的个性化分析服务以及临床疾病的辅助诊断、产前检测等。
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