EZ-editor™
基因拷贝数评估系统
基因不致死但就筛不到纯合子?有没有可能是所选细胞的核型太复杂,基因拷贝数太高!
今天,小源来给大家分享第三个基因编辑小工具——EZ-editor™基因拷贝数评估系统。该系统基于1000种细胞的基因组测序结果,涵盖20000+基因,智能计算基因拷贝数,选择最佳细胞轻松获得纯合子!
基因拷贝数评估系统-视频纯享版
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举个例子—文字简略版
进入红棉基因编辑系统(https://www.rc-crispr.com),在工具栏处选择“EZ-editor™基因拷贝数评估系统”。
进入后,在空栏输入基因名称或ID检索,如基因:TMED2,从匹配结果中选择您想要查询的基因。输入细胞名称,从检索结果选择您想要查询的细胞,如HCT116。组织来源会根据您选择的细胞自动匹配。
稍等片刻,便可查看结果。
我们可以看到,该基因展示结果为低拷贝,表示获取KO纯合子难度低。
如果展示中拷贝或高拷贝,则表示获取纯合子难度中等或难度较高。
左图是基因拷贝数的柱状图,横坐标表示拷贝数,纵坐标表示细胞种类数量
展示该基因在所有细胞中的拷贝数分布情况。
右图以环状图的形式,展示该基因在所选细胞中的拷贝数,在所选组织的细胞和所有细胞中的拷贝数水平低、中、高的细胞占比。
下方是我们划分拷贝数水平高低的标准。
往下拉则是该基因在不同组织中的平均拷贝数分布情况,快速找到拷贝数较高的组织或拷贝数低的组织。
还可查看该基因在所选组织的不同细胞中的拷贝数, 根据颜色划分可以辨别在该细胞中的拷贝数高低。
好啦,本期基因拷贝数评估工具系统使用介绍就先到这里,还有什么疑问欢迎找小源交流。此外,小源还给大家准备了基因风险评估系统,基因表达量评估系统等基因编辑小工具的介绍视频,欢迎大家查阅噢!
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