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视频教程丨轻松上手,一键评估基因拷贝数!

视频教程丨轻松上手,一键评估基因拷贝数! 源井生物
2024-10-25
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导读:4500+KO细胞产品低至¥4980,定制¥8888起。


EZ-editor™

基因拷贝数评估系统

基因不致死但就筛不到纯合子?有没有可能是所选细胞的核型太复杂,基因拷贝数太高!


今天,小源来给大家分享第三个基因编辑小工具——EZ-editor™基因拷贝数评估系统。该系统基于1000种细胞的基因组测序结果,涵盖20000+基因,智能计算基因拷贝数,选择最佳细胞轻松获得纯合子!




基因拷贝数评估系统-视频纯享版

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举个例子—文字简略版

进入红棉基因编辑系统(https://www.rc-crispr.com),在工具栏处选择“EZ-editor™基因拷贝数评估系统”。


进入后,在空栏输入基因名称或ID检索,如基因:TMED2,从匹配结果中选择您想要查询的基因。输入细胞名称,从检索结果选择您想要查询的细胞,如HCT116。组织来源会根据您选择的细胞自动匹配。

稍等片刻,便可查看结果。


我们可以看到,该基因展示结果为低拷贝,表示获取KO纯合子难度低

如果展示中拷贝或高拷贝,则表示获取纯合子难度中等或难度较高。


左图是基因拷贝数的柱状图,横坐标表示拷贝数,纵坐标表示细胞种类数量

展示该基因在所有细胞中的拷贝数分布情况


右图以环状图的形式,展示该基因在所选细胞中的拷贝数,在所选组织的细胞和所有细胞中的拷贝数水平低、中、高的细胞占比


下方是我们划分拷贝数水平高低的标准。


往下拉则是该基因在不同组织中的平均拷贝数分布情况,快速找到拷贝数较高的组织或拷贝数低的组织。


还可查看该基因在所选组织的不同细胞中的拷贝数, 根据颜色划分可以辨别在该细胞中的拷贝数高低。


好啦,本期基因拷贝数评估工具系统使用介绍就先到这里,还有什么疑问欢迎找小源交流。此外,小源还给大家准备了基因风险评估系统,基因表达量评估系统等基因编辑小工具的介绍视频,欢迎大家查阅噢!


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源井生物是一家专注于细胞基因编辑研发与生产的国际化高新技术企业,目前已为全球范围内超40个国家的科研单位和工业客户提供基因编辑技术服务与相关产品。 “让基因编辑更简单”是源井的企业目标,我们将以务实、高效、坦诚和守信的态度服务好每一位客户!
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