基因型分析系统
EZ-editor™基因型分析系统
想在细胞转染后快速评估基因编辑效率，以便及时调整实验方案？
想不进行繁琐的T克隆，即可区分单克隆的基因型？
源井独家研发的红棉·CRISPR基因编辑系统--基因型分析系统操作视频来啦!本系统可以帮助您在
pool阶段:分析基因编辑效率，智能获取不同基因型和所占比率；
单克隆阶段:迅速读取基因测序结果，获取筛选的克隆基因型情况，阳性克隆一目了然!
基因型分析系统－视频纯享版
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PS.在分析结果时，如果遇到多基因型的情况，但又不清楚是怎么回事？可以看看小源往期干货【KO细胞多基因型是怎么回事？】，帮您解开疑惑！
举个例子—文字简略版
进入红棉基因编辑系统（https://www.rc-crispr.com），在工具栏处点击“EZ-editor™基因型分析系统”即可进入。
1、输入样本名称，如果不输入则默认以实验组测序文件的名字为样本名称
2、输入1-3条不带有PAM（protospacer adjacent motif）位点的gRNA序列
3、如果基因编辑的类型是点突变，输入一段16-300bp的Donor序列
4、调整indel max size，基因编辑的最大范围，也就是gRNA切割位点前后多少个碱基可能出现编辑。（一般使用系统默认值）
5、点击此框上传对照组的Sanger测序文件，或者直接将文件拖拽到此框中。（一般为靶点验证测序文件）
6、点击此框上传实验组的Sanger测序文件，或者直接将文件拖拽到此框中。
完整输入如图所示，点击提交。
结果分析
分析界面参数及备注
① 处为样本名称
② Status表示分析结果是否成功
③ Guide Targets为gRNA序列
④ PAM Sequences表示PAM序列
⑤ Indel%代表发生编辑的基因型的总占比
⑥ R²表示分析结果的可信度
⑦ Knockin-Score/Knockout-Score：如果是点突变则为Konckin-Score，它的值为所有点突变的基因型的占比之和；如果是敲除，则为Knockout-Score，它的值为所有敲除碱基个数是非3倍数的基因型的占比之和
⑧ Indel：WT表示该基因型为野生型占比为64%，g1（+1）则表示gRNA1敲入了1个碱基且占比为26%
⑨ Contribution：表示每种基因型的占比
⑩ SEQUENCE：每种基因型的序列
⑪ More：点击此按钮可以查看切割位点附近的峰图和Indel分布图。
基因编辑的情况：WT表示该基因型为野生型占比为64%，g1（+1）则表示gRNA1敲入了1个碱基且占比为26%
基因编辑的情况：WT表示该基因型为野生型占比为5%，g1（+1）则表示gRNA1敲入了1个碱基且占比为48%，HDR表示该基因型是点突变占比是45%
好啦，本期基因型分析系统使用介绍就先到这里，还有什么疑问欢迎找小源交流。
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