基因表达量评估系统
如果某个基因在一些细胞中的表达水平很低，这可能表明该基因在这些细胞中功能相对较弱。如果进行KO或干扰，与野生型相比，两者蛋白差异可能并不明显。如果对该基因进行过表达，细胞可能会表现出明显的表型变化。
那有没有好用的工具可以用于评估基因表达量呢？今天小源来给大家分享第二个基因编辑小工具，EZ-editor™基因编辑工具之基因表达量评估系统。该系统是基于红棉RNA-seq数据库开发的，一种用于评估基因在细胞中表达水平的工具。数据库包含1400多种细胞系的转录本测序结果，涵盖近20000个基因。通过STAR比对和RSEM转录本定量计算出TPM值（Transcripts Per Kilobase Million），并将TPM值划为4个等级，用于指导细胞基因编辑项目开展的价值。
基因表达量评估系统－视频纯享版
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举个例子—文字简略版
首先输入红棉基因编辑系统网址（https://www.rc-crispr.com），进入后，在侧边点击工具栏，选择EZ-editor™基因表达量评估系统在空栏上输入基因名或基因ID（PTPRN），从匹配结果中选择想要查询的基因。再输入想要查询的细胞（A549），如暂不清楚想要查询什么细胞，该处可不填，仅查看该基因在1400+细胞中表达量的大致情况。输入基因和细胞之后，组织来源可自动匹配，如果未匹配到也可以手动选择。
稍等片刻，跳转结果页面。结果显示，PTPRN基因在A549细胞中不表达，不建议做KO。
左图是基因表达量的密度图，展示该基因在所有细胞中的表达量分布。
右图以环状图的形式，展示该基因在所选细胞中的表达量TPM值，在所选组织的细胞和所有细胞中的四个表达水平的细胞占比。下方是划分表达水平高低的标准。
除此之外，我们还可以查看该基因在不同组织中的平均表达量， 快速找到表达水平较高的组织或表达水平低的组织。
还可以选择不同的组织，查看组织细胞的基因表达量。
该基因在所选组织的不同细胞中的表达量TPM值，根据颜色划分可以识别出在该细胞中的表达水平高低。
好啦，本期基因表达量评估工具系统使用介绍就先到这里，还有什么疑问欢迎找小源交流。此外，小源还给大家准备了基因风险评估系统，基因拷贝数评估系统，基因型分析系统等基因编辑小工具的介绍视频，欢迎大家观看噢！
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