1.蛋白条带分辨率低，泳道有纵向条纹且不直
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 泳道的蛋白上样量过高 | 减少蛋白上样量。为了获得理想的分辨率，在 10、12、15 或 17 孔的小型胶中，建议的最大样品上样量为每条带 0.5 μg，或者每泳道约 10-15 μg 细胞裂解物。 |
2.样品过粘，样品泳道边缘有纵向条纹，哑铃型条带，泳道变宽
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 样品中盐离子浓度过高（硫酸铵） | 进行透析以降低盐浓度。推荐使用微量透析工具 |
| 电泳前，将样品浓缩并重新溶解于低盐缓冲液中。使用小体积的浓缩管。 | |
| 确保样品中的盐浓度不超过 100 mM。 |
3.蛋白质聚集导致形状诡异的狭窄泳道
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| DNA 污染——细胞裂解液中的基因组 DNA 可能导致样品变粘，导致蛋白质聚集，从而影响蛋白质迁移模式和分辨率 | 上样前先去除基因组 DNA 以降低粘度。 |
4.泳道宽度不一致，泳道变宽
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 样品中盐离子浓度过高（氯化钠）。高盐浓度会导致电导率增加，从而影响蛋白质迁移，并可能导致蛋白质条带扩散到包含正常盐浓度样品的相邻泳道中 | 进行透析以降低盐浓度。推荐使用微量透析工具，例如 Slide-A-Lyzer MINI 透析装置，0.5 mL。 |
| 电泳前，将样品浓缩并重新溶解于低盐缓冲液中，使用小体积的浓缩管。 | |
| 确保样品中盐浓度不超过 100 mM。 | |
| 凝胶电泳中去垢剂浓度过高（例如 SDS 或 Triton X-100）。 去垢剂与凝胶中的阴离子去垢剂 SDS 形成混合胶团，并向下迁移到凝胶中；它们会干扰 SDS-蛋白质的结合平衡 |
大多数非离子型去垢剂（例如 Triton X-100、NP-40 和 Tween 20）会干扰 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）。保持 SDS 与非离子型去垢剂的比例在 10：1 或更大，以最小化这些影响。 |
| 使用去垢剂去除柱或 样品前处理试剂盒去除多余的去垢剂。 | |
| 高浓度的 RIPA 缓冲液会导致泳道变宽并在电泳过程中出现明显的条纹 | 电泳前稀释样品，以降低裂解缓冲液的终浓度，防止缓冲液带来的不利影响。 |
5.泳道边缘有阴影
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 裂解液或样品缓冲液中的还原剂过多 | SDS-PAGE中，还原剂 DTT（二硫苏糖醇）和 TCEP（三（2-羧基乙基）膦）的终浓度应小于 50 mM， β-ME（β-巯基乙醇）还原剂的终浓度应小于 2.5％。 |
化学发光免疫印迹常见问题
1.非特异性或弥散条带
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 抗体浓度过高 | 降低抗体浓度，特别是一抗的浓度。 |
| 凝胶上样量过高 | 减少凝胶上加入的样品量。 |
| 化学发光底物的信号太强 | 减少印迹的成像或曝光时间。 |
| 更换特异性更好的抗体。 | |
| 缩短膜与底物的孵育时间。 | |
| 孵育结束后，完全去除底物。 | |
| 降低抗体浓度，特别是 HRP 或 AP 标记二抗的浓度。 |
2.高背景
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 抗体浓度过高，导致抗体非特异性结合 | 降低一抗或二抗的浓度。 |
| 封闭液选择不当 | 不要在亲和素-生物素系统中使用牛奶进行封闭。牛奶中含有生物素，这会导致背景过高。 |
| 在检测磷蛋白时，避免使用磷酸盐缓冲液（如 PBS）和含磷蛋白的封闭剂（如牛奶或酪蛋白）。可以使用含BSA的 Tris 缓冲液封闭。 | |
| 通过封闭一张干净的膜，与抗体孵育后用底物进行检测，来测试封闭液中的交叉反应性。 | |
| 使用碱性磷酸酶（AP）标记物时，应选择 Tris 缓冲体系（TBS）的封闭液，因为磷酸盐缓冲液（PBS）会干扰 AP 的活性。 | |
| 尝试另一种封闭缓冲液。使用我们的封闭液选择指南，为您的实验查找最适合的封闭液。 | |
| 非特异性位点的不充分封闭 | 增加封闭液中的蛋白浓度。 |
| 优化封闭时间和温度。在室温（RT）下封闭至少 1 小时，或在 4°C 下封闭过夜。 | |
| 在封闭液中添加 Tween 20 去垢剂有助于减少背景。但是，过多的去垢剂会干扰抗体结合。通常， 0.05% 的终浓度比较合适。为便于使用，可选择已包含 0.05％ Tween 20 去垢剂的封闭液，例如 封闭液（TBS）或（PBS）。 | |
| 使用包含 0.05％ Tween 20 去垢剂的封闭液稀释抗体。 | |
| 使用 蛋白印迹增强剂以降低背景并增强对低丰度和弱免疫反应性抗原的检测。 | |
| 漂洗不充分 | 增加漂洗次数和漂洗缓冲液的体积。 |
| 将 Tween 20 去垢剂添加到漂洗缓冲液中，终浓度为 0.05％。如果 Tween 20 去垢剂的浓度过高，它会从膜上剥离蛋白质。 | |
| 印迹膜处理不当 | 根据制造商的说明书润湿并活化膜。 |
| 处理膜时，请始终戴上干净的手套并使用镊子。 | |
| 始终用液体覆盖膜以防止干燥。 | |
| 在所有孵育过程中都要进行震荡。 | |
| 小心处理膜——损坏膜会引起非特异性结合。 | |
| 设备或材料被污染 | 在使用之前制备新鲜的缓冲液并过滤。 |
| 只能使用干净且无污染的电泳设备、印迹设备和培养皿。 | |
| 化学发光底物的信号太强 | 减少印迹的成像或曝光时间。 |
| 换用灵敏度更低的底物。 | |
| 缩短膜与底物的孵育时间。 | |
| 孵育结束后，完全去除底物。 | |
| 降低抗体浓度，特别是 HRP 和 AP 标记二抗的浓度。 |
3.信号微弱或无信号
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 转印不完全或不理想 | 转印后，通过使用总蛋白染料对凝胶染色以评估转印效率。 |
| 转印后，使用丽春红染色液（PVDF）或（硝酸纤维素膜）将膜染色，以评估转印效率。 | |
| 使用气泡滚轮除去转印三明治中的气泡，确保转印过程中凝胶与膜之间充分接触。 | |
确保转印三明治以正确的方向放置在转印设备中，使蛋白质迁移到膜上。 |
|
| 根据制造商的说明书润湿并活化膜。 | |
| 使用阳性对照（例如预染蛋白分子量标准）帮助评估转移效率。 | |
| 使用可通过化学发光底物成像的分子量标准，预染蛋白 Ladder或者 Western蛋白Ladder，作为阳性对照。 | |
| 增加转印时间或电压。 | |
| 确保样品前处理条件没有破坏样品的抗原性。（某些蛋白质不能在还原条件下电泳）。 | |
| 与膜的结合不充分 | 对于低分子量抗原，可在转印缓冲液中添加 20％ 甲醇以促进结合并防止蛋白质穿过膜。 |
| 减少转印时间。低分子量抗原可能会穿过膜。 | |
| 对于高分子量抗原，向转印缓冲液中添加 0.01–0.05% SDS 以促进蛋白从凝胶转移到膜上。 | |
| 更换膜的类型（NC 与 PVDF）。 | |
| 换为孔径较小的膜。 | |
| 抗体浓度过低 | 增加抗体浓度。抗体对靶蛋白的亲和力可能很差。 |
| 抗体可能失去活性。进行斑点印迹（dot blot）以确定抗体活性。 | |
| 抗原不足 | 在凝胶上加入更多蛋白样品。 |
| 抗原被封闭液掩盖 | 减少封闭液中的蛋白浓度 |
| 尝试另一种封闭液。使用我们的封闭液选择指南，为您的实验查找最适合的封闭液。 | |
| 缓冲液中含叠氮化钠。 | 叠氮化钠会抑制 HRP。请勿将其与结合 HRP 标记抗体一起使用。 |
| 化学发光底物的信号太弱 | 增加膜与底物的孵育时间。 |
| 增加胶片曝光时间。 | |
| 确保底物没有失效。 | |
| 当你的蛋白样品量非常少，推荐使用 超敏ECL底物获得更强的蛋白印迹信号。 | |
| 膜已剥离并重新检测 | 避免同一张膜的多次重复剥离。 |
| 缩短在剥离液中的孵育时间，以防止抗原丢失。 | |
| 膜上抗原被消化 | 封闭物质可能具有蛋白水解活性（例如明胶）。 |
| 印迹长时间保存后蛋白质降解 | 制备新的印迹。 |
更多条带分析参考：微笑的条带 哑铃条带 WB各种“奇葩”条带的成因竟是这个（附解决办法）
荧光免疫印迹常见问题
1.非特异性或弥散条带
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 所用抗体对靶蛋白的特异性不强 | 评估并使用其他一抗。 |
| 仅使用经过蛋白免疫印迹应用验证*的一抗。 | |
| 样品完整性不足 | 过热或存在蛋白酶活性引起蛋白样品降解，导致靶蛋白分解且抗体对靶标的识别率低例如，请勿在 SDS 样品缓冲液中煮沸 SDS-PAGE 样品，而应在 70°C 下加热 10 分钟，以避免蛋白水解。 |
| 多重检测中的抗体交叉反应 | 选择远亲物种产生的一抗。 |
| 使用经过高度交叉吸附处理的二抗。 | |
| 减少二抗用量，保持在最佳性能范围内。 | |
| 进行多重检测时，临近通道发生了荧光渗漏（串色导致非预期的条带） | 避免同时使用光谱相近的标记物，尤其是在信号非常强的情况下。 |
| 确保可以通过成像仪检测到您的荧光染料。 | |
| 使用仪器上的自动曝光功能确定每个通道上的最佳曝光时间 |
2.信号微弱或无信号
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 抗体对靶蛋白的特异性不强 | 增加一抗浓度。 |
| 确保一抗具有理想的滴度，并且对待检测的抗原具有特异性。 | |
| 对于细胞或组织裂解物中的低丰度靶标，增加一抗的用量或凝胶上的样品量。 | |
| 将孵育时间延长至 4°C 过夜，或室温下 3-6 小时 | |
| 尝试使用抗体增强剂。 | |
| 抗体失去活性 | 确保正确储存抗体 |
| 检查抗体的失效日期。 | |
| 避免多次重复使用稀释的抗体。 | |
| 成像/曝光时间太短 | 延长曝光时间。 |
| 通过荧光仪成像系统的智能成像功能，轻松获得理想结果。 | |
| 仪器设置不正确 | 确保为目标荧光基团选择了正确的的激发和发射光范围。 |
| 去垢剂使用不当 | 去垢剂太多或去垢剂的性质可能会导致信号降低—减少或去除去垢剂。 |
| 封闭液可阻断抗原 | 一些封闭液会过度封闭印迹并影响抗原与抗体的结合，特别是当封闭时间超过 1 小时后。 |
| 用漂洗缓冲液稀释一抗。 | |
| 尝试其他封闭液。 | |
| 凝胶上的样品量不足 | 蛋白上样量过高可能会掩盖您的靶蛋白，降低抗体的识别能力。 |
| 蛋白上样量过低会导致抗原不足。 | |
| 对裂解物或样品进行梯度稀释，以确定最适合的蛋白上样量。 | |
| 蛋白质转印效果不佳或转印后蛋白质损失 | 检查转印条件，确认蛋白质已转移。 |
| 检测新的蛋白靶点时可能需要重新优化转印条件。 |
3.背景问题（高、不均匀或有斑点）
图源：Thermo
| 可能原因 | 解决方案 |
| 膜污染导致高背景 | 使用干净的镊子和培养皿或孵育盒来处理膜。 |
| 确定适合您应用的最佳封闭液——一抗在不同的封闭液中反应会有所不同。像常用动物血清或脱脂牛奶这类封闭液可能导致交叉反应。 | |
| 在封闭步骤中限制去垢剂的使用，因为常用去垢剂可自发荧光，通常会增加非特异性背景。封闭后，可以使用去垢剂。 | |
| 蛋白质分子量标准上样量过高导致假信号 | 减少蛋白质分子量标准的上样量。 |
| 漂洗或稀释溶液不合适 | 使用含有 0.1–0.2％ Tween 20 去垢剂的漂洗缓冲液。 |
| 用 0.05％ Tween 20 去垢剂制备二抗稀释液。 | |
| 增加漂洗的次数或漂洗时间。 | |
| 二抗浓度过高导致高背景 | 根据所使用的染料优化二抗稀释度，并遵循供应商建议的稀释度进行相应调整。 |
| 膜干燥导致背景斑点或不均匀 | 在所有孵育步骤中，确保液体充分覆盖整个印迹。 |
| 在每个孵育步骤中，确保震荡均匀。 | |
| 膜选择不当 | 膜的性质可影响背景；例如，PVDF 膜可自发荧光并导致高背景，因此，应使用低荧光 PVDF 膜。 |
| 印迹膜上有灰尘或指印 | 使用干净的镊子进行处理，并避免用手直接接触膜；不清洁工具带来的微粒和污染物可能产生荧光。 |
| 使用干净的孵育托盘或培养皿——先用甲醇冲洗，再用水冲洗，将有助于溶解并去除残留染料。 | |
| 如果使用湿转方法，需要清洁转印装置和沾满灰尘的耗材，避免因此产生斑点。 | |
| 进行印迹成像之前，用乙醇擦拭成像系统的托盘表面，去除灰尘、棉绒和残留物。 |
原文链接：https://www.thermofisher.cn/cn/zh/home/life-science/protein-biology/protein-biology-learning-center/protein-gel-electrophoresis-information/western-blot-troubleshooting.html
品牌优势
捷倍斯生物可以提供专业和完善的核酸分离纯化解决方案，有硅胶柱法、磁珠法与溶液直接法的核酸纯化产品，在二代测序的样品前处理方面有着专业的技术与积累，有完善的针对唾液、血液与血浆等样品的保存、运输与高通量核酸纯化等整套的解决方案。 在诊断试剂原料方面，捷倍斯生物可以提供生物染色剂、高端的表面活性剂、显色底物、生物缓冲剂以及酶制剂与其稳定剂等系列产品。
做值交往的人｜做值得信赖的产品
