用双齿叉打比方只是一个简化的模型。实际上,抗体分子是很有弹性和柔性的,形状也不是明显的“Y”形。在电子显微镜下它看起来更像三个球堆成的“品”字。
抗体是比较大的分子,分子量约在150KD左右,是水分子的8千多倍。它宽约4纳米,长约11纳米。如果把一个血小板细胞想象成一个西瓜那么大的话,那一个抗体分子只有西瓜籽那么大。
基本结构简述
所有抗体的基本结构都是四条肽链的对称结构,每条肽链细分为各种球形结构域,由数量不定的二硫键连接,并且分为氨基端(N端)和羧基端(C端)。
轻链(L链)和重链(H链)
两条相同的相对分子质量较大的肽链(称为重链,heavychain,H链,相对分子质量约为55000~70000)和两条相同的相对分子质量较小的肽链(称为轻链,light chain,L链,相对分子质量约为24000)组成。
轻链由214个氨基酸残基组成,通常不含碳水化合物,有两个结构域(1个VL和1个CL)。轻链可分为kappa(κ)与lambda(λ)两个亚型,在不同的免疫球蛋白分子中,轻链的类型不同是常见的,但在同一免疫球蛋白分子中,两条轻链都是相同类型的。κ和λ亚型的比例因物种而异,如在老鼠中大约有95%的κ型轻链和5%的λ型轻链,而在人类中这一比例分别为60%和40%。
重链由450~550个氨基酸残基组成,含糖数量不同,有4-5个结构域(1个VH和3~4个CH)。根据重链恒定区的结构差异,可分为μ、γ、α、δ、ε链,它们分别与轻链(κ或λ)组成完整的免疫球蛋白分子,对应5类抗体:IgM、IgG、IgA、IgD、IgE。
抗体的类型
抗体重链类型直接决定了抗体的类型,哺乳动物抗体重链可分为五类,分别以希腊字母γ、α、μ、δ、和ε表示,据此将抗体相应地分为IgG、 IgA、 IgM、IgD和IgE。α和γ大约含有450个氨基酸,μ和ε约含550个氨基酸;同时μ链和ε链含有5个肽环,γ链、α链、δ链含有4个肽环。

图源:https://microbeonline.com/immunoglobulin-structure/
--IgM是成熟胎儿合成的第一类Ig,也是在感染或免疫后最早产生的Ig,5类Ig中IgM最强,故其细胞毒活性和细胞溶解活性也最强。天然的血型抗体是IgM,有些自身抗体如抗磷脂抗体、RF等也属于IgM。胎儿脐血中IgM抗体升高,是胎儿遭受感染的标志。
--IgE为单体结构,是正常人血清中含量最少的Ig。IgE在血清和组织液中含量极微,其主要生物学功能是与组织肥大细胞、嗜碱粒细胞表面的特异受体结合。IgE不能激活补体。IgE含量在正常人群波动较大,在特异性过敏反应和寄生虫早期感染患者血清中可升高。当变态反应原与结合在受体上的IgE反应时,可引起肥大细胞、嗜碱粒细胞脱颗粒,释放出组织胺、5—羟色胺等生物活性物质。
抗体小叉与小叉之间在结构上的主要差异是位于齿端的可变区——这些可变区决定着抗体的抗原特异性。H链可变区约含118个氨基酸残基和L链可变区约含108~111个氨基酸残基。可变区是抗体结合抗原的位置,其氨基酸的组成和排列决定抗体的抗原结合特异性。
抗体小叉的柄部由一系列氨基酸序列基本不变的区域组成——我们称之为恒定区。恒定区可以与细胞表面受体或补体系统蛋白相互作用,从而触发宿主效应功能(effector function),比如裂解入侵细胞或吞噬外来病原。
抗体恒定区域位于H链靠近C端的3/4或4/5(约从119位氨基酸至C末端) 和L链靠近C端的1/2(约含105个氨基酸残基)区域。抗体重链恒定区分为CH1,CH2和CH3,其中CH3区域涉及到细胞膜表面受体结合,CH2涉及补体激活途径,是补体结合位点。简单来说,叉齿负责识别抗原,而叉柄则帮助宿主决定如何处置抗原。
结构域和铰链区
链内二硫键折叠成数个球形结构域,每个结构域由约110个氨基酸组成,氨基酸序列具有高度同源性,抗体的L链和H链中V区或C区每个结构域的二级结构是反向平行的β片层结构。
铰链区不是一个独立的结构域,位于CH1和CH2之间,包括H链简单二硫键,该区富含脯氨酸,不形成α螺旋。当抗体和抗原结合时,铰链区发生扭曲,使抗体的2个抗原结合位点能更好的与2个抗原决定簇互补。铰链区含有木瓜蛋白酶和胃蛋白酶水解位点,可以将抗体水解为Fab、F(ab’)2和Fc片段。

IgG经木瓜蛋白酶酶切后裂解为2个完全相同的Fab段和1个Fc段,每个Fab段都为单价,可与抗原结合但不会再发生凝集反应;
经胃蛋白酶酶切后裂解为1个完整F(ab)2片段和碎片化的Fc片段,F(ab’)2片段为双价,可同时结合两个抗原表位。
Fab段为抗原结合片段(fragment of antigen binding,Fab),相当于抗体分子的两个臂,由一个完整的轻链和重链的VH和CH1结构域组成。Fc段为可结晶段(fragmentcrystallizable,Fc)相当于Ig的CH2和CH3结构域,是Ig与效应分子或者细胞相互作用的部位。Fab段包含完整的可变区,以及恒定区的CH1区域。Fc段仅指Ig恒定区CH2和CH3的区域,相当于Y字结构下面那一部分。
抗体选型请参考:
《抗体如何选?WB、IHC、ChIP各种实验的抗体有什么区别?》
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