真菌是真核生物，像植物和动物一样。与植物不同的是，它们不进行光合作用，它们的细胞壁中含有几丁质，一种葡萄糖的衍生物。和动物一样，真菌也是异养生物，这意味着它们通过吸收营养来获取营养。
虽然大多数人认为动物和真菌之间的一个区别是真菌是不能动的，但有些真菌是能动的。真正的区别在于真菌的细胞壁中含有一种叫做-葡聚糖的分子，这是一种纤维。虽然所有的真菌都有一些共同的特征，但它们可以分成几类。然而，研究真菌的科学家(真菌学家)在最佳分类结构上意见不一。一个简单的外行人分类是将它们分为蘑菇、酵母和霉菌。科学家们倾向于将真菌划分为七个亚界或门。
过去，真菌是根据它们的生理、形状和颜色来分类的。现代系统依靠分子遗传学和生殖策略来对它们进行分组。请记住，下面的分类并不是一成不变的。真菌学家甚至对物种的名称也存在分歧
Subkingdom Dikarya（迪卡亚门）
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最熟悉的真菌可能属于Dikarya亚门，包括所有的蘑菇，大多数病原体，酵母和霉菌。Dikarya亚区分为子囊菌门和担子菌门两门。这些门和其他已提出的五个门主要是根据有性生殖结构来区分的。
Phylum Ascomycota（子囊菌门）
真菌中最大的门是子囊菌门。这些真菌被称为子囊菌或囊真菌，因为它们的减数分裂孢子(子囊孢子)在一个叫做子囊的囊中被发现。这个门包括单细胞酵母，d地衣、霉菌、松露、许多丝状真菌和一些蘑菇。这个门提供的真菌用于制作啤酒、面包、奶酪和药物。例如曲霉和青霉。
Phylum Basidiomycota（担子菌门）
属于担子菌门的棒状真菌或担子菌在称为担子的棒状结构上产生担子孢子。该门包括最常见的蘑菇、黑穗病菌和锈菌。许多谷物病原体属于这一门。新型隐球菌是一种机会性的人类寄生虫。
玉米黑穗病菌是一种玉米病原菌
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Phylum Chytridiomycota（壶菌门）
感染壶菌病的青蛙
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属于壶菌门的真菌称为壶菌。它们是少数具有活跃运动性的真菌之一，产生孢子，使用单个鞭毛移动。壶菌通过降解几丁质和角蛋白来获取营养。有些是寄生的。例如，有一种名蛙壶菌的真菌，它会引发一种名为“壶菌病”的传染性疾病，这种疾病会影响两栖动物。
Phylum Blastocladiomycota（芽生菌门）
芽生菌门的成员是壶菌的近亲。事实上，在分子数据导致它们分离之前，它们被认为属于这个门。芽生菌是腐生菌，以分解的有机物质为食，如花粉和几丁质。有些是其他真核生物的寄生虫。虽然壶菌能够进行合子减数分裂，但胚孢子菌进行孢子减数分裂。门的成员表现出世代交替。例如:巨生异生菌，爱默生芽枝菌，和 Physoderma maydis。
Phylum Glomeromycota（格洛梅罗菌门）
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所有属于小球菌门的真菌都是无性繁殖的。这些生物与植物形成共生关系，其中菌丝真菌与植物根细胞相互作用。这种关系允许植物和真菌得到了更多的营养。这个门的一个很好的例子是黑面包霉菌，匍匐根霉。
Phylum Microsporidia（微孢子虫门）
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小孢子虫门含有形成孢子的单细胞真菌寄生虫。这些寄生虫感染动物和原生生物(一种单细胞生物)。在人类中，这种感染被称为微孢子虫病。真菌在体内繁殖宿主细胞和释放细胞。与大多数真核细胞不同，微孢子虫缺乏线粒体。能量是在称为有丝体的结构中产生的。微孢子虫不能运动。一个例子是纤维支气管松解。
Phylum Neocallimastigomycota （新囊菌门）
新美鞭菌在反刍动物的胃中繁殖 转移制造木聚糖酶及各种葡聚糖酶
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新卡马菌属新卡马菌门;厌氧真菌的一个小门这些生物体缺乏线粒体。但它们的细胞含有氢基因体。它们形成有一个或多个鞭毛的游动孢子。这些真菌存在于富含纤维素的环境中，如食草动物的消化系统或垃圾填埋场。在人类身上也发现了它们。在反刍动物中，真菌在消化纤维方面起着至关重要的作用。一个例子是新美鞭菌(Neocallimastix frontalis)。
Organisms That Resemble Fung （类似真菌的生物）
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其他生物的外观和行为都很像真菌，但却不是真菌王国的成员。黏菌不被认为是真菌，因为它们并不总是有细胞壁，而且它们摄取营养而不是吸收营养。水霉菌和壶菌是其他看起来像真菌的生物，但不再与它们分类。
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