随着高通量测序技术飞速发展，人们对微生物的认知也在逐渐深入，从而有了各类型微生物样本，上到山巅土壤,下至深海底泥;有研究农作物根系微生物对产量的影响，也有关注动物昆虫肠道生理代谢的奧秘。想得到理想的实验数据，规范标准的取样方法是成功的第一步。在取样前，特别需要注意以下6点:
1.取样使用的工具及容器必须经过灭菌处理,
2.取样后及时做好标记，记录取样相关信息
3.样本做好备份，防止意外发生丢失珍贵样本;
4.样本使用标准容器承装，在容器上标记清晰，送样不宜过多;
5.取样后保持低温环境，建议使用干冰配送;
6.取样过程建议戴一次性手套、口罩，进行严格取样和操作，尽可能减少人为的污染。
一. 土壤类样本取样方法
按实验设计确定采样范围，取样器皿需要提前先消毒灭菌处理，采样时应去除地表杂质，根据需要挖取相应深度(如5~20 cm)的土壤，置于冰上运至实验室。去除可见杂质，建议过2 mm无菌网。同一样方多点样本等量混合均匀后取5~10g，保存无菌EP管中，进行核酸提取，或-80”C保存备用。
图源：凌恩生物
(1)作物类(草地等矮小植物)根际土壤取样方法
a.采集植物植株，去除根部大块土壤，置于冰上运输至实验室;
b.晃动根部，去除根部松散的土壤后，使用无菌刷子从根部收集残留土壤;
c.同一样方多点取样土壤样本等量混合均匀后，液氨速冻，置于-80℃℃冰箱保存。
(2)林木类根际土壤取样方法
a.采集地面下 10-20 cm 根际土壤，置于冰上运输至实验室;b.过 2-5 mm 孔径无菌筛网;
c.同一样方多点取样土壤样本等量混合均匀后，液氨速冻，置于-80℃℃冰箱保存。
注:取样器具请事先消毒灭菌处理。若为真菌根际土壤，请务必尽可能去除菌丝体残留，减少对 DNA/RNA 提取的干扰。
捷倍斯生物(GBCBIO®-M4105 MagIso Environmental Samples DNA Kit 磁珠法环境样品 DNA 提取试剂盒 )是专门为 KingFisher, 达安、天隆等核酸提取仪设计的产品，适合于从水、土壤与粪便样品中提取核酸。试剂盒基于超顺磁性的磁性粒子纯化技术，采用独特的腐殖酸除去液能够有效去除腐殖酸等，能有效去除金属等抑制因子。仪器运行时间只需 50 分钟。得到的 DNA 可直接用于定量 PCR 和二代测序等实验。
| 货号 | 产品名称 |
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Water DNA Kit 环境水样DNA提取试剂盒 |
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Soil DNA Kit 环境土壤DNA提取试剂盒 |
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MagIso Environmental Samples DNA Kit 磁珠法环境DNA提取试剂盒 |
https://www.gbcbio.cn/Product/M4105-50.html
二. 水体样本微生物样本取样方法
图源：veer
a.送样量:扩增子直径3-4cm滤膜1-2张;宏基因组9直径3-4cm滤膜>=2张;
b.研究目的进行确定水体的取样深度和范围;
c.采样后进行滤膜过滤，选择合适孔径的滤膜，对于澄清水体或者略浑浊水体，选用0.22um或者0.45um的滤膜，取样体积大于5L;
d.对于浑浊水体，建议先用大孔径的滤膜过滤一遍，再用小孔径的滤膜过滤;
e.水体泥样的采集提供大于5g样本;
f.用大体积干冰运输，且要保证在样品检验提取前有足够的干冰剩余
注意:扩增子项目将2-3L水体过滤到1-2张滤膜(0.22或0.45um)后装入到离心管中;宏基因组项目将10L水体过滤到>=2张滤膜(0.22或0.45um)后装入到离心管中。
三. 空气微生物样本取样方法
使用空气抽滤机，使空气通过 0.22 μm 滤膜，滤膜上有可见覆盖物(过滤时间越长，收集的空气中的灰尘越多，菌数量越多)，收集完成后取下滤膜。滤膜置于冻存管中，液氨速冻，干冰寄送到实验室。
注意:由于样本特殊，微生物含量较少，建议多保管备份保存。
四. 淤泥水体/沉积物类样本取样方法
(1)污泥 淤泥
从活性污泥装置中取大于10 ml的悬浮污泥样本(约5-10 g沉降物)，保存无菌EP管中，放入液氨或置于冰上，立即运至实验室进行核酸提取，或-80℃保存备用。
注:若液态污泥样本沉降物较少，可适当增加取样量。
(2)水体/地表沉积物
取距离水底/地表0-10 cm(具体按实验需要而定)的沉积物5~10 g，保存无菌取样袋或EP管中，置于冰上运送至实验室进行核酸提取,或-80℃保存备用。
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品牌优势
捷倍斯生物可以提供专业和完善的核酸分离纯化解决方案，有硅胶柱法、磁珠法与溶液直接法的核酸纯化产品，在二代测序的样品前处理方面有着专业的技术与积累，有完善的针对唾液、血液与血浆等样品的保存、运输与高通量核酸纯化等整套的解决方案。 在诊断试剂原料方面，捷倍斯生物可以提供生物染色剂、高端的表面活性剂、显色底物、生物缓冲剂以及酶制剂与其稳定剂等系列产品。
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