1、认定方式不同
一般新注册的公司如果没有选择纳税人类型则会自动认定是小规模纳税人。
而一般纳税人需要申请达到标准（销售额超过500万元或有固定办公场所）才能认定。
2、评判标准不同
小规模纳税人不能正确核算增值税的销项、进项和应纳税额；不能按规定报送有关税务资料；
而一般纳税人有完整的财务系统，能进行健全的会计核算；能按规定报送有关税务资料。
3、纳税申报期不同
一般纳税人缴纳增值税，原则上实行以月为纳税期申报纳税。
小规模纳税人可以选择按照1个月或者1个季度为纳税期限进行申报，通常是一个季度。一经选定，一个会计年度内不得变更。
小规模纳税人无论行业增值税税率为3%，（受疫情影响，2020-2021年的增值税税率为1%）。而一般纳税人会根据行业的不同，有0%（免缴增值税的行业）、6%、9%、13%等税率。
一般纳税人
1）适用增值税税率13%、9%、6%以及0%四种2）一些特殊业务可以按简易计税方法，简易计税方法适用征收率3%、5% 。
小规模纳税人
适用增值税征收率3%、5%。自2023年1月1日至2027年12月31日，增值税小规模纳税人适用3%征收率的应税销售收入，减按1%征收率征收增值税。适用5%征收率的，不可减按1%，依然按照5%税率来征收。
一般纳税人按照销项税额和进项税额的差额纳税，采用一般计税方法。
一般计税：
应纳税额指当期销项税额抵扣当期进项税额后的余额。
应纳税额计算公式：
应纳税额=当期销项税额-当期进项税额销项税额=不含税销售额×税率
小规模纳税人按照销售额乘以增值税征收，采用的是简易计税。不得抵扣进项税额。
应纳税额计算公式：应纳税额=不含税销售额×征收率不含税销售额=含税销售额÷（1+征收率）
小规模纳税人可以开具3%（1%）的增值税专用发票，但是收到的增值税进项发票不能抵扣税额。
一般纳税人可以开具相应的增值税发票，同时获得的相应的增值税专用发票也可以抵扣税额。
小规模纳税人开具普通发票自2021年4月1日至2022年12月31日，对月销售额15万元以下（含本数）的增值税小规模纳税人，免征增值税。
小规模纳税人只要满足一般纳税人条件（年销售额超500万元），就可以向主管税务机关申请办理一般纳税人登记。
2020年12月31日前，一般纳税人可选择转登记为小规模纳税人。如果转登记后，连续12个月或者4个季度的应税销售额超过500万元的，则应再次登记为一般纳税人且不得再转登记为小规模纳税人。
2021年1月1日开始，一般纳税人暂时不能转为小规模纳税人。
不能简单地说谁好，企业要根据自己的实际情况来看。主要考虑以下几方面：
如果公司投资规模大，年销售收入很快就会超过 500 万元，建议直接认定为一般纳税人。
如果估计公司月销售额在15万元以下，建议选择小规模纳税人，从 2021年4月1日起，将享受增值税免征政策。
如果你的购买方预计未来主要是大客户，很可能他们不会接受 3%（1%）征收率的增值税专用发票，这样建议直接认定一般纳税人，否则选择小规模纳税人。
如果你的公司成本费用构成取得增值税专用发票占比高，进项税额抵扣充分，通过测算估计增值税税负低于 3% （1%），建议选择认定一般纳税人，否则选择小规模纳税人。
如果是13%税率的行业，且为轻资产行业。这类行业一般增值税税负较高，建议选择小规模纳税人，否则选择一般纳税人。
看所在行业能否销售增值税优惠政策。比如软件企业增值税超税负返还等增值税优惠政策，如果能享受，建议选择一般纳税人，否则选择小规模纳税人。
这两年小规模的税收优惠政策是一波接一波，增值税免征、疫情期间的特殊优惠等，都是实实在在的好处。但是，企业是不是要去做转登记，不能仅仅考虑优惠政策，还要综合前面的几点来进行考虑。
金税四期，使企业和个人更多的数据被税局掌握，监控呈现全方位、立本化，偷逃税行为无处遁形。企业的财务合规和税务合规，将是唯一出路。
企业只要行的端坐的正，数据真实并按时按规申报纳税，即使是被大数据稽查到异常也不用担心，还会有专门的人员来核实，不会那么草率判定数据作假。无论政策、制度、系统怎么变化，合法、合规经营的企业都不会受到什么影响，不用过分担心。
请谨慎对待你对外申报的每一个数据，报给统计局的，报给税务局的，报给社保局的，报给公积金中心的，因为每一个数据都将互通，他们可能相互印证，从而成为税务稽核的突破口。
如果发票有问题，尽快做进项税转出，相应的企业所得税作纳税调整处理。如果有两套账的问题，尽快两账合一，避免不必要的麻烦。
金税四期上线后，企业将会面临又一轮大清查，切勿心存侥幸。没有人比你自己更关心你的公司，请自查，自查！
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