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当公司决定不再经营时，注销公司是对个人来说最好的选择。而注销公司一般是分为两个部分，分别是工商注销以及税务注销，而税务注销是比较难处理，在清算时需要留意这3个税务提醒以及五大税务问题都是公司注销的难题！
注销并不意味着未履行纳税义务的灭失。在企业注销清算过程中，企业股东等清算义务人如果未履行清算义务或采取欺诈的手段骗取注销登记的，税务机关有权通过法律途径要求清算企业的股东及相关清算义务人承担税款的连带清偿责任。因此， 公司在注销清算时的税务提醒：
1、对于自然人股东的公司在注销清算时，若是账面上存在未分配利润、盈余公积等，按照实收资本中自然人股东占比来计算分红的20%的个税。
2、剩余资产减除股息所得后的余额，超过或低于股东投资成本的部分，应确认为股东的投资转让所得或损失，这部分所得应按照财产转让所得，缴纳20%个人所得税。
3、注销清算时清算所得不存在企业所得税优惠税率的情况，比如注销之前属于小型微利企业，但是注销清算所得不存在这样的优惠，一律适用25%的企业所得税。
企业成立以来的重大合同，均会进行印花税审核，实收资本、资本公积、营业账簿、租赁、购销合同都是检查重点！（所以注销前，都要仔细检查一遍，该补的就需要及时补上）
财税[2003]158号规定：个人投资者从其投资企业(个人独资企业、合伙企业除外)借款，在该纳税年度终了后既不归还，又未用于企业生产经营的，其未归还的借款可视为企业对个人投资者的红利分配，依照“利息、股息、红利所得”项目计征个人所得税。”
一般纳税人终止生产经营，办理注销税务登记，要先办理一般纳税人注销，如果尚有未曾出售的存货，则会分配给股东或投资者，作为出资的收回或利润的分配。
《增值税暂行条例实施细则》规定：“将自产、委托加工或购买的货物分配给股东或投资者”属于视同销售行为。要按照12万确认销项，注销时，需缴纳增值税12*13%=1.56万元。
通常，10家注销企业中有9家企业都存在这种问题！货物去哪儿了呢？肯定是有商品销售后漏报收入了！
比如说，A公司注销的时候，账面上有10万元的存货，市场价（不含税）为12万元，但实际上，仓库里面什么都没有了！税务实地核查发现这种情况，轻则按视同销售来处理，重则补缴滞纳金等！若按视同销售处理，则A公司需按照规定缴纳：12万*13%=1.56万元。
做食品销售的某公司，在注销的时候，公司仓库的117万元（含税）食品因管理不善，过期了，发票已经认证抵扣。虽然账面上这117万元确实一分钱都不值了，但根据增值税管理办法，因管理不善造成损失，之前做了进项抵扣的必须进项转出。
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