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CFX Maestro 软件使用教程(一)

CFX Maestro 软件使用教程(一) 广州市昊洋贸易有限公司
2023-07-21
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如今 qPCR 技术凭借其快速、简单、易用、价格低廉等优点,成为基因定量和分析的金标准,应用十分广泛。然而迄今为止,为数众多的使用者仍然困惑于如何正确进行数据分析。如今,标准化的、简单可靠的 qPCR 数据分析工具已成为科学界第一位的需求。因此 Bio-Rad 公司最新版 qPCR 软件——CFX Maestro 应运而生,它集 qPCR 数据收集处理、统计学分析及数据可视化于一体,是真正功能全面的一站式软件。

鉴于很多正在使用 CFX qPCR 小伙伴在咨询如何在日常科研工作中使用这款软件,小编特意把教学视频分享出来,请点击以下视频观看。在接下来的一段时间里,我们将持续输出 CFX Maestro 软件使用技巧系列,围绕 CFX Maestro 软件的功能,分享软件操作过程和结果展示、分析案例,希望能帮助到大家。




接下来简要介绍一下 CFX maestro 软件的主要功能


 一.

便捷的反应板设置和参考基因选择

快速设置技术重复和生物学重复


CFX Maestro 软件旨在助您快速收集数据。使用视觉界面进行布板设置,该视觉界面会以不同颜色标识不同的样品孔以确认准确的设置。还可以同时设置技术重复和生物学重复。鉴别参考基因稳定性并筛选理想参考基因。

图1. 快速可视化并确认布板设置。样本孔用不同颜色标记样本、生物学重复和技术重复

筛选您理想的参考基因


在进行基因表达分析时,稳定的参考基因是必不可少的。CFX Maestro 软件的参考基因选择工具将比较多个参考基因的稳定性,为您提供有关在整个实验过程中,哪些参考基因最有可能在所有样本中以一致水平进行表达的信息,有助于确保可靠的相对表达数据。

图2.自动识别理想参考基因,绿色标识部分基因稳定值越高其稳定性也越好,可作为理想的参考基因

整合 PrimePCR Assay 分析简化引物设计和实验设置


使用 CFX Maestro 和 PrimePCR 即可轻松实现。将 PrimePCR 运行文件拖放到 CFX Maestro 中,会自动导入布板设置和运行条件。实验运行后,通过查看 PCR 对照(阳性对照,RT,gDNA 和 RNA 质控对照)以确保运行质量。

图3. Bio-Rad 有多种 PrimePCR Assay


 二.

一键式数据分析和统计学分析

自动计算 Cq 值和扩增效率


CFX Maestro 软件具有查看、分析和解读数据的工具。可以为每个实验靶标自动设置基线及阈值线以计算 Cq 值,或者您可以通过单击并拖动阈值线自行调整阈值。如有标准曲线,CFX Maestro 将自动计算扩增效率。

图4.实时记录每个样品的扩增曲线,并按靶标、样品类型或位置对它们进行颜色标识

轻松实现统计学分析


只需单击几下鼠标,您就可以对等位基因进行识别,查看均一化基因表达差异,进行 t 检验或方差分析。

高效开展多板合并分析


CFX Maestro 软件还可以对多板数据进行自动化合并分析。使用基因研究功能可以将数十甚至数百个反应板整合进行统计学分析,而无需在其他软件中单独导出并组合分析大量独立数据。

图5.多板合并分析。聚类图显示根据基因表达水平相似性分组的共24个反应板合并分析结果


 三.

轻松导出用于文章发表的高质量图表

有多种结果可视化图表可选,包括柱形图,箱线图,聚类图和火山图等以及对图形进行编辑和注释,以用于发表或演示。可以更改颜色、字体、标题和图例,并用 P 值、文本和箭头注释图形以标识特定数据,也可以任意设置图形大小和分辨率,最后以 .jpg、.png 或 .bmp 等格式生成漂亮的数据图形。

图7.火山图支持快速鉴别出其表达水平差异具有统计学意义的目的基因



· 参考文献 ·



文献1:Bio-Rad bulletin 6900 ver C (Chinese version 20-017)


* BIO-RAD是BIO-RAD LABORATORIES, INC. 在特定区域的商标。

* 本产品仅用于科研用途,不用于临床诊断。



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