在评估一个可能成为实验室的空间时，首先要考虑的是如何才能使现有的建筑按照相应的程序达到预期的功用，使之符合实验室的要求。简而言之，首先要明确实验室所需遵循的程序。
然后，对实验室程序进行分类，可以分为以下五种。每一套程序都有各自需要关注的问题。并不是在设计洁净室时使用的，而是在评价洁净实验室工厂是否合适时所需关注的问题清单：
1、工艺设备
要求的环境条件（洁净度水平、温度、湿度）；
总面积（操作面积加上维护通道）；
高度和宽度（入口通道的净空，以及安装升降机的净空）；
重量（现有建筑物结构所能承载的负荷）；
2、与工艺相关的外部供应
供给建筑物的水质；
实验室废弃物排放；
高纯度水（RODI、WFI、蒸馏水）；
真空、CDA；
气体和化学物质（危险性和高纯度）；
工艺废气；
电源（可用电压、可靠性和品质）；
3、安保措施
危险材料（废物的传送、装卸、储存、收集/处理）；
人流和化学/气流的分离；
现场和建筑物的可达性；
各国对危险材料的安全要求或规定；
4、总的空间要求
可以改造的或者租用的空间；
实验室空间；
实验室的后备空间（设备室、化学和气体储存室）；
洁净室的后备空间（更衣室、设备室）；
洁净室的机械空间（循环空气单元[RAU]、冷冻机、加湿器、供水等用房）；
洁净室的电气空间（电气室、服务器机房、IT柜、应急发电机）；
可用的屋顶空间；
5、预算和进度
施工准入限制；
干预正在进行的活动；
施工截止时间的可行性。
