芽孢杆菌和类似形态的微生物在固体琼脂培养基上具有典型的生长模式。从菌落形态上看，平板上的这些菌落很多都是大面积的、不规则的、扁平的、干燥的、半透明到奶油状的菌落。
图为芽孢杆菌
在VITEK® 2 COMPACT系统中，在使用BCL卡片鉴定芽孢杆菌时，要求菌悬液浓度为1.8~2.2 McF。在菌悬液制备的过程中，有些菌株很难在0.45%盐水中被乳化为均匀的悬液，因为管中存在较大的菌块，实际的菌悬液浓度很可能低于在DensiCheck比浊仪中的读数，而这会导致BCL卡片中接种的比其所需要的细胞数量少，并且较大的菌块会堵塞卡片的吸液管和其中的通道从而导致不正确的生化反应谱，给出错误的鉴定结果。
左图为鉴定卡/ 右图为菌落
建议操作方法如下：
1. 使用润湿的棉拭子（或一次性接种环）从琼脂平板上采集菌落，注意不要取到琼脂。
2. 将菌落溶解在2-3ml盐水中，使用同一支拭子（或接种环）混合，或使用移液枪反复吹打，以得到高浓度的均匀悬液。
图为高浓度悬液
3. 一旦达到足够的浊度，并且观察到大多数的菌落已溶解在盐水中，可将菌悬液管静置2-3分钟，可以使未溶解的颗粒沉淀在悬浮液管底部。
4. 取第二支空管，使用微量移液枪取上清液并转移到空管中，注意尽量不要吸取到管底部的沉淀物，避免吸取到菌块。
5. 此时的菌悬液将用于制备测试溶液。加入盐水，使用移液枪混合悬液20-30次，形成均匀的菌悬液。使其浓度在1.8-2.2McF之间，即可上机操作。
注 意！
# 最好使用润湿的棉拭子，并在混合前将拭子与取到的菌株放在悬液管中约20-30秒，这样可以使菌落软化更易于混合。
# 在取出拭子前，要沿着管壁挤压拭子，减少菌落的损失。
# 如果制备样本和上机操作之间的时间间隔超过10分钟，则在将菌悬液上机填充卡片之前使用移液枪吹吸4-5次。