正常情况下，实验室应保证每小时6-12次的换气次数，如果排风系统使用通风柜作为实验室气流控制的一级控制，则通常要求保证换气次数达每小时4-12次。当实验室有较大的排风要求，可能会要求更多的换气次数。
利用通风柜作为气流控制的重要组成部分，确保实验室内部气流不断更换，防止实验过程中的实验室内有毒气体浓度增加，所有化学实验室内的空气都应被排放出室外而不得循环使用。因此，要保证实验室内衡为负压，实验室不会对周边区域形成交叉污染。
禁止在未开启通风柜时在其通风柜内做实验；
禁止在做实验时将头伸进通风柜内操作或查看；
禁止通风柜内做国家禁止排放的有机物质与高氯化合物质混合的实验；
禁止在没有安全的情况下将所实验的物质放置在通风橱内实验，一旦出现化学物质喷溅出来，应立即将电源切断；
根据所吸收的气体组分以及有害物性质，能够对吸收速度进行调节。通常规定，一般无毒的污染物为0.25―0.38m/s，有毒或有危险的有害物为0.4―0.5m/s，剧毒或有少量放射性为0.5―0.6m/s，气状物为0.5m/s，粒状物为1m/s。
确保操作人员在室内的安全同时又考虑节能的问题，即时无人操作时，通风柜建议都是需要24小时运行，无人操作可以将排风量调至最低的安全运行风量，达到节能效果。
