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【代谢组学】技术文档——代谢组学悬浮、半悬浮细胞样本收集SOP

【代谢组学】技术文档——代谢组学悬浮、半悬浮细胞样本收集SOP 丰信生命科学
2020-01-13
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导读:科研道路千万条,影响因子第一条,方法整不对,说啥都是泪……



少说废话!

看东西…


1、样本量要求


NMR平台:50mg冻干粉/样=500mg鲜重/样

GC-MS平台:20mg冻干粉/样=200mg鲜重/样

LC-MS平台:20mg冻干粉/样=200mg鲜重/样


2、样本收集


2.1 每个生物学重复取相同的一体积细胞悬浊液,经4℃、1000-3000rpm、5min离心处理,去除培养液(至少保证1Volume=N×10^7cells,N>1。为得到最好的分析结果,建议每个生物学重复的在不计算管壁粘附的情况下湿重达到200mg以上);

2.2 将收集到的样本使用PBS或生理盐水清洗3-5次,经4℃、1000-3000rpm、5min离心处理,去除胞外物质;

2.3 将收集到细胞样本在液氮中进行淬灭处理,抑制细胞中的代谢活性;

2.4 将淬灭过的细胞样本放入-80℃储存;或进行冷冻干燥,最终得到冻干粉末,-80℃进行长期保存。


3、注意事项


3.1 去除培养基和胞外物质的过程中,尽量选择低速离心,防止细胞破裂;

3.2 采样全程保证容器无菌,避免外界容器对样本的污染;

3.3 提前分装,避免反复冻融。


4、样本运输


冻干粉样本在运输过程中可使用冰盒运输,非冻干样本需使用足量干冰保温运输


5、建议:样本长期保存须知


冻干样本如需长期保存建议进行过塑或充氮处理,湿样若长期保存建议-80℃储存



小编提醒:

1、重要的事情说三遍~~
避免反复冻融!
避免反复冻融!
避免反复冻融!

绝大多数冷冻实验样本都有避免
反复冻融的要求,应养成好习惯,
尽量在初次冷冻之前分装。

2、足量干冰的意思是:
样本直到运到实验平台开箱时,
都应保持最初的冷冻状态,确
保温箱内剩余干冰不少于1kg,
理论上干冰越多越好,但考虑
到干冰采购和运输成本问题,
够用即可,通常情况,30-35℃
气温时,以每日不少于3kg挥发
量估算为宜,气温更高时应加量。

3、还有一个不容忽视的问题:
寄送样本应选用最快的物流方式,
尽量避开“6.18”“双11”“双12”“年货
节”之类的电商混战日和节假日
到达时间尽量避开节假日和周末。

最后说一句:
科研道路千万条,影响因子第一条,
方法整不对,说啥都是泪……










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