2015年，农业部印发《到2020年化肥使用量零增长行动方案》，鼓励施用有机肥，并对农民使用有机肥进行补贴，补贴金额每吨150—480元，随后在全国各地有条件的地区进行试点工作。
2017年，农业农村部印发了《开展果菜茶有机肥替代化肥行动方案》，并选择100个果菜茶重点县并拿出十个亿作为补贴，开展有机肥替代化肥示范。
2018年，对于农户购置相关机械予以重点支持并相应补助；政府购买服务方式集中推广有机肥使用；设立农业资源与生态保护方面专项资金，约束指导地方政府。
2019年中央一号文件强调：要扩大有机肥替代化肥示范县，并给予大力支持！
最近两年，国家对企业生产、运输、销售上面都有很大力度的优惠政策。首先在企业生产上面，生产用地按照设施农用地进行管理，方便手续办理；对设备的购置费税前扣除，并提高减半税额上限，提高教育经费税前扣除限额等多项税收优惠政策；在有机肥运输上，享受铁路运输的优惠，在运力紧张的时候优先保障农资产品；在产品销售上，对所有有机肥类产品免征增值税。在科技研发上，设立相关专项计划，促进农业废弃物如秸秆、畜禽粪便等的综合利用 。
是将农作物秸秆、粪便类、工业下脚料等一类可以进过生物降解的有机物料添加菌种等进行固态发酵产生出能够满足农业种植要求的一类肥料，称之为有机肥料。
有机肥料产品的的开发一般为精制有机肥（粉状或者粒状）这种肥料肥效缓慢价格便宜利润不高，可以以此为基础开发有机无机复合肥料或者各种专用肥料，这种肥料肥效好，价格高而且利润大，销量也比单独的有机肥料高，还可以开发相应的功能性肥料如：具有保水功能的腐植酸有机肥料，添加各种功能菌后变为微生物肥料等等.
有机液肥其实质就有两种：一种是将固体有机肥加入水分浸泡提取其中的营养物质,然后在加入一起菌种强制通风发酵直到液体腐熟不再产生臭味即可包装出售，另一中是液体发酵生产菌剂后的发酵废弃液添加适当的养分后也可以开发成有机液肥，里面含有很多微生物的代谢中间物质，对植物的生长也是有一定促进作用。有机液肥是现在产品的一个开发方向。
在生物有机肥概念提出后，市场上面企业较少，但是由于近几年国家政策大力支持，企业数量在暴涨，截止到去年五月，拥有生物有机肥产品的企业已达1537家，头部大规模企业初具规模。头部大企业多是一些本身从事微生物行业相关；或者由科研院所和一些企业合作形成。尽管头部企业开始形成，但是大多数仍然是小企业，这一点可以从企业产品的申请上面得出。
各公司产品数量分布折线图全国1537家企业中，产品低于两种的企业数量达1450家，占比94.3%，产品数量超过5种的更是只有不到20家。其中前五包括山东农大肥业科技有限公司、史丹利农业集团股份有限公司、山东庞大生物集团有限公司、山东恩宝生物科技有限公司、山东土秀才生物科技有限公司，前十中有多家上市企业，规模相对较大。
近些年来，随着国家政策的大力扶持，生物有机肥产品逐年增加。目前已登记的产品总数为2173个，其中2015年以后登记产品数为1896个，占比87.3%，说明2015年以来，政策起到的促进作用十分明显。
菌种上面，已明确菌种的产品有2171个，其中菌种有214种（类），含混合菌种。在生物有机肥的菌种中，目前以芽孢杆菌属的生物有机肥居多，有2074种，占比95.5%。其中巨大芽孢杆菌可释放土壤中难溶磷，胶冻样（胶质）芽孢杆菌可释放土壤中的矿物钾；其他菌种可以起到一定作用的促生、拮抗作用
目前生物有机肥行业企业规模小，产品在肥料行业中所占比重低。虽然我国目前的生物有机肥生产企业已有1000多家，但多为中小型企业，生产规模多数偏小。菌剂类企业年产量一般在几百吨左右，超过上万吨的厂家屈指可数;而菌肥类企业年产量多在0.5-1万吨左右，少数企业能达到4-5万吨，只有个别企业达到10万吨以上。目前生物有机肥年产量已达到300万吨以上，这还是得益于近年来菌肥类产品的快速发展。虽然产量较前几年有了较大的提高，但在整个肥料行业中所占比重仍很低，行业中还没有涌现出知名或旗舰型的企业。
由于我国是小农经济，这体制制约着有机肥推广使用的广度和深度、农户缺少使用有机肥的意识，同时有机肥成本较高，也增大了推广难度；市场上有机肥质量参差不齐也影响农户使用信心和积极性。
目前，我国仍有2.6亿农户、6亿多人生活在农村，其中2.3亿户是承包农户，也就是所谓的小农户。同时，中国80%以上的土地在2.6亿的小农户手里。耕地分散、块状明显，导致机械化、规模化、现代化受阻。
尽管，这几年国家推行有机肥标准，但是有机肥以次充好的情况依然很难遏制。另外，在施用有机肥的过程中，每年都有部分农民不是感觉不到效果，就是遭受损失，使之降低了对有机肥产品的信任，也在一定程度上影响了有机肥的声誉和销售。特别是近年来新加入的一些菌肥类企业，这些企业一般不具备生产微生物菌剂的能力，而是通过购买菌剂进行复配来生产菌肥类产品。由于缺少相关的检测条件和技术人员，无法对产品的质量进行把关，也就不能保证产品的应用效果。此外，生物有机肥作为含有活菌制剂的肥料产品，作用效果受施用方法、环境条件等方面的限制，生物有机肥产品的作用效果不是非常稳定，这也影响了生物有机肥产品的进一步推广、应用。
根据采集14个省（市）184个有机肥样品的测定结果，污泥、猪粪、鸡粪、堆肥与厩肥对环境的污染程度最高。畜禽粪便中的有机物污染物及重金属主要是通过饲料添加剂进入。国内研究也已证实，有机肥中存在POPS及重金属，如多环芳烃、有机氯类及铜锌超标等。
有机肥料虽然营养元素含量较全面，但有效成分含量偏低，一般只有4%左右，最高的也仅为12%左右，远远低于化肥的有效成分，而且有机肥料在土壤中分解被植物吸收利用的过程较慢，很难满足农作物高产、高效的需要，这一“瓶颈”阻碍了有机肥的发展，致使有机肥料在使用中只能处于“配角”地位，无法单独在农田中大面积使用，必须与化肥配合施用才行。这势必会影响农民购买的积极性。
