就在企业、园区、监管方渐入佳境的时候，跨境电商税改传闻犹如一道晴天霹雳，让大家措手不及。据最新市场消息，跨境电商零售进口商品很可能会按货物性质来征税：
关税免征，增值税和消费税按照70%征收，取消50元起征点；
要求完税价格为实际交易价格，境内运费和保费计入完税价格；
并且将设置个人年度限额和交易限额，即年度限额20000元人民币，单次限额2000元的，如果超过限额，就按照一般贸易进行全额征税，不按照限额内、限额外分拆计算；
建立跨境电子商务正面清单，基本原则为不涉及进口许可证件的日用消费品，但部分涉证的消费者购买需求大的生活必需品有可能也会列入正面清单；
与此同时，行邮税也可能会同步调整，从目前的10%、20%、30%、50%四档调整为15%、30%、60%三档，50元起征点保留。
一般贸易，仍然享受50元的免征税额：第392号国务院令《中华人民共和国进出口关税条例》 “第四十五条 下列进出口货物，免征关税：（一）关税税额在人民币50元以下的一票货物”。《关于进口货物进口环节海关代征税税收政策问题的规定》附件“第三条、进口环节增值税税额在人民币50元以下的一票货物，免征进口环节增值税；消费税税额在人民币50元以下的一票货物，免征进口环节消费税”。
因此，单单对跨境电商取消50元免税额，也产生了“新一轮”的不公平。
2、完税价包含了境内运费和保费
《税款条例》中明确“二十条 进口时在货物的价款中列明的下列税收、费用，不计入该货物的完税价格：（二）进口货物运抵境内输入地点起卸后的运输及其相关费用、保险费”。
然而在新政中，跨境电商物品则需包含国内运费和保费。
（1）中高端消费回流至海淘代购：
业内人士分析，“目前单价在2000元以上的商品主要为服饰、箱包、小家电、饰品等，约占跨境业务的20%，但贡献跨境税款征收的50%。若政策收紧，代购市场的套利空间又将重新扩大。”
（2）增加了预归类难度：
根据传闻，2000元以上的商品，将按照一般贸易进行全额征税。一般贸易中，商品需要进行预归类，同为奶粉，就有可能因为配方、工艺不同，而对应了不同的税目和关税税率。因此，跨境电商网站在税改后如果还想做2000元以上的商品，就需要按照《中华人民共和国进出口税则》中二十一类、九十七章、8294个税目，数万个子目来进行预归类，无疑是一项相当浩大的工程。
4、“正面清单”可能导致品类大幅缩减
有分析人士指出，如按照正面清单管理，前期试点一半以上的品类将面临退出。于此同时，由于许多商品许可证办理时间长、成本高且不少产品还存在国内外标准不一的情况，大量涉证物品如食品、膳食补充剂、洗护用品等很有可能会回到香港、日本、台湾的海外仓，经邮路入境。
5、行邮税上调效果或许不大
在跨境电商税改的同时，行邮税被曝出会提高税率。这说明国家已经意识到，跨境电商的体量很可能被压缩，导致一部分需求重新流向邮政通道。只是，海关的监管难度也会随之上升。
6、保税业务相关方可能面临损失
以杭州为例，入驻企业在前期大量投入资金后才刚刚步入正轨，税改的到来，如果真的减弱了消费者的热情，影响了已入驻企业今后的销售状况，这对“喝头口水的人”无疑是不公平的。积极响应国家号召，如果迎来的是急速转向的政策，那么民营企业将来对新政策的信任感会降低。而电商企业业务量的缩小，也会使得仓储企业面临困境，同时园区方面的投入也将出现闲置和浪费，进而使前期吸引的资本支撑难以为继。
