1、及时捡蛋。
种鸭的产蛋时间在凌晨2：00～5：00，种蛋产出后，受高温和蚊蝇的影响，附着在蛋壳上的细菌迅速繁殖，通过蛋壳气孔进入蛋内影响孵化率。因此，夏季应增加捡蛋次数，捡蛋间隔不超过2小时，对捡好的种蛋切不可立即用稻草或谷壳等作铺垫装箱，应将捡好的种蛋放置在捡蛋箱中，放在阴凉处，盖上一层纱布以防蚊蝇，有条件的可用电风扇对蛋壳表面降温，在种蛋凉透后即可装箱。
2、贮存温度。
种蛋保存的最适温度为15℃，变动范围在12～18℃。贮存温度因贮存时间而随时调节，一般采取变温保存。试验证实，如果种蛋贮存时间较长，实行变温贮存比低温贮存可提高孵化率4%～5%。贮存期0～3天，最佳温度为17～18℃，4～7天为16～17℃，超过7天以12℃为宜。
3、贮存期。
在高温环境下保存的种蛋应不超过3天，低温贮存种蛋不应超过5天。在夏季种蛋孵化中，一般认为种蛋越新鲜越好。但实践证明，产后1天内的种蛋并不能达到最好的孵化效果，这是因为经短期贮存或未经贮存的新鲜种蛋有较高的蛋白浓度及较低的蛋白氢离子浓度(pH值)，种蛋的稠蛋白明显阻碍了孵化期间氧的利用，不利于种蛋的孵化。适当贮存使蛋白经过某种生理变化，促使稠蛋白稀释，便于孵化中蛋白液化，释放重要的胚胎养分，有利于种蛋孵化。但是，随着贮存时间的增加，蛋白pH值逐渐升高，种蛋失重增加，胎盘出现衰竭，导致孵化中死胚增加。另外，如果种蛋贮存期较长应注意翻蛋。
4、运蛋。
种蛋在运输中应避免烈日直射、防止雨淋和避免剧烈震动。
5、做好孵前的清洗消毒工作。
刚产出的鸭蛋外壳上有100-300个细菌，1小时后达到5000-6000个，尤其在高温季节细菌繁殖快，容易经蛋壳上的气孔进入蛋内，造成污染，如不消毒势必影响孵化。消毒方法可选用0.02%高锰酸钾或5%新洁尔灭溶液，用40°左右的温水配制洗涤种蛋，晾后入孵，消毒液要经常更换，现配现用，也可选用福尔马林熏蒸消毒，每立方米用福尔马林28毫升，高锰酸钾14克，熏蒸20分钟，然后打开门窗，尽快将气体排除。
