深港通推出有一個較滬港通略有不同的後發與地緣優勢，因為深圳與香港在地理位置上相互毗鄰，兩地包括物流、信息流、資金流、投資觀念等方面都存在著非常緊密的聯繫，預計深港通推出後對兩地在信息、資金流動、外匯結算等方面會有更多正向促進作用。
繼滬港通推出將近20個月之後，深港通也在各方的期待、呼喚以及決策層推動佈置之下正式落地，表明了（A股）人民幣普通資本市場繼續運行在對外開放的軌道之上。
與滬港通推出有所不同的是，深港通醞釀推出於人民幣普通資本非理性大幅波動之後的歷史背景下，市場情緒傷痛尚未完全解除，人們擔心人民幣普通資本市場開放會否因此放緩腳步。深港通的推出以行動進行了回答，非正常的事件性衝擊並不會拖延中國資本市場有序開放的步伐。
作為開放行動與製度變革的延續，與滬港通一樣，深港通的推出對內地與香港資本市場均形成利好，這一點是確定無疑的。
利好效應體現在以下幾個方面：一是深港通推出將拓寬內地與香港投資者的有效投資渠道，雙方可以互投對方設定的證券交易標的品種；二是將有利於深港兩市在證券制度建設、優化方面互相學習，尤其給深交所在完善製度基礎建設、交易機制、市場監管、市場創新等方面提供了更多學習借鑒契機。對內地市場而言，深港通啟動在市場開放、投資理念與行為、跨境資金流動、匯市流動以及人民幣進一步走向國際化等等方面，均將產生直接影響。
而深港通推出有一個較滬港通略有不同的後發與地緣優勢，因為深圳與香港在地理位置上相互毗鄰，兩地包括物流、信息流、資金流、投資觀念等方面都存在著非常緊密的聯繫，預計深港通推出後對兩地在信息、資金流動、外匯結算等方面會有更多正向促進作用。這種促進可以推動兩地在金融、法律、交易與外匯結算等眾多方面更好地進行融合合作，推動內地與香港兩地投資、貿易與經濟各個層面的融合發展。
對市場投資而言，深港通推出最直接受益的標的品種是估值相對較低的藍籌股，藍籌群體獲得更多關注，主體地位得以鞏固與強化。近期人民幣普通資本走出藍籌股“估值修復”行情，市場關注度開始出現新的變化，預示著這種影響正在現實層面展開。這種變化在宏觀經濟景氣復甦不盡人意、市場存在向下調整壓力的背景之下，對人民幣普通資本市場的穩定具有積極意義。
另一方面，由於（A股）人民幣普通資本、（H股）國企資本溢價的存在，深港通推出一般而言更有利於吸引內地資金流向低估值港股中的藍籌股。最近香港股市走勢較強，除了因“比較優勢”而處在國際市場“估值窪地”對全球資本產生的吸引力之外，對深港通推出的預期應該是另外一個重要原因。深港通的推出將因為交易隔離的部分打通而可能壓縮人民幣普通資本和國企資本的這種溢價水平。但同時也需要指出，由於市場製度與禀賦差異、匯率因素、國際資本流通差異等等各個層面的複雜原因，深港通推出短期內仍不可能完全消除人民幣普通資本與（港股）香港資本各自的差異特徵。
同時，正像滬港通推出沒有消除人民幣普通資本與國企資本溢價一樣，深港通推出預計一時也不會完全消除這一溢價。從投資角度來看，兩地投資仍需深切研究各自市場的不同禀賦特徵，需要對這一事實保持正確與清醒的認識。
“窮則變，變則通，通則達。”滬港通和深港通相繼開通後，可促進三地市場合作發展。中國三大股市實現相連，無疑具里程碑的意義。這不單大大有利港滬深金融合作與協同發展，深化彼此證劵市場的質與量，既為投資者提供了更多選擇，也為三市場引入更多活水。對內地市場而言，將香港國際市場的投資文化與監管帶入人民幣普通資本，標誌其資本市場的法制法、市場化和國際化。
在內地資本市場國際化這方面，李克強也表示，在滬港通試點成功基礎上推出深港通，標誌著中國資本市場在法制化、市場化和國際化方向上又邁出了堅實一步，具有多方面的積極意義。證監會新聞發言人張曉軍8月16日表示，深港通將進一步擴大內地與香港股票市場互聯互通的投資標的範圍和額度，滿足投資者多樣化的跨境投資以及風險管理需求，可吸引更多境外長期資金進入人民幣普通資本市場，改善人民幣普通資本市場投資者結構，促進經濟轉型升級。
對於現在的中國市場來說，香港是一個很好的平台，深圳、上海可藉助香港作為跳板躍向更廣闊的世界。在現今資本市場中，資本市場的資金流動、交易成本、流動的活躍性，是和一個國家的資本市場開放程度密切相關的，後者是前者的前提。在人民幣資本項目不開放的前提下，跨境的證券投資是不具備活力的。在人民幣匯率彈性化的前提下，中國的資本市場可展望的、可現實操作的前景是對外證券投資的自由化，未來即使是在有限度的情況下，資本市場投資也可以自由化，避免高昂的交易成本。
