在深化深港港口合作方面，將創新深港港口快速通關模式，形成自貿試驗區與香港間的直通物流大通道，努力推動深港兩地港口物流服務一體化，探索建設深港組合港。進一步加強與香港的深度對接、融合，推進深圳與香港在貨物和服務貿易、現代航運服務業、投融資等方面的更緊密合作，攜手香港形成更低成本、更高效率的國際航運中心，共同參與“一帶一路”建設。
深圳還要加快培育高端航運服務業，以港資為突破口吸引航運服務企業進駐，在廣東自貿區前海蛇口片區建設21世紀海上絲綢之路深圳國際海員中心，打造深圳航運服務總部經濟聚集區。
此外，規劃指出將進一步增進深港互信，全面加強深港物流分工與合作。以前海深港合作區為平臺，學習和借鑒香港現代物流業發展的制度經驗，實施深港物流制度、物流政策、物流標準的全面對。
