低等真菌一般指的是鞭毛菌亚门的真菌一般引起的病害为：霜霉病、疫病、猝倒病、黑胫病等，药剂有：甲霜灵、精甲霜灵、霜脲氰、霜霉威、烯酰吗啉、苯霜灵、氰霜唑等。
高等真菌包括担子菌亚门、子囊菌亚门、半知菌亚门等，防治药剂也要根据不同病害来选择，比如白粉病：三唑类杀菌剂、乙嘧酚、二氰蒽醌等；炭疽病：咪鲜胺、抑霉唑、溴菌腈等；锈病;三唑类杀菌剂；
现阶段大多数杀菌剂杀菌谱都很广，比如多菌灵、嘧菌酯、甲基硫菌灵、苯醚甲环唑等，对大多数病害都有效果。 一般情况下防治低等真菌的药剂对高等真菌无效，而防治高等真菌的药剂对低等真菌都有一定效果。