随着蔬菜栽培面积的不断扩大，轮作倒茬困难，致使土传病原菌逐年累积，多种作物患有枯萎病、黄萎病、腐皮镰孢根腐病、根结线虫病等土传病害。这些土传病害极难根治，危害作物正常生长，严重制约了蔬菜的增产增收。
1.石灰氮 学名氰胺化钙，商品名有荣宝、正肥丹、庄伯伯等，是当前蔬菜生产中广泛应用的一种土壤消毒、改良剂、杀线虫剂、杀菌剂、除草剂。石灰氮在土壤中与水反应生成氰胺，这种物质能有效杀灭根结线虫、土传病菌及杂草，这是石灰氮最突出的功效。同时，它还能改良土壤，为土壤补充氮肥和钙肥。夏季6、7、8月份温度较高的时期是使用石灰氮最为合适的时期，将石灰氮均匀撒施60～80千克／亩后，用旋耕机或人工深翻入土壤中，深度30厘米为宜，尽量增大与土壤的接触面积。其具体操作如下。
①整地起高畦 按照高畦面宽60～80厘米、垄沟面20～30厘米、深30厘米做畦。畦面耙平以免划破地膜，南北做畦、东西覆膜，两头压实压严、膜与膜交错15～20厘米，做到密闭要严。
②膜下灌水 做到水灌到头即可。不可大水漫灌，做到土壤含水量在70％左右，以免水过大降低效果。
③管理 检查整个棚室是否严实，如果有破洞要及时密闭。然后进入利用石灰氮法进行土壤消毒的开始。15～20天后，先在棚室外打开放风口通风6小时以上，再进入棚内揭膜通风晾晒、消毒完成，通风或晾晒7～10天，然后播种或移苗。
④注意事项 石灰氮是强碱性氮肥，除了与土壤混合作基肥或与新鲜的有机肥、厩肥混合沤制成堆肥施入土壤中外，一般不能和铵态化肥混合使用；使用石灰氮必须要灌水、覆膜，因其在土壤中必须与水分反应才能生成具有杀菌、杀虫作用的有效成分氰胺，且其分解速度与土壤中的水分及温度有关，因此必须灌水和覆膜；在夏季地温较高的季节，使用石灰氮必须要有足够的等待期，因为它要充分分解，需要一定的时间，这样才能保证在移栽或播种作物时不产生药害。若时间不够，其在分解过程中产生气体，这种气体会对幼苗产生伤害，因此必须在移栽前揭膜通风晾晒。
2.溴甲烷 又叫溴灭泰、甲基溴、溴代甲烷等，主要用于黄瓜、番茄等作物的根线、短体、剑、毛刺等线虫病害的防治，对土壤中的一些根部病害也具有较好的防治效果。是一种广谱性杀线虫、杀菌和除草剂。对土壤渗透力强，但吸着性小，熏蒸后散毒较快。使用溴甲烷前要清除所有的残存作物秸秆及根系，深翻土壤至少30厘米，施好底肥，打碎大土块，保证土壤20厘米深处温度至少在8℃以上，温度越高，其熏蒸作用越强。并且要保证土壤湿度，原则上抓起一把土捏成团，离地1米处松开，若土团能够散开，证明水分含量合适。处理时，棚膜要覆严，保持绝对封闭。
①使用方法 每平方米用药50～75克。亩需药33～51千克，每13平方米放1罐药，药罐下垫一小块塑料布，施药时将药罐紧卡于开罐器上，隔着覆盖的棚膜，用力向下压罐，使开罐器的尖刃刺破罐，溴甲烷呈液态泻出于下垫的塑料布上，几分钟后气化。
②注意事项 溴甲烷属于剧毒化学物质，必须注意安全，使用前，要合理地掌握好使用方法，在通风期间没要严禁从事农事操作，正在消毒的地块要有明显标识，以免误耕误作发生危险。
一般情况下，使用溴甲烷处理土壤多有专业技术人员指导。但一定要注意，熏蒸15天左右，揭开薄膜通风30天以上方可种植，并且通风期间要注意防雨。
3.棉隆 相对于石灰氮和溴甲烷来说，棉隆是一种低毒的土壤消毒剂。“棉隆”又叫必速灭，是一种高效、低毒、无残留的环保型广谱性综合土壤熏蒸消毒剂。施用于潮湿的土壤中时，会产生一种异硫氰酸甲酯气体，迅速扩散至土壤颗粒间，有效地杀灭土壤中各种线虫、病原菌、地下害虫及杂草种子，从而达到清洁土壤、疏松活化土壤的效果。其剂型有50％、80％的可湿性粉剂，85％的粉剂，98％～100％微粒剂等，使用中以98％的微粒剂最为常见。
经过棉隆消毒处理过的土壤，可使作物健康地生长，从而提高产量，增强对病害的抵抗力；由于棉隆对各种病原菌、线虫均有杀灭效果，因此特别适用于常年连茬种植的土壤消毒。但是跟以上两种土壤消毒剂一样，其操作过程也非常严密，操作时的流程不规范，都会导致土壤的处理效果。其使用方法如下。
①整地要细 使用棉隆前，先用人工进行深翻（约30厘米），再用旋耕机进行翻耕，使土壤颗粒细小而均匀。
②土壤湿度要适中 要保持土壤湿度40％～60％。若遇连续晴朗天气，棚内湿度若达不到40％～60％就需要提前灌地，保持土壤湿润。浇水保湿3～4天(湿度以手捏土能成团，1米高度掉地后能散开为标准)，以便让线虫和病原菌及草籽萌动，更容易被棉隆气体杀死。湿度太小(40％以下)，棉隆的颗粒不能完全分解，湿度太大(70％以上)不利于棉隆气体在土壤颗粒间流动，土壤黏脚，黏旋耕犁，不利于田间操作，效果会很差。
③施药时一定要均匀 将土杂粪（鸡鸭粪、猪牛羊粪等）撒入棚中，然后用旋耕机均匀打一遍地（将粪中的病原菌一起熏蒸杀死）。将棉隆15～35千克均匀撒施在土壤中，然后再用旋耕机再次打匀。
④施药方法 根据不同需要有全地撒施、沟施、条施等，每处理25厘米深度土壤所需剂量为30～45克／平方米，土传病虫害严重时用高剂量，轻则用低剂量。为避免土壤受二次感染，鸡粪等农家肥一定要在消毒前加入，因为棉隆具有灭生性的原理，所以生物药肥不能同时使用，施药后马上用旋耕机混均土壤，深度为20～30厘米，使药剂与土壤粒子接触，温室、大棚内使用要确保立柱和边角用药到位。
⑤使用正确的塑料布 覆盖的塑料布不能太薄，用0.04毫米以上的膜进行覆盖，开沟压膜。旋耕混土后立即覆盖不透气的塑料膜，用开沟压边法（内侧压土）密封好四边，密封消毒数天，从开始旋耕到盖膜结束时间越短越好，最好在2～3小时内完成，减少有效成分挥发，因为棉隆遇水分解的气体比重为0.83，是由下往上跑的，所以塑料膜不能有破损，否则会降低药效。
⑥保持一定的覆盖时间 盖好后，密封保存12天以上。
⑦完成后确保敞气时间，保证无残留药害 揭去薄膜，按同一深度30厘米进行松土，透气一星期，再取土做安全发芽试验，安全后才可再进行育苗。