不知道大家有没有注意到，有的农产品开具的发票是免税的，有的农产品开具的发票是9%税率的，这是为什么呢？是发票开错了吗？我们一起来学习一下吧~
1.从事蔬菜批发、零售的纳税人销售蔬菜免征增值税
2.从事农产品批发、零售环节销售部分鲜活肉蛋产品免征增值税。
3.农业生产者销售自产初级农产品免征增值税（农业生产者包括企业、农民专业合作社、个体工商户、自然人）
4.农民专业合作社销售本社成员生产的农产品免征增值税
5.采取“公司+农户”（即公司与农户签订委托养殖合同，向农户提供畜禽苗、饲料、兽药及疫苗等(所有权属于公司)，农户饲养畜禽苗至成品后交付公司回收，公司将回收的成品畜禽用于销售。）的经营模式回收再销售农产品免征增值税
6.进口种子种源免征进口环节增值税，生产销售有机肥免征增值税，生产销售农膜免征增值税，批发零售种子、种苗、农药、农机免征增值税，农业服务免征增值税 。
提醒：除了上述情况，一般纳税人流通环节销售农产品增值税适用税率为9%。
上面有说，销售农产品可以享受免税，（《增值税暂行条例》第十五条规定，农业生产者销售的自产农产品免征增值税。）既然有免税政策，销售方当然就没法给购买方开专票，那购买方怎么抵扣呢？针对这种免税的发票，这个时候购买方的抵扣凭证有两种，一种是农产品销售发票，一种是农产品收购发票。
1.农产品销售发票（购买方从销售方取得的）
如图所示：
2.农产品收购发票（购买方开具）
如图所示
3.从流通环节购进农产品
（1）比如说购买方在市场购买的，在超市购买的，这些都是在流通环节，也就是批发零售环节购进的。
这种理论上也是很简单的，那就是别人给你开专票，购买方可以抵扣，销售方不开专票购买方就没法抵扣。（如图所示）
（2）特殊情况
这里有个特殊的，那就从小规模纳税人（流通环节非生产环节也可以）手里取得其自开或者代开的3%专票，可以按照票面金额的9%进行抵扣，而不是以发票票面的税额抵扣。
如果是从小规模纳税人购买，它销售农产品给您代开了征收率为3%的专票含税价103块，即，金额为103÷（1+3%）=100元，税额为100×3%=3元。
取得这张专票以后，不是按照票面注明的税额3元抵扣，而是按照票面金额100元乘以9%计算抵扣，即税额为9元。
4.进口的农产品
进口农产品抵扣就很简单，取得海关缴款书，按照缴款书上的税额抵扣。
总结：在凭票抵扣政策下，如果拿到一张农产品的发票，首先看票面是不是免税，如果是免税，又需要进一步看看是否是自产免税，如果是，那可以抵扣，如果是流通环节的比如蔬菜、鲜活肉类免税，那不能抵扣。
对于专票一定是可以抵扣的，具体抵扣方法要看税率，3%税率的，比照销售发票计算抵扣；9%税率的，凭票载税额抵扣。（如图所示）
还需要注意：财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号规定纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。
1.用发票、海关缴款书都可以直接在抵扣勾选模块进行勾选，如图所示：
2.自产农产品销售发票（从税控系统获得的普票），从小规模处（自产或流通）购进的3%农产品专票，需要在【待处理农产品发票】-【自产农产品发票】模块功能处理后再进行勾选，如下图所示：
3.加计勾选：
只有已归类为农产品深加工企业才能使用该模块，且当月归类，次月生效。对于农产品深加工企业，在实际生产领用时，可加计扣除1%。点击【农产品加计扣除勾选】，“勾选状态”选择【未勾选】，根据需要输入或选择相关查询条件，点击【查询】。
如可加计扣除，在“是否用于增值税加计扣除”栏次，选择【用于加计】，填写【本次加计扣除税额】，点击【提交勾选】，根据提示信息核对数据，如无误，点击【确认】，即完成操作。如图所示：
综上，关于一般纳税人农产品涉税问题，你学会了吗？
