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河北省重点研发计划|河北科技大学仪宏、张春晓:理性设计提高Blautia wexlerae的D-阿洛酮糖-3-差向异构酶热稳定性

河北省重点研发计划|河北科技大学仪宏、张春晓:理性设计提高Blautia wexlerae的D-阿洛酮糖-3-差向异构酶热稳定性 食品工业科技编辑部
2025-11-12
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本文获河北省重点研发计划项目(21372802D);石家庄市科技计划项目(241490182A);河北省发酵技术创新中心开放科研课题(重点类)。



河北科技大学食品与生物学院冉凯旋,  荀明强,林凯欣,  付育,  王丽丽,  张春晓,仪宏等人重点介绍了D-阿洛酮糖的特性、应用价值及生物合成方法。D-阿洛酮糖是一种低热量稀有单糖,具有降血糖等健康功效,作为蔗糖替代品在全球市场快速增长。其生物合成主要依赖D-阿洛酮糖-3-差向异构酶(DPE)催化果糖异构化,但现有DPE在工业条件下的热稳定性和耐酸性不足。本章提出通过理性设计改造一种新型来源于人体益生菌的DPE(WP_008708169.1),旨在提高其热稳定性,为工业应用和益生菌功能研究提供新思路。



摘要:为开发新的热稳定性高的D-阿洛酮糖-3-差向异构酶,本研究对肠道益生菌Blautia wexlerae基因组进行挖掘,对疑似D-阿洛酮糖-3-差向异构酶基因在枯草芽孢杆菌中进行表达,应用高效液相色谱鉴定表达蛋白功能,通过理性设计提高该蛋白热稳定性。结果表明,B. wexlerae 糖磷酸异构酶基因具有D-阿洛酮糖-3-差向异构酶(DPE)功能,最适温度60 ℃,最适pH7.0,转化率27.1%±1.1%;突变体DPE(H283A)最适温度较野生型提高5 ℃,70 ℃下半衰期为30 min,较野生型半衰期延长10 min,转化率达30.6%±2.6%,较野生型提高3.5%。本研究挖掘并鉴定了B. wexlerae D-阿洛酮糖-3-差向异构酶,理性设计获得了热稳定性和酶活力均提高的突变体DPE(H283A)。   


PART.01
结果

1. 酶功能验证:通过序列比对(相似性>50%)和HPLC实验证实糖磷酸异构酶(WP_008708169.1)具有D-阿洛酮糖-3-差向异构酶(DPE)活性,可催化D-果糖转化为D-阿洛酮糖。 

2. 理性设计提高热稳定性:联合Consensus Finder、Fireprot等软件预测35个突变位点,筛选出3个潜在稳定突变体(N130R、C269A、H283A)。分子动力学模拟(RMSD、Rg、RMSF)显示C269A和H283A突变体构象更稳定,其中H283A因新增氢键显著提升热稳定性。 

3. 实验验证:突变体H283A最适温度提升至65℃,半衰期延长至30分钟(野生型20分钟),且在45–65℃保持80%以上酶活。H283A转化率提高3.5%(达30.6%),同时增强催化活性与热稳定性。 

4. 工业适用性:该酶在pH6.0–7.0和Co²⁺/Mn²⁺存在时活性较高,适合工业环境。 

5. 方法优势:理性设计结合计算分析有效减少实验工作量,优于传统易错PCR等高通量筛选方法。

图 1    比对不同来源的 D-阿洛酮糖-3-差向异构酶氨基酸序列

Fig.1    Alignment of D-psicose-3-epimerase amino acid sequences from different sources

注:黑色、粉色、蓝色阴影氨基酸同源性为分别为 100%、75% 和 50%;菌株 A 为 Agrobacterium tumefaciens,菌株 B 为P. cichorii,菌株 C 为 R. cellulolyticum H10,菌株 D 为 E. bolteae ATCC BAA-613。


图 2    B. wexlerae 糖磷酸异构酶在枯草芽孢杆菌中的表达

Fig.2    Expression of B. wexlerae glycophosphate isomerase in Bacillus subtilis

注:A:M:蛋白标准分子量;泳道 1 为 B. subtilis(pWB980);泳道 2 为 B. subtilis(pWB-DPE);B:M:蛋白标准分子量;泳道1 为野生型 DPE。

图 3    B. wexlerae DPE 反应液 HPLC 结果

Fig.3    HPLC results of B.wexlerae DPE reaction

注:A:D-果糖标准品;B:D-阿洛酮糖标准品;C:B. wexlerae DPE 反应液。


表 3    DPE 突变体预测结果

Table 3    Prediction results of DPE mutants


图 4    D-阿洛酮糖-3-差向异构酶及突变体的 RMSD预测结果

Fig.4    RMSD prediction results of D-psicose-3-epimerase and mutants

图 5    D-阿洛酮糖-3-差向异构酶及突变体的 Rg 预测结果

Fig.5    Rg prediction results of D-psicose-3-epimerase and mutants

图 6    D-阿洛酮糖-3-差向异构酶及突变体的 RMSF 结果

Fig.6    RMSF results of D-psicose-3-epimerase and mutants

图 7    D-阿洛酮糖-3-差向异构酶突变体 SDS-PAGE电泳结果

Fig.7    Results of SDS-PAGE electrophoresis of D-psicose-3-epimerase mutants

注:M:蛋白标准分子量;泳道 1 为 B. subtilis(pWB980);泳道 2为 B. subtilis(pWB-DPE(C269A));泳道 3 为 B. subtilis(pWBDPE(H283A))。

图 8    DPE 野生型及突变体的酶学性质

Fig.8    Enzymatic properties of D-psicose-3-epimerase and its mutants at different temperatures

注:A:温度的影响;B:热稳定性;C:pH 的影响。

图 9    B. wexlerae DPE(WT)与 DPE(H283A)三维结构

Fig.9    3D structure of B. wexlerae DPE (WT) and DPE (H283A)

注:A:DPE(WT);B:DPE(H283A)。


表 4    金属离子对酶活性的影响(%)

Table 4    Effects of metal ions on enzyme activity (%)


PART.02
结论
1. 发现糖磷酸异构酶(WP_008708169.1)具有D-阿洛酮糖-3-差向异构酶功能。 
2. 建立基于序列保守性和分子动力学的理性设计方法,成功获得热稳定性和酶活力提升的突变体DPE(H283A)。 
3. 该方法可为其他酶的热稳定性改造提供参考。 
4. 突变体DPE(H283A)耐高温和弱酸性环境,为工业制备D-阿洛酮糖奠定基础。


PART.03

思维导图


引用本文:冉凯旋,荀明强,林凯欣,等.  理性设计提高Blautia wexlerae的D-阿洛酮糖-3-差向异构酶热稳定性[J]. 食品工业科技,2025,46(20):192−201. doi:  10.13386/j.issn1002-0306.2024110014.


Citation:RAN Kaixuan, XUN Mingqiang, LIN Kaixin, et al. Rational Design to Improve D-Psicose-3-epimerase Thermal Stability of Blautia wexlerae[J]. Science and Technology of Food Industry, 2025, 46(20): 192−201. (in Chinese with English abstract). doi:  10.13386/j.issn1002-0306.2024110014.


通信作者简介



仪宏现任河北科技大学食品与生物学院教师,教授,硕士生导师,石家庄市人民政府智库特聘专家。工作30余年,致力于工业微生物、生物制造、合成生物学相关研究,在“十五”至“十二五”期间从事抗生素与维生素、厌氧发酵、液固分离等细分领域的研发与产业转化,“十三五”以后,致力于基因编辑、基因组防御等底层技术研究。主持承担多次科技部及河北省科技厅重点课题,为河北科技大学引入研究经费超过1000万元。科研成果转化后为企业和社会带来几千万经济效益。



张春晓现任河北科技大学食品与生物学院教师,副教授,硕士生导师;河北省微生物学会会员;《生物学基础实验》虚拟教研室课程建设委员会会员。主要研究方向:酶工程、微生物代谢工程、植物组织培养。参研国家级项目5项,主持省级项目1项、参研2项;主持横向课题2项。在国内外期刊发表学术论文和科研论文30余篇,其中1篇被SCI收录,4篇被EI收录;授权专利2件。





(以上信息来自河北科技大学官网




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