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前沿 | 默克Merck/南京大学任鑫坤Nature Chemistry | 生物催化

前沿 | 默克Merck/南京大学任鑫坤Nature Chemistry | 生物催化 两江科技评论
2024-02-21
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导读:工程酶的催化作用,为活性药物制剂生产,提供了更有效的路径。然而,生物催化协助早期药物发现活动的潜力,在很大程度上仍未得到开发。

来源:今日新材料

工程酶的催化作用,为活性药物制剂生产,提供了更有效的路径。然而,生物催化协助早期药物发现活动的潜力,在很大程度上仍未得到开发。

近日,美国默克公司(Merck)David A. Vargas(一作)等,南京大学任鑫坤Xinkun Ren(一作),加利福尼亚大学(University of California)Arkajyoti Sengupta(一作),K. N. Houk等,德克萨斯大学达拉斯分校(The University of Texas at Dallas) Rudi Fasan等,在Nature Chemistry上发文,报道开发了一种生物催化策略,通过苯并噻吩和相关杂环的分子内环丙烷化,以构建富含sp3-的多环化合物。

还开发了两种具有互补区域异构体选择性的卡宾转移酶,以催化在杂环C2或C3位带有重氮酯基团苯并噻吩底物的立体选择性环化。通过晶体学和计算分析的结合,阐明了这些反应的详细机理。

利用这些见解,其中生物催化剂的底物范围,可以扩大到包括以前不反应的底物,突出了整合进化和理性策略的价值,以开发用于新的自然转化酶。这种分子支架具有三维和立体化学复杂性与“三个规则rule-of-three”特性的组合,这将对于基于片段的药物发现活动,非常有价值。

Biocatalytic strategy for the construction of sp3-rich polycyclic compounds from directed evolution and computational modelling.
基于定向进化和计算建模,构建了富含sp3多环化合物的生物催化策略。
图1: 在基于片段的药物发现fragment-based drug discovery,FBDD中,应用的sp2-与富含sp3-分子“片段”。

图2: 苯并噻吩底物的生物催化分子内环烷化。


图3: 肌红蛋白myoglobin生物催化剂促进的分子内环丙烷化反应。

文献链接
Vargas, D.A., Ren, X., Sengupta, A. et al. Biocatalytic strategy for the construction of sp3-rich polycyclic compounds from directed evolution and computational modelling. Nat. Chem. (2024). 
https://doi.org/10.1038/s41557-023-01435-3
https://www.nature.com/articles/s41557-023-01435-3
本文译自Nature。

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