氨基酸作为构成蛋白质的最小分子存在于肥料中，有易于被作物吸收的特点；亦有提高施肥对象抗病性，改善施肥作物品质的功能。补充植物必需的氨基酸，刺激和调节植物快速生长，促使植物生长健壮，促进对营养物质的吸收。增强植物的代谢功能，提高光合作用，促进植物根系发达，加快植物生长繁殖。
氨基酸中的甘氨酸它可以增加植物叶绿素的含量，促进作物对二氧化碳的吸收利用，为光合作用增加动力，使光合作用更加旺盛。
氨基酸混合肥效作用高于等氮量的单种氨基酸，也高于等氮量的无机氮肥。大量氨基酸以它的叠加效应提高了养分的利用率。
氨基酸肥料中的氨基酸可以为植物的各个器官直接吸收，在光合作用下被动吸收或渗透吸收，使用后短期内即可观察到明显效果同时可促进作物的早熟、缩短生长周期。
丰富的氨基酸种类可以提高农作物品质。如粮食蛋白质含量增加3%，棉花花绒质好，纤维长；蔬菜适口性好，味道纯正鲜美 粗纤维减少 花卉花期长 花色鲜艳 香气浓郁 瓜果类果大 色好 糖份增加 可食部分多 耐贮性好 而且转换效益显著。
氨基酸肥料施在地里的肥料无残留，能够改善土壤理化性状、提高保水保肥力和透气性能，起到养护、熟化、改良土壤的作用。
氨基酸被作物吸收后，可强化其生理生化功能。作物茎杆粗壮，叶片增厚，叶面积扩大，干物质形成和积累加快作物能够提早成熟也由于自身活力增强抗寒抗旱、抗干热风、抗病虫害抗倒伏性能提高，从而实现稳产高产。
氨基酸对作物的根系发育有特殊的促进作用，许多农科人员称氨基酸为“根系肥料”，对根系的影响主要表现在，刺激根端分生组织细胞的分裂与增长，使幼苗发根快，次生根增多，根量增加，根系伸长，最终导致作物吸收水份和养份的能力大大增强。
在养份供应充足的基础上，氨基酸的刺激作用可使植株地上部分营养体生长旺盛，表现在株高、茎粗、叶片数、干物质积累等方面。
氨基酸对不同作物的产量、构成因素是不同的，对粮食作物，穗多、粒多、千粒重等起到增产作用，前期对分蘖、减少空秕率均有良好的效果。 氨基酸对作物生理代谢及酶活动的影响
氨基酸进入植物体内后，对植物起到刺激作用，主要表现在，呼吸强度的增加，光合作用的增加，各种酶的活动增强，从而使果实提前着色成熟，取得高产、提高产值。
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